Protein–RNA interactions for Protein: P53564

Cux1, Homeobox protein cut-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux1P53564 AC158388.2-201ENSMUST00000223665 1314 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Cux1P53564 Gm43618-201ENSMUST00000197392 3451 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Cux1P53564 Zfp292-202ENSMUST00000098163 9941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cux1P53564 Gp1ba-202ENSMUST00000108551 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cux1P53564 Myo3b-203ENSMUST00000112243 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cux1P53564 Gm13416-201ENSMUST00000117264 1612 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Cux1P53564 Gm38335-201ENSMUST00000195727 1789 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cux1P53564 Gm21663-201ENSMUST00000196214 2864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cux1P53564 Igkv18-36-201ENSMUST00000103373 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cux1P53564 Igkv6-23-201ENSMUST00000103386 369 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cux1P53564 Gm11624-201ENSMUST00000118579 1041 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Cux1P53564 Gm14796-201ENSMUST00000121216 959 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Cux1P53564 Klra5-201ENSMUST00000014683 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cux1P53564 Gm13179-202ENSMUST00000151994 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cux1P53564 Rpl29-ps5-201ENSMUST00000164794 477 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Cux1P53564 Gm5717-201ENSMUST00000198243 1062 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Cux1P53564 Gm44312-201ENSMUST00000203536 469 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Cux1P53564 Gm34225-203ENSMUST00000206921 572 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cux1P53564 Gm45069-201ENSMUST00000208604 317 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cux1P53564 1190001M18Rik-201ENSMUST00000215937 1270 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Cux1P53564 1700013H16Rik-201ENSMUST00000067940 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cux1P53564 Vmn1r40-201ENSMUST00000075158 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cux1P53564 Gm38811-201ENSMUST00000203781 3478 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cux1P53564 Csmd2-205ENSMUST00000184063 13555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cux1P53564 Tial1-211ENSMUST00000165023 2003 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cux1P53564 Lcp1-206ENSMUST00000131802 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cux1P53564 Atp8a1-207ENSMUST00000135930 8069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cux1P53564 Cacna1d-209ENSMUST00000224785 8041 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cux1P53564 Gm12043-201ENSMUST00000131570 2788 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cux1P53564 Trappc13-206ENSMUST00000179891 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cux1P53564 Papolg-201ENSMUST00000020513 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cux1P53564 Gm38386-201ENSMUST00000194293 3421 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Cux1P53564 Olfr1045-202ENSMUST00000215763 2960 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cux1P53564 Golgb1-202ENSMUST00000039855 10847 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cux1P53564 Pan2-203ENSMUST00000218315 4379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cux1P53564 Cebpz-201ENSMUST00000024885 4074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cux1P53564 Gm3286-202ENSMUST00000200932 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cux1P53564 Cyfip1-202ENSMUST00000085255 4195 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cux1P53564 Kdsr-201ENSMUST00000010049 5518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cux1P53564 Ighv1-53-201ENSMUST00000103523 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cux1P53564 Ighv1-69-201ENSMUST00000103539 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cux1P53564 Gm13114-201ENSMUST00000117605 106 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Cux1P53564 Gm4342-201ENSMUST00000118982 367 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Cux1P53564 Gm15959-201ENSMUST00000121724 368 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Cux1P53564 Csnk2b-207ENSMUST00000174024 883 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cux1P53564 Gm26381-201ENSMUST00000174895 92 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Cux1P53564 Gm27240-201ENSMUST00000183616 677 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cux1P53564 Gm28616-201ENSMUST00000187344 441 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cux1P53564 Gm8860-201ENSMUST00000193160 445 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Cux1P53564 Pilrb2-202ENSMUST00000196162 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cux1P53564 Gm42886-201ENSMUST00000199214 466 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Cux1P53564 4930480K02Rik-201ENSMUST00000203679 1054 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Cux1P53564 AC113125.2-201ENSMUST00000226837 362 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Cux1P53564 Olfr516-201ENSMUST00000071410 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cux1P53564 n-R5s56-201ENSMUST00000082521 105 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Cux1P53564 Smco3-201ENSMUST00000068293 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cux1P53564 Ehbp1-201ENSMUST00000045167 4821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cux1P53564 CT010577.1-202ENSMUST00000226187 1903 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Cux1P53564 Serpind1-201ENSMUST00000023450 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cux1P53564 Olfr1170-202ENSMUST00000214386 3355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cux1P53564 D630023O14Rik-201ENSMUST00000191913 3099 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Cux1P53564 Nmur2-201ENSMUST00000037682 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cux1P53564 Atl3-201ENSMUST00000025668 6376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cux1P53564 Elp2-201ENSMUST00000025120 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cux1P53564 Sorbs2-215ENSMUST00000135336 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cux1P53564 Cltc-202ENSMUST00000103186 6519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cux1P53564 Trav6-6-201ENSMUST00000103584 344 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cux1P53564 Trav6n-5-201ENSMUST00000103611 338 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cux1P53564 Gm25795-201ENSMUST00000104421 132 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Cux1P53564 Gm14173-201ENSMUST00000117690 278 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Cux1P53564 Rbpsuh-ps1-201ENSMUST00000119456 1006 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Cux1P53564 Gm16074-201ENSMUST00000119524 444 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Cux1P53564 Trav6d-7-201ENSMUST00000178650 358 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cux1P53564 Trav6n-7-201ENSMUST00000179607 358 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cux1P53564 1700023F02Rik-202ENSMUST00000188279 412 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cux1P53564 Gm28777-201ENSMUST00000191402 535 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cux1P53564 Trav6d-6-201ENSMUST00000197754 344 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cux1P53564 Gm43098-201ENSMUST00000199989 1297 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Cux1P53564 Gm17997-201ENSMUST00000211801 840 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Cux1P53564 AC154481.1-201ENSMUST00000223532 331 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Cux1P53564 AC154250.1-201ENSMUST00000224775 489 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Cux1P53564 Olfr657-201ENSMUST00000098171 960 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cux1P53564 Frem1-201ENSMUST00000071708 9307 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cux1P53564 Rassf9-202ENSMUST00000219445 5294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Cux1P53564 AL607131.1-201ENSMUST00000222575 1835 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Cux1P53564 Rdh11-203ENSMUST00000161204 3262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Cux1P53564 Sema6a-201ENSMUST00000019791 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Cux1P53564 Obox7-201ENSMUST00000069740 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cux1P53564 Trappc8-201ENSMUST00000025177 5178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cux1P53564 Sorbs2-214ENSMUST00000134675 1692 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cux1P53564 Olfr66-202ENSMUST00000216303 3080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cux1P53564 Ect2-207ENSMUST00000176242 3985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cux1P53564 Dmxl2-201ENSMUST00000118163 10614 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cux1P53564 Csnk2a1-ps-201ENSMUST00000118846 1175 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Cux1P53564 Gm13222-201ENSMUST00000119638 138 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Cux1P53564 Gm14294-201ENSMUST00000119749 751 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Cux1P53564 Gm22599-201ENSMUST00000157597 132 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Cux1P53564 Rd3l-201ENSMUST00000170525 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cux1P53564 1700120O09Rik-201ENSMUST00000177127 977 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cux1P53564 Gm9274-201ENSMUST00000182505 984 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
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