Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 Mak-206ENSMUST00000225084 3573 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
SrprbP47758 Ankrd36-202ENSMUST00000109856 4491 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
SrprbP47758 Gm42609-201ENSMUST00000196362 3306 ntTSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
SrprbP47758 Adar-201ENSMUST00000029563 3753 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
SrprbP47758 Adam28-202ENSMUST00000111072 3025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
SrprbP47758 Vmn2r118-201ENSMUST00000168440 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
SrprbP47758 Tek-202ENSMUST00000073939 4549 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
SrprbP47758 Tnik-211ENSMUST00000161964 3807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
SrprbP47758 Zfp420-201ENSMUST00000057652 2744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
SrprbP47758 Catsperg1-201ENSMUST00000047846 3566 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
SrprbP47758 Olfr76-202ENSMUST00000213471 3109 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
SrprbP47758 Zfp263-207ENSMUST00000162207 2452 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
SrprbP47758 Clasp1-212ENSMUST00000189262 6918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
SrprbP47758 Asap1-206ENSMUST00000175799 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
SrprbP47758 Eif3e-201ENSMUST00000022960 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
SrprbP47758 Olfr517-202ENSMUST00000216500 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
SrprbP47758 Gm10735-201ENSMUST00000099162 2943 ntAPPRIS P1 BASIC7.84□□□□□ -1.15
SrprbP47758 Cenpw-202ENSMUST00000216853 4143 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
SrprbP47758 Gm6679-201ENSMUST00000191467 1869 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
SrprbP47758 Gm28173-201ENSMUST00000191190 1496 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
SrprbP47758 Gstm6-203ENSMUST00000106683 745 ntTSL 3 BASIC7.84□□□□□ -1.15
SrprbP47758 Gm13754-201ENSMUST00000120486 998 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
SrprbP47758 Gm22533-201ENSMUST00000158821 274 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
SrprbP47758 Gm4540-201ENSMUST00000170669 429 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
SrprbP47758 Gm6726-201ENSMUST00000172786 681 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
SrprbP47758 Gm22132-201ENSMUST00000175316 100 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
SrprbP47758 Odaph-201ENSMUST00000178614 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
SrprbP47758 Rps19-ps8-201ENSMUST00000180714 422 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
SrprbP47758 0610031O16Rik-204ENSMUST00000185122 825 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
SrprbP47758 Gm43774-201ENSMUST00000196327 878 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
SrprbP47758 Gm38102-202ENSMUST00000196428 174 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
SrprbP47758 1700094M23Rik-202ENSMUST00000198047 675 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
SrprbP47758 Gm19590-201ENSMUST00000201551 1195 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
SrprbP47758 Tas2r146-ps1-201ENSMUST00000203065 934 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
SrprbP47758 Gm20586-201ENSMUST00000210122 547 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
SrprbP47758 Gm45279-201ENSMUST00000210315 391 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
SrprbP47758 Gm45554-202ENSMUST00000210964 1090 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
SrprbP47758 Gm31013-201ENSMUST00000213576 715 ntTSL 3 BASIC7.84□□□□□ -1.15
SrprbP47758 AC069561.1-201ENSMUST00000213750 424 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
SrprbP47758 AC166902.2-201ENSMUST00000215193 837 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
SrprbP47758 Akr1c13-201ENSMUST00000021634 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
SrprbP47758 1700021G15Rik-201ENSMUST00000217671 528 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
SrprbP47758 Gm2398-201ENSMUST00000218347 883 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
SrprbP47758 AC164629.1-201ENSMUST00000220250 1113 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
SrprbP47758 AC158392.1-201ENSMUST00000223720 1069 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
SrprbP47758 Olfr1361-201ENSMUST00000055615 954 ntAPPRIS P1 BASIC7.84□□□□□ -1.15
SrprbP47758 Gm9961-201ENSMUST00000068397 547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
SrprbP47758 Olfr535-201ENSMUST00000074897 991 ntAPPRIS P1 BASIC7.84□□□□□ -1.15
SrprbP47758 Vmn1r216-201ENSMUST00000080253 1059 ntAPPRIS P1 BASIC7.84□□□□□ -1.15
SrprbP47758 Ssxb3-201ENSMUST00000089374 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
