Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Tenm2-202ENSMUST00000102801 9908 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
PtprkP35822 Zfp51-201ENSMUST00000039577 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
PtprkP35822 Mir700-201ENSMUST00000102169 79 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
PtprkP35822 Gm22103-201ENSMUST00000116733 121 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
PtprkP35822 Gm26475-201ENSMUST00000116769 121 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
PtprkP35822 Gm23620-201ENSMUST00000116812 121 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
PtprkP35822 Gm25042-201ENSMUST00000116856 121 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
PtprkP35822 Gm25540-201ENSMUST00000116880 121 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
PtprkP35822 Gm13207-201ENSMUST00000119862 773 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
PtprkP35822 Mup7-203ENSMUST00000166098 1033 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
PtprkP35822 Gm21560-202ENSMUST00000177670 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
PtprkP35822 Gm3269-202ENSMUST00000178137 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
PtprkP35822 Gm3099-202ENSMUST00000178274 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
PtprkP35822 Gm23550-201ENSMUST00000179003 121 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
PtprkP35822 Gm25123-201ENSMUST00000179154 121 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
PtprkP35822 Gm3642-202ENSMUST00000179296 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
PtprkP35822 Gm25353-201ENSMUST00000179366 121 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
PtprkP35822 Gm22992-201ENSMUST00000179496 121 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
PtprkP35822 Gm3594-203ENSMUST00000179747 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
PtprkP35822 Gm25892-201ENSMUST00000179867 121 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
PtprkP35822 Gm24092-201ENSMUST00000180257 121 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
PtprkP35822 1700054K02Rik-201ENSMUST00000181755 376 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
PtprkP35822 Gm37196-201ENSMUST00000194762 906 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
PtprkP35822 Gm37358-201ENSMUST00000195492 479 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
PtprkP35822 Gm17918-201ENSMUST00000205315 574 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
PtprkP35822 Olfr162-ps1-201ENSMUST00000206015 934 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
PtprkP35822 4930452L12Rik-201ENSMUST00000220158 785 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
PtprkP35822 AC125117.2-201ENSMUST00000228344 1140 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
PtprkP35822 Mup13-202ENSMUST00000098042 984 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
PtprkP35822 Gm43618-201ENSMUST00000197392 3451 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
PtprkP35822 Ugt2a2-201ENSMUST00000079811 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
PtprkP35822 Gm12919-201ENSMUST00000119855 1594 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
PtprkP35822 4930449A18Rik-201ENSMUST00000094228 2071 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
PtprkP35822 Gm38335-201ENSMUST00000195727 1789 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
PtprkP35822 Gm46123-201ENSMUST00000217447 6424 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
PtprkP35822 Gm26981-201ENSMUST00000182453 3169 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
PtprkP35822 Atp8a1-207ENSMUST00000135930 8069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
PtprkP35822 Daam1-205ENSMUST00000223272 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
PtprkP35822 Fndc3b-204ENSMUST00000195008 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
PtprkP35822 Olfr544-201ENSMUST00000051201 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
PtprkP35822 Slc17a4-202ENSMUST00000110407 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
PtprkP35822 Med12-202ENSMUST00000087956 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
PtprkP35822 Gm28112-201ENSMUST00000190898 1875 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
PtprkP35822 Pcdh15-236ENSMUST00000193174 5936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
PtprkP35822 Il18r1-201ENSMUST00000087983 2826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
PtprkP35822 Gm13727-201ENSMUST00000154480 424 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
PtprkP35822 Vmn1r190-ps-201ENSMUST00000155950 903 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
PtprkP35822 Gm26086-201ENSMUST00000157902 263 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
PtprkP35822 Gm9529-201ENSMUST00000177598 579 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
PtprkP35822 Gm18290-201ENSMUST00000202900 844 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
PtprkP35822 Gm44020-201ENSMUST00000204618 664 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
PtprkP35822 Gm44366-201ENSMUST00000204933 674 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
PtprkP35822 Gm46223-201ENSMUST00000215196 675 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
PtprkP35822 AC133207.2-201ENSMUST00000218430 237 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
PtprkP35822 Rybp-ps-201ENSMUST00000069489 681 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
PtprkP35822 Olfr121-201ENSMUST00000074555 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
PtprkP35822 Gm3424-201ENSMUST00000164585 1758 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
PtprkP35822 AC164978.1-201ENSMUST00000228608 4011 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
PtprkP35822 Slitrk4-201ENSMUST00000069926 8494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
PtprkP35822 Gm26744-201ENSMUST00000181834 1731 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
PtprkP35822 Gm28475-201ENSMUST00000187645 1497 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
PtprkP35822 Dglucy-208ENSMUST00000167322 2941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
PtprkP35822 Gm33326-201ENSMUST00000209741 3815 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PtprkP35822 Prkag2os2-201ENSMUST00000123610 1432 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PtprkP35822 Gm13872-202ENSMUST00000143995 1408 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PtprkP35822 Gm10826-201ENSMUST00000215366 3304 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
PtprkP35822 Gm38299-201ENSMUST00000193214 3789 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
PtprkP35822 Gm42930-201ENSMUST00000200872 3260 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
PtprkP35822 Gprasp2-201ENSMUST00000113136 3736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
PtprkP35822 Fmo9-202ENSMUST00000148677 2462 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PtprkP35822 Erc2-201ENSMUST00000090302 6083 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PtprkP35822 Gm42636-201ENSMUST00000197174 2239 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
PtprkP35822 Specc1-203ENSMUST00000108709 6843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
PtprkP35822 Fbxo3-202ENSMUST00000102565 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PtprkP35822 Cebpz-201ENSMUST00000024885 4074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PtprkP35822 Igkv6-23-201ENSMUST00000103386 369 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
PtprkP35822 Selenok-ps1-201ENSMUST00000125204 785 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
PtprkP35822 Gm23662-201ENSMUST00000158046 111 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
PtprkP35822 Prl-201ENSMUST00000018061 886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PtprkP35822 AC170913.1-201ENSMUST00000221418 758 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
PtprkP35822 Gng12-201ENSMUST00000043148 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PtprkP35822 Cd36-202ENSMUST00000165232 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PtprkP35822 Gprasp1-202ENSMUST00000113145 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PtprkP35822 Gprasp1-203ENSMUST00000113147 5611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PtprkP35822 Gprasp1-206ENSMUST00000166554 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PtprkP35822 Gm37663-201ENSMUST00000191887 2299 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
PtprkP35822 Gm37234-201ENSMUST00000193259 1441 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
PtprkP35822 Lmbrd2-201ENSMUST00000090380 3210 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PtprkP35822 Mlh3-202ENSMUST00000166821 5420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PtprkP35822 Exoc5-207ENSMUST00000162175 12699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
PtprkP35822 Wac-217ENSMUST00000172018 1965 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
PtprkP35822 Tatdn1-201ENSMUST00000110155 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
PtprkP35822 Hmgn3-203ENSMUST00000185315 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.72
PtprkP35822 Myof-211ENSMUST00000226068 6633 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.52□□□□□ -0.72
PtprkP35822 Mnat1-201ENSMUST00000021523 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
PtprkP35822 Olfr691-202ENSMUST00000213290 2327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
PtprkP35822 Zfp935-204ENSMUST00000223247 1949 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
PtprkP35822 Krcc1-202ENSMUST00000168700 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
PtprkP35822 Cdh9-201ENSMUST00000026432 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
PtprkP35822 Gm38178-201ENSMUST00000194502 2471 ntBASIC10.52□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.8 ms