Protein–RNA interactions for Protein: P57080

Usp25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, mousemouse

Predictions only

Length 1,055 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp25P57080 AC125328.1-201ENSMUST00000226812 2265 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Usp25P57080 Olfr286-201ENSMUST00000073612 3821 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Usp25P57080 Gm42763-201ENSMUST00000199595 2087 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Usp25P57080 9930038B18Rik-201ENSMUST00000151816 3966 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Usp25P57080 Hormad1-201ENSMUST00000029754 1385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Usp25P57080 Rnf219-201ENSMUST00000022716 3420 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Usp25P57080 Vmn1r181-203ENSMUST00000226978 4371 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp25P57080 Gm31805-201ENSMUST00000211921 4031 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp25P57080 Vmn1r188-202ENSMUST00000226680 8374 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp25P57080 Foxp1-206ENSMUST00000113326 7029 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp25P57080 Cfap57-202ENSMUST00000081921 3750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp25P57080 Kat6a-202ENSMUST00000110696 9041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp25P57080 Gm5886-203ENSMUST00000203983 2613 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp25P57080 Gm14548-201ENSMUST00000070639 2128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp25P57080 Gm43864-201ENSMUST00000204452 4028 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp25P57080 AC156163.1-201ENSMUST00000215598 3369 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp25P57080 Ckap5-202ENSMUST00000099716 6574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp25P57080 Gm10377-201ENSMUST00000100695 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp25P57080 Ighv1-53-201ENSMUST00000103523 351 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp25P57080 Ighv1-69-201ENSMUST00000103539 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp25P57080 Gm3676-201ENSMUST00000111869 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp25P57080 Gm3543-201ENSMUST00000111870 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp25P57080 Plac1-202ENSMUST00000114843 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp25P57080 Gm12306-201ENSMUST00000117256 171 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp25P57080 Gm15129-201ENSMUST00000119673 279 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp25P57080 2610204G07Rik-201ENSMUST00000131215 992 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp25P57080 Gm11626-201ENSMUST00000142107 333 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp25P57080 Gm11816-202ENSMUST00000149848 714 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp25P57080 Gm11940-201ENSMUST00000153599 417 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp25P57080 Gm23673-201ENSMUST00000157474 298 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp25P57080 Polr3g-204ENSMUST00000161920 733 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp25P57080 Gm17047-201ENSMUST00000167709 430 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp25P57080 Gm3573-201ENSMUST00000168673 898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp25P57080 Gm10376-202ENSMUST00000169756 900 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp25P57080 Gm20429-202ENSMUST00000174168 820 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp25P57080 Vmn2r-ps86-201ENSMUST00000174812 871 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp25P57080 1700120O09Rik-201ENSMUST00000177127 977 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp25P57080 Gm2888-202ENSMUST00000178577 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp25P57080 n-R5s93-201ENSMUST00000180091 119 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp25P57080 Gm29470-201ENSMUST00000188007 696 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp25P57080 Gm38256-201ENSMUST00000192097 950 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp25P57080 Gm42640-201ENSMUST00000199792 1195 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp25P57080 Gm43108-201ENSMUST00000200525 293 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp25P57080 Gm44380-201ENSMUST00000203125 293 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp25P57080 Gm5305-201ENSMUST00000204010 746 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp25P57080 4930417O13Rik-204ENSMUST00000205000 999 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp25P57080 Gm44044-201ENSMUST00000205178 1089 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp25P57080 Gm33248-201ENSMUST00000205836 617 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp25P57080 Gm39158-201ENSMUST00000210178 856 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp25P57080 Gm45319-201ENSMUST00000210220 318 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp25P57080 Gm2774-201ENSMUST00000213650 1165 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp25P57080 AC151901.1-201ENSMUST00000218274 180 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp25P57080 Gm19169-201ENSMUST00000220109 1246 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp25P57080 Gm18503-201ENSMUST00000220340 728 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp25P57080 AC080021.1-201ENSMUST00000228104 700 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp25P57080 F730035P03Rik-201ENSMUST00000065741 917 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp25P57080 Tial1-211ENSMUST00000165023 2003 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp25P57080 Gm38178-201ENSMUST00000194502 2471 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp25P57080 Tcf7-201ENSMUST00000086844 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp25P57080 Agl-203ENSMUST00000159742 4344 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp25P57080 Vmn2r-ps21-201ENSMUST00000177115 2947 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp25P57080 Trove2-202ENSMUST00000159879 8738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp25P57080 Zfp976-201ENSMUST00000098503 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp25P57080 Vmn2r-ps54-205ENSMUST00000182110 2587 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp25P57080 Zfp748-202ENSMUST00000181892 5293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp25P57080 Alpk2-201ENSMUST00000035548 7249 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp25P57080 Vmn1r220-202ENSMUST00000226651 6252 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp25P57080 Tlr11-201ENSMUST00000063570 2993 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp25P57080 Olfr195-202ENSMUST00000216957 2077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp25P57080 Gm38081-201ENSMUST00000192680 1645 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp25P57080 5033425B01Rik-201ENSMUST00000213948 1303 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp25P57080 Gria3-202ENSMUST00000115103 3081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp25P57080 Atf2-206ENSMUST00000112016 3943 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp25P57080 Matr3-205ENSMUST00000186796 1854 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp25P57080 Clca4a-201ENSMUST00000029923 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp25P57080 Fundc2-201ENSMUST00000033541 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp25P57080 Trappc1-202ENSMUST00000102601 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp25P57080 Igkv2-137-201ENSMUST00000103302 501 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp25P57080 Gm26079-201ENSMUST00000104066 133 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp25P57080 Gm14279-201ENSMUST00000117142 332 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp25P57080 Rpl35a-ps2-201ENSMUST00000117444 333 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp25P57080 Gm10243-201ENSMUST00000117571 333 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp25P57080 Gm11926-201ENSMUST00000118520 430 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp25P57080 Gm12331-201ENSMUST00000119927 622 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp25P57080 Gm12879-201ENSMUST00000120003 1182 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp25P57080 Rpl35a-ps4-201ENSMUST00000121779 333 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp25P57080 Gm12665-201ENSMUST00000126063 541 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp25P57080 Gm13362-201ENSMUST00000137186 839 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp25P57080 Rpl35a-ps3-201ENSMUST00000147311 333 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp25P57080 Gm15642-201ENSMUST00000148057 311 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp25P57080 Rpl35a-ps6-201ENSMUST00000148282 333 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp25P57080 Gm11840-201ENSMUST00000156947 696 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp25P57080 Gm22764-201ENSMUST00000158370 92 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp25P57080 Spink10-205ENSMUST00000162365 1076 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp25P57080 Lrmda-206ENSMUST00000162540 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp25P57080 Gm7420-201ENSMUST00000162836 842 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp25P57080 Gm6726-201ENSMUST00000172786 681 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp25P57080 Gm3585-201ENSMUST00000173438 875 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp25P57080 Mir7084-201ENSMUST00000183876 70 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp25P57080 Gm28991-201ENSMUST00000186584 543 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.8 ms