SrprbP47758 Cd200r4-202ENSMUST00000176321 2005 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
SrprbP47758 Olfr3-202ENSMUST00000213988 2018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
SrprbP47758 Gm26981-201ENSMUST00000182453 3169 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
SrprbP47758 Vwa3a-205ENSMUST00000167213 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
SrprbP47758 Gm29379-201ENSMUST00000186305 2166 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
SrprbP47758 Gm28276-201ENSMUST00000188508 2166 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
SrprbP47758 Gm28201-201ENSMUST00000189989 2166 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
SrprbP47758 Gm29446-201ENSMUST00000190887 2166 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
SrprbP47758 Celf2-226ENSMUST00000183209 3852 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
SrprbP47758 Nt5c1b-205ENSMUST00000217944 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
SrprbP47758 Krt222-202ENSMUST00000103132 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
SrprbP47758 Gm20768-201ENSMUST00000199527 2338 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
SrprbP47758 Synb-201ENSMUST00000059362 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
SrprbP47758 Olfr525-202ENSMUST00000214594 5137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
SrprbP47758 Skiv2l2-201ENSMUST00000022281 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
SrprbP47758 Osbpl9-214ENSMUST00000160774 2765 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
SrprbP47758 Ttll6-201ENSMUST00000107680 3485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
SrprbP47758 Gm43410-201ENSMUST00000197510 2234 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
SrprbP47758 Zfp934-209ENSMUST00000222746 2206 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
SrprbP47758 Gm28231-201ENSMUST00000190118 2599 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
SrprbP47758 AC129208.1-201ENSMUST00000227474 2906 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
SrprbP47758 Otub2-205ENSMUST00000179684 2890 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
SrprbP47758 Olfr1247-203ENSMUST00000216424 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
SrprbP47758 Sox6-210ENSMUST00000206034 8668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
SrprbP47758 P2ry14-203ENSMUST00000196081 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
SrprbP47758 Gm8281-201ENSMUST00000100893 612 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
SrprbP47758 Cdc42se1-202ENSMUST00000107199 652 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
SrprbP47758 Gm12468-201ENSMUST00000116189 404 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
SrprbP47758 Gm15933-201ENSMUST00000117215 616 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
SrprbP47758 Gm11858-201ENSMUST00000117935 838 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
SrprbP47758 Mrps36-ps2-201ENSMUST00000118658 309 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
SrprbP47758 H2-Ea-ps-201ENSMUST00000134042 686 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
SrprbP47758 Gm15407-201ENSMUST00000136919 634 ntTSL 3 BASIC7.83□□□□□ -1.16
SrprbP47758 Gm12629-201ENSMUST00000145751 711 ntTSL 3 BASIC7.83□□□□□ -1.16
SrprbP47758 Gm15902-201ENSMUST00000146949 469 ntTSL 3 BASIC7.83□□□□□ -1.16
SrprbP47758 Gm15200-201ENSMUST00000149950 410 ntTSL 2 BASIC7.83□□□□□ -1.16
SrprbP47758 Gm5861-201ENSMUST00000168407 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
SrprbP47758 Gm8922-201ENSMUST00000170057 1167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
SrprbP47758 Tnfsf10-202ENSMUST00000174840 989 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
SrprbP47758 Gm8890-202ENSMUST00000177727 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
SrprbP47758 Gm8926-202ENSMUST00000178158 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
SrprbP47758 Gm8237-202ENSMUST00000178594 447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
SrprbP47758 Gm8879-202ENSMUST00000178863 465 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
SrprbP47758 Gm8922-202ENSMUST00000178989 465 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
SrprbP47758 Speer1-202ENSMUST00000179482 465 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
SrprbP47758 Gm8897-202ENSMUST00000179679 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
SrprbP47758 1110008L16Rik-206ENSMUST00000184980 888 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
SrprbP47758 1700003P14Rik-201ENSMUST00000185602 1078 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
SrprbP47758 Gm29664-201ENSMUST00000191125 463 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
SrprbP47758 Gm37468-201ENSMUST00000194767 854 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
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