Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

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Length 422 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Plch1-210ENSMUST00000162269 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
VdrP48281 Myo6-205ENSMUST00000127779 4067 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
VdrP48281 Sos2-203ENSMUST00000182396 3963 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
VdrP48281 Gm11823-201ENSMUST00000130582 2278 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
VdrP48281 Vmn1r22-201ENSMUST00000227342 3057 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
VdrP48281 Vmn1r22-204ENSMUST00000228257 3079 ntAPPRIS P1 BASIC7.76□□□□□ -1.17
VdrP48281 Impg2-202ENSMUST00000069936 6890 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
VdrP48281 Serpina1d-201ENSMUST00000078869 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
VdrP48281 Ankrd36-202ENSMUST00000109856 4491 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.76□□□□□ -1.17
VdrP48281 Golgb1-203ENSMUST00000114812 11012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
VdrP48281 Olfr1441-202ENSMUST00000214153 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
VdrP48281 Kif20a-201ENSMUST00000166044 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
VdrP48281 Kif20a-202ENSMUST00000167161 3565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
VdrP48281 Olfr1019-201ENSMUST00000102634 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.76□□□□□ -1.17
VdrP48281 Gm12297-201ENSMUST00000121380 979 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
VdrP48281 Gm14328-201ENSMUST00000122178 408 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
VdrP48281 Gm11491-201ENSMUST00000129441 1118 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
VdrP48281 1700019G24Rik-201ENSMUST00000130004 503 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
VdrP48281 Gm12089-201ENSMUST00000138402 428 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
VdrP48281 Gm12603-202ENSMUST00000146678 618 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
VdrP48281 Gm17097-201ENSMUST00000166414 714 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
VdrP48281 Cd180-202ENSMUST00000167144 430 ntTSL 2 BASIC7.76□□□□□ -1.17
VdrP48281 Gm44-201ENSMUST00000172155 993 ntAPPRIS P1 BASIC7.76□□□□□ -1.17
VdrP48281 Gm18953-201ENSMUST00000175694 300 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
VdrP48281 Gm25525-201ENSMUST00000177701 107 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
VdrP48281 Gm26178-201ENSMUST00000177706 107 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
VdrP48281 Gm26465-201ENSMUST00000178517 107 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
VdrP48281 Gm24317-201ENSMUST00000178536 107 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
VdrP48281 Gm25021-201ENSMUST00000179184 107 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
VdrP48281 Gm22995-201ENSMUST00000179670 107 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
VdrP48281 Gm24424-201ENSMUST00000179714 107 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
VdrP48281 Gm24389-201ENSMUST00000179962 107 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
VdrP48281 Gm25672-201ENSMUST00000180111 107 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
VdrP48281 9330179D12Rik-202ENSMUST00000180811 1001 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
VdrP48281 1810007C17Rik-201ENSMUST00000187665 710 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
VdrP48281 Gm29163-201ENSMUST00000188029 107 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
VdrP48281 Gm28113-201ENSMUST00000188280 229 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
VdrP48281 Gm29141-201ENSMUST00000190357 882 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
VdrP48281 Scgb1b9-ps-201ENSMUST00000191567 266 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
VdrP48281 Gm36999-201ENSMUST00000192756 1046 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
VdrP48281 Gm37623-201ENSMUST00000193691 803 ntTSL 3 BASIC7.76□□□□□ -1.17
VdrP48281 Gm43471-201ENSMUST00000197550 467 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
VdrP48281 Zc2hc1b-201ENSMUST00000019954 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
VdrP48281 Tas2r142-ps5-201ENSMUST00000204651 929 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
VdrP48281 Klk1b14-ps-201ENSMUST00000206059 777 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
VdrP48281 Gm31897-202ENSMUST00000206231 604 ntTSL 3 BASIC7.76□□□□□ -1.17
VdrP48281 Olfr291-201ENSMUST00000211582 1159 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.76□□□□□ -1.17
VdrP48281 Gm36247-201ENSMUST00000211834 285 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
VdrP48281 Gm34005-201ENSMUST00000215834 282 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
