Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Eml1-201ENSMUST00000054955 3879 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
PtprmP28828 Fignl1-202ENSMUST00000109664 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
PtprmP28828 Zfp939-202ENSMUST00000186855 2480 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
PtprmP28828 Arhgap19-202ENSMUST00000163265 5058 ntTSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
PtprmP28828 Gm27179-201ENSMUST00000184652 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
PtprmP28828 Dsg1b-201ENSMUST00000076737 3965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
PtprmP28828 C030029H02Rik-202ENSMUST00000210356 2980 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
PtprmP28828 Olfr874-202ENSMUST00000216982 2632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
PtprmP28828 4930568G15Rik-201ENSMUST00000193317 3218 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
PtprmP28828 Ncoa4-202ENSMUST00000163336 4065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
PtprmP28828 Gm37084-201ENSMUST00000191688 5898 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
PtprmP28828 Gprasp2-201ENSMUST00000113136 3736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
PtprmP28828 Gm12043-201ENSMUST00000131570 2788 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
PtprmP28828 Zfp229-201ENSMUST00000065871 4525 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.44□□□□□ -0.9
PtprmP28828 Map2-204ENSMUST00000114013 6258 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
PtprmP28828 Ube3a-203ENSMUST00000200758 9856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
PtprmP28828 D430042O09Rik-201ENSMUST00000069660 6148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
PtprmP28828 Gm25537-201ENSMUST00000103851 109 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
PtprmP28828 Gm25345-201ENSMUST00000104505 133 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
PtprmP28828 Gm15621-201ENSMUST00000119162 364 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
PtprmP28828 Gm11787-201ENSMUST00000121996 1050 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
PtprmP28828 Gm25152-201ENSMUST00000157117 114 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
PtprmP28828 Gm23740-201ENSMUST00000157385 100 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
PtprmP28828 Gm4141-201ENSMUST00000174364 921 ntAPPRIS P1 BASIC9.44□□□□□ -0.9
PtprmP28828 Gm4201-201ENSMUST00000174775 921 ntAPPRIS P1 BASIC9.44□□□□□ -0.9
PtprmP28828 Gm22932-201ENSMUST00000175510 72 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
PtprmP28828 Gm27208-201ENSMUST00000184323 604 ntTSL 3 BASIC9.44□□□□□ -0.9
PtprmP28828 Csn2-202ENSMUST00000196163 722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
PtprmP28828 Gm43608-201ENSMUST00000197703 687 ntTSL 3 BASIC9.44□□□□□ -0.9
PtprmP28828 1700065J11Rik-201ENSMUST00000201560 424 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
PtprmP28828 Gm10688-201ENSMUST00000214985 520 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
PtprmP28828 Olfr1110-201ENSMUST00000099861 939 ntAPPRIS P1 BASIC9.44□□□□□ -0.9
PtprmP28828 Hectd4-201ENSMUST00000042614 15482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
PtprmP28828 Smim17-202ENSMUST00000160218 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
PtprmP28828 Lifr-207ENSMUST00000227727 2489 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.44□□□□□ -0.9
PtprmP28828 Gm42397-205ENSMUST00000208692 1449 ntTSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
PtprmP28828 Gm10319-201ENSMUST00000078431 1355 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
PtprmP28828 Itgae-201ENSMUST00000006101 3845 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
PtprmP28828 Spata22-201ENSMUST00000117445 3200 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.43□□□□□ -0.9
PtprmP28828 Vmn1r44-213ENSMUST00000228700 2004 ntAPPRIS P1 BASIC9.43□□□□□ -0.9
PtprmP28828 Ssr1-201ENSMUST00000021864 9333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
PtprmP28828 Gm18880-201ENSMUST00000223333 1541 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
PtprmP28828 Fam229b-205ENSMUST00000135785 674 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.43□□□□□ -0.9
PtprmP28828 Gm13175-201ENSMUST00000139479 466 ntTSL 3 BASIC9.43□□□□□ -0.9
PtprmP28828 Gm15956-201ENSMUST00000153352 502 ntTSL 2 BASIC9.43□□□□□ -0.9
PtprmP28828 Gm26037-201ENSMUST00000158150 311 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
PtprmP28828 Mir3080-201ENSMUST00000175010 79 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
PtprmP28828 Gm20691-201ENSMUST00000176889 333 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
PtprmP28828 2610509F24Rik-201ENSMUST00000193035 838 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
