Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Gm13130-201ENSMUST00000119195 1166 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 Gm12720-201ENSMUST00000123834 472 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 Gm22116-201ENSMUST00000158791 141 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 Speer4cos-201ENSMUST00000162113 1083 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 Slc25a5-ps-201ENSMUST00000162199 826 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 Gm22698-201ENSMUST00000175375 108 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 Gm5147-201ENSMUST00000185999 794 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 Gm18342-201ENSMUST00000186987 694 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 Gm20561-201ENSMUST00000188131 292 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 Scgb2b8-ps-201ENSMUST00000188661 327 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 Gm2427-201ENSMUST00000189121 881 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 1700034P13Rik-204ENSMUST00000189431 555 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 A430093F15Rik-206ENSMUST00000189565 651 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 Scgb2b13-ps-201ENSMUST00000190420 328 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 Gm36928-201ENSMUST00000192466 694 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 Gm36935-201ENSMUST00000192526 292 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 Gm37325-201ENSMUST00000194971 694 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 Gm43391-201ENSMUST00000196145 883 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 Gm31831-201ENSMUST00000196240 684 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 Gm21847-202ENSMUST00000198681 883 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 Gm44566-201ENSMUST00000207638 304 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 Gm44982-201ENSMUST00000208795 471 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 Gm45666-201ENSMUST00000211474 277 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 Gm29154-253ENSMUST00000217229 1207 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 Gm2398-201ENSMUST00000218347 883 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 AC131654.1-201ENSMUST00000219675 745 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 CT030182.4-201ENSMUST00000223647 645 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 AC154573.2-201ENSMUST00000224174 378 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 AC124450.1-201ENSMUST00000225569 495 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 n-R5s97-201ENSMUST00000082585 113 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 Mir138-2-201ENSMUST00000083578 71 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 Olfr1416-201ENSMUST00000086837 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 Pde1a-202ENSMUST00000102651 1673 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 Pde1a-201ENSMUST00000090756 1661 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 Olfr1238-202ENSMUST00000217226 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 Cfap61-207ENSMUST00000138774 3308 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 Tmem56-201ENSMUST00000029777 6248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 Nme7-202ENSMUST00000191947 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 Tshr-204ENSMUST00000221216 1638 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 Vmn1r44-210ENSMUST00000227747 1811 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 Gm29438-201ENSMUST00000191298 2613 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 Zfp2-202ENSMUST00000109129 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 Nlrp4a-202ENSMUST00000119386 3215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 Iqch-202ENSMUST00000080527 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
Sh3bp1P55194 Olfr104-ps-201ENSMUST00000178766 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.2
Sh3bp1P55194 Gm37530-201ENSMUST00000191759 4932 ntBASIC7.59□□□□□ -1.2
Sh3bp1P55194 Arf4-202ENSMUST00000112318 1367 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.2
Sh3bp1P55194 Ncoa2-203ENSMUST00000081713 8171 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Sh3bp1P55194 Elovl2-201ENSMUST00000021793 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Sh3bp1P55194 Ptprz1-204ENSMUST00000202102 4947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Sh3bp1P55194 Gm6902-201ENSMUST00000179072 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Sh3bp1P55194 Gm45793-201ENSMUST00000207900 1342 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Sh3bp1P55194 Lilrb4a-201ENSMUST00000217706 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Sh3bp1P55194 Trip12-206ENSMUST00000186465 9590 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Sh3bp1P55194 Kat6a-201ENSMUST00000044331 9113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Sh3bp1P55194 Kcnj16-201ENSMUST00000106635 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Sh3bp1P55194 AW551984-202ENSMUST00000119722 4224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Sh3bp1P55194 Fancl-202ENSMUST00000109509 1187 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Sh3bp1P55194 Gm15217-201ENSMUST00000111826 733 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Sh3bp1P55194 Gm13546-201ENSMUST00000135735 401 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Sh3bp1P55194 Gm13362-201ENSMUST00000137186 839 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
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Sh3bp1P55194 Gm16027-201ENSMUST00000161618 758 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Sh3bp1P55194 Gm8715-201ENSMUST00000162728 531 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
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Sh3bp1P55194 C430002N11Rik-202ENSMUST00000189067 1029 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Sh3bp1P55194 Krtdap-205ENSMUST00000189673 345 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
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Sh3bp1P55194 Krtdap-209ENSMUST00000190990 403 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Sh3bp1P55194 9430087B13Rik-201ENSMUST00000196548 1085 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
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Sh3bp1P55194 AC155834.1-201ENSMUST00000220033 498 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
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Sh3bp1P55194 Krtdap-201ENSMUST00000098559 470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Sh3bp1P55194 Zfp712-201ENSMUST00000167565 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Sh3bp1P55194 Rgn-201ENSMUST00000023832 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Sh3bp1P55194 Gm44704-201ENSMUST00000208963 1990 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Sh3bp1P55194 Olfr716-205ENSMUST00000214819 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Sh3bp1P55194 Gm26893-202ENSMUST00000180965 2079 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Sh3bp1P55194 Gm26552-202ENSMUST00000180980 2079 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Sh3bp1P55194 Gm42798-201ENSMUST00000200853 3972 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Sh3bp1P55194 Olfr619-202ENSMUST00000215732 1370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Sh3bp1P55194 Fam196b-201ENSMUST00000093192 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Sh3bp1P55194 Tceal1-201ENSMUST00000055104 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Sh3bp1P55194 Olfr1386-203ENSMUST00000213674 2457 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Sh3bp1P55194 Gm38394-201ENSMUST00000179598 10156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Sh3bp1P55194 Inpp4b-202ENSMUST00000109851 3906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Sh3bp1P55194 Ep400-201ENSMUST00000041558 10608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
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