VdrP48281 Olfr1065-203ENSMUST00000216165 992 ntAPPRIS P1 BASIC7.76□□□□□ -1.17
VdrP48281 AC134537.3-201ENSMUST00000220154 503 ntTSL 3 BASIC7.76□□□□□ -1.17
VdrP48281 Gm4120-201ENSMUST00000220456 578 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
VdrP48281 Spata9-201ENSMUST00000022081 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
VdrP48281 AC154552.5-201ENSMUST00000222352 207 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
VdrP48281 AC163041.2-201ENSMUST00000223082 573 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
VdrP48281 Zfp874a-208ENSMUST00000225479 1092 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
VdrP48281 AC124715.1-201ENSMUST00000228480 754 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
VdrP48281 Prap1-201ENSMUST00000026540 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
VdrP48281 Hist1h1t-201ENSMUST00000041052 912 ntAPPRIS P1 BASIC7.76□□□□□ -1.17
VdrP48281 Tas2r124-201ENSMUST00000076150 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.76□□□□□ -1.17
VdrP48281 Gm8394-201ENSMUST00000079684 952 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
VdrP48281 Olfr1505-201ENSMUST00000081520 1103 ntAPPRIS P1 BASIC7.76□□□□□ -1.17
VdrP48281 Olfr1280-201ENSMUST00000082167 1003 ntAPPRIS P1 BASIC7.76□□□□□ -1.17
VdrP48281 Gm23815-201ENSMUST00000083231 107 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
VdrP48281 Olfr1283-201ENSMUST00000090328 1026 ntAPPRIS P1 BASIC7.76□□□□□ -1.17
VdrP48281 Gm23520-201ENSMUST00000093736 107 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
VdrP48281 Bsph1-201ENSMUST00000098811 822 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
VdrP48281 Rgn-201ENSMUST00000023832 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
VdrP48281 Crtam-202ENSMUST00000180384 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
VdrP48281 E230015B07Rik-202ENSMUST00000159884 2822 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
VdrP48281 Nt5c1b-220ENSMUST00000223534 1798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
VdrP48281 Cd44-204ENSMUST00000111190 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
VdrP48281 Cd247-209ENSMUST00000187313 2957 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
VdrP48281 Gm20276-201ENSMUST00000216122 2648 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
VdrP48281 Zfp963-201ENSMUST00000130458 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
VdrP48281 A230001M10Rik-202ENSMUST00000196720 1307 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
VdrP48281 Grip1-204ENSMUST00000105261 3608 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
VdrP48281 Gm42514-201ENSMUST00000196636 1832 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
VdrP48281 Deup1-202ENSMUST00000115592 2918 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
VdrP48281 Lbhd1-202ENSMUST00000187504 3164 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.75□□□□□ -1.17
VdrP48281 Vmn2r-ps130-201ENSMUST00000175853 2568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
VdrP48281 Vmn2r-ps129-201ENSMUST00000177509 2568 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
VdrP48281 Gm15283-201ENSMUST00000125308 1451 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
VdrP48281 Gm36933-201ENSMUST00000194945 3071 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
VdrP48281 Olfr430-203ENSMUST00000214390 3300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
VdrP48281 Ifit3-201ENSMUST00000102825 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
VdrP48281 Gm45194-202ENSMUST00000207962 1991 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
VdrP48281 Gm37249-201ENSMUST00000195185 2869 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
VdrP48281 Gm19210-201ENSMUST00000199562 1350 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
VdrP48281 Gm43970-201ENSMUST00000204346 3605 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
VdrP48281 Calcrl-201ENSMUST00000074262 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
VdrP48281 Mbnl1-211ENSMUST00000192807 2906 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
VdrP48281 A630010A05Rik-201ENSMUST00000100165 684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
VdrP48281 Gm26012-201ENSMUST00000104411 128 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
VdrP48281 Gm3055-201ENSMUST00000105316 720 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
VdrP48281 Cep112-204ENSMUST00000106724 678 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
VdrP48281 Olfr329-ps-202ENSMUST00000108823 1060 ntAPPRIS P2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
VdrP48281 Pinlyp-201ENSMUST00000011776 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
VdrP48281 Gm11207-201ENSMUST00000117824 414 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
VdrP48281 Gm12648-201ENSMUST00000126270 656 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
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