PtprmP28828 Gm44604-201ENSMUST00000205475 496 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
PtprmP28828 Gm45127-201ENSMUST00000205984 1015 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
PtprmP28828 Cers3-202ENSMUST00000208521 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
PtprmP28828 Gm35453-201ENSMUST00000210304 331 ntTSL 3 BASIC9.43□□□□□ -0.9
PtprmP28828 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
PtprmP28828 Gm6049-201ENSMUST00000222369 458 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
PtprmP28828 Gm34557-201ENSMUST00000223115 375 ntTSL 3 BASIC9.43□□□□□ -0.9
PtprmP28828 Olfr1509-201ENSMUST00000045066 1010 ntAPPRIS P1 BASIC9.43□□□□□ -0.9
PtprmP28828 4930578G10Rik-201ENSMUST00000068158 614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
PtprmP28828 Sorbs2-220ENSMUST00000139869 4275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
PtprmP28828 Gm13856-201ENSMUST00000126498 1742 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
PtprmP28828 Gm42972-201ENSMUST00000196937 5617 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
PtprmP28828 Dcdc5-201ENSMUST00000037284 3093 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
PtprmP28828 AC129308.2-203ENSMUST00000224109 2385 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
PtprmP28828 Vmn1r199-203ENSMUST00000227689 5537 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.43□□□□□ -0.9
PtprmP28828 Vmn2r-ps159-203ENSMUST00000189559 2560 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
PtprmP28828 4930545L23Rik-201ENSMUST00000138303 2502 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
PtprmP28828 CT025642.2-201ENSMUST00000225009 1649 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
PtprmP28828 Gm37403-201ENSMUST00000193775 3521 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
PtprmP28828 Gm43534-201ENSMUST00000197685 2853 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
PtprmP28828 Med23-201ENSMUST00000020159 4798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
PtprmP28828 AL670757.1-201ENSMUST00000223668 1959 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
PtprmP28828 Atp13a4-208ENSMUST00000182627 4238 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
PtprmP28828 Itih4-201ENSMUST00000006703 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
PtprmP28828 Ctnna2-202ENSMUST00000159626 3908 ntTSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
PtprmP28828 Sema6a-202ENSMUST00000076043 4123 ntTSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
PtprmP28828 BC046251-201ENSMUST00000154632 3653 ntTSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
PtprmP28828 Ccdc169-201ENSMUST00000052904 2889 ntTSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
PtprmP28828 A930017M01Rik-201ENSMUST00000081361 2884 ntBASIC9.42□□□□□ -0.9
PtprmP28828 Gm14550-201ENSMUST00000117918 407 ntBASIC9.42□□□□□ -0.9
PtprmP28828 Gm14267-201ENSMUST00000119751 496 ntBASIC9.42□□□□□ -0.9
PtprmP28828 Gm12400-201ENSMUST00000120915 1003 ntBASIC9.42□□□□□ -0.9
PtprmP28828 Olfr1134-202ENSMUST00000135875 1291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
PtprmP28828 Gm22420-201ENSMUST00000178795 126 ntBASIC9.42□□□□□ -0.9
PtprmP28828 Crnde-205ENSMUST00000179400 651 ntTSL 2 BASIC9.42□□□□□ -0.9
PtprmP28828 Platr2-201ENSMUST00000180834 521 ntTSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
PtprmP28828 Gm28017-201ENSMUST00000183434 126 ntBASIC9.42□□□□□ -0.9
PtprmP28828 Gm44705-201ENSMUST00000206719 339 ntBASIC9.42□□□□□ -0.9
PtprmP28828 Gm9292-201ENSMUST00000222008 710 ntBASIC9.42□□□□□ -0.9
PtprmP28828 AC163660.1-201ENSMUST00000223696 818 ntBASIC9.42□□□□□ -0.9
PtprmP28828 Tas2r144-201ENSMUST00000063489 960 ntAPPRIS P1 BASIC9.42□□□□□ -0.9
PtprmP28828 Gm26130-201ENSMUST00000083171 138 ntBASIC9.42□□□□□ -0.9
PtprmP28828 Olfr1134-201ENSMUST00000099857 1102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.42□□□□□ -0.9
PtprmP28828 Vmn1r33-202ENSMUST00000227418 2414 ntAPPRIS P1 BASIC9.42□□□□□ -0.9
PtprmP28828 Cpb1-201ENSMUST00000011607 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
PtprmP28828 Spen-202ENSMUST00000105786 12299 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
PtprmP28828 Olfr1380-202ENSMUST00000215360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
PtprmP28828 Myo15-202ENSMUST00000081823 7953 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
PtprmP28828 Arpp21-202ENSMUST00000070218 3181 ntTSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
PtprmP28828 Tmc3-203ENSMUST00000164944 3306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
PtprmP28828 Plk4-202ENSMUST00000167556 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
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