Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Olfr472-203ENSMUST00000216937 5392 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
RxraP28700 Ezh1-203ENSMUST00000107285 4193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
RxraP28700 H2al2a-201ENSMUST00000105001 542 ntAPPRIS P1 BASIC6.81□□□□□ -1.32
RxraP28700 Homer1-208ENSMUST00000109495 813 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
RxraP28700 Gm17184-201ENSMUST00000111864 462 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
RxraP28700 Usp17le-ps-201ENSMUST00000117954 957 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
RxraP28700 Gm13744-201ENSMUST00000118953 850 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
RxraP28700 Rpl36-ps7-201ENSMUST00000119462 315 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
RxraP28700 Gm11485-201ENSMUST00000120048 1175 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
RxraP28700 Gm11338-201ENSMUST00000120086 1160 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
RxraP28700 Gm11726-201ENSMUST00000121028 424 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
RxraP28700 Gm14796-201ENSMUST00000121216 959 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
RxraP28700 Mir1907-201ENSMUST00000122509 90 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
RxraP28700 AV064505-201ENSMUST00000124572 522 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
RxraP28700 Gm13715-201ENSMUST00000136578 411 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
RxraP28700 Gm12111-201ENSMUST00000150073 349 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
RxraP28700 Gm25722-201ENSMUST00000157498 279 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
RxraP28700 Vmn2r-ps86-201ENSMUST00000174812 871 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
RxraP28700 Gm6061-201ENSMUST00000175860 492 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
RxraP28700 Fam47e-207ENSMUST00000176621 746 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
RxraP28700 Dnah7c-201ENSMUST00000178395 612 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
RxraP28700 Crnde-205ENSMUST00000179400 651 ntTSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
RxraP28700 Prl8a6-201ENSMUST00000018392 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
RxraP28700 Gm29099-201ENSMUST00000187370 760 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
RxraP28700 Gm28514-201ENSMUST00000187488 450 ntTSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
RxraP28700 Gm29470-201ENSMUST00000188007 696 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
RxraP28700 Gm28801-201ENSMUST00000188761 449 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
RxraP28700 Gm29011-201ENSMUST00000191059 712 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
RxraP28700 Gm37319-201ENSMUST00000193500 636 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
RxraP28700 Gm37270-201ENSMUST00000194277 330 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
RxraP28700 Gm6077-201ENSMUST00000196008 499 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
RxraP28700 Gm19080-201ENSMUST00000196082 550 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
RxraP28700 Sox2ot-214ENSMUST00000198758 1286 ntTSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
RxraP28700 Gm35520-201ENSMUST00000209235 784 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
RxraP28700 Gm45241-201ENSMUST00000211237 634 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
RxraP28700 AC131795.1-201ENSMUST00000219632 426 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
RxraP28700 CT009711.2-202ENSMUST00000224538 973 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
RxraP28700 4932702P03Rik-203ENSMUST00000225028 670 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
RxraP28700 AC140288.1-201ENSMUST00000226329 503 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
RxraP28700 AC154484.2-201ENSMUST00000228359 818 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
RxraP28700 Tmed6-201ENSMUST00000034393 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
RxraP28700 Olfr691-201ENSMUST00000057528 969 ntAPPRIS P1 BASIC6.81□□□□□ -1.32
RxraP28700 Olfr1457-201ENSMUST00000075170 954 ntAPPRIS P1 BASIC6.81□□□□□ -1.32
RxraP28700 Olfr195-201ENSMUST00000075381 995 ntAPPRIS P1 BASIC6.81□□□□□ -1.32
RxraP28700 Olfr961-201ENSMUST00000076548 949 ntAPPRIS P1 BASIC6.81□□□□□ -1.32
RxraP28700 Tnfrsf22-202ENSMUST00000084396 564 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
RxraP28700 Hist1h2bb-201ENSMUST00000099703 508 ntAPPRIS P1 BASIC6.81□□□□□ -1.32
RxraP28700 Olfr1085-201ENSMUST00000099879 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.81□□□□□ -1.32
RxraP28700 Slc25a40-202ENSMUST00000170496 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
RxraP28700 Ttc12-201ENSMUST00000055096 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
RxraP28700 B130024G19Rik-203ENSMUST00000190320 5451 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
RxraP28700 9930111J21Rik2-201ENSMUST00000093152 2403 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
RxraP28700 9930111J21Rik1-201ENSMUST00000093153 2403 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
RxraP28700 Zc4h2-202ENSMUST00000119640 2075 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
RxraP28700 Zfp74-202ENSMUST00000108205 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
RxraP28700 Adgrl2-215ENSMUST00000199750 4399 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
RxraP28700 Olfr694-203ENSMUST00000216118 5035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
RxraP28700 AC129308.2-203ENSMUST00000224109 2385 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
RxraP28700 Zfp708-202ENSMUST00000109743 2536 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
RxraP28700 Gm19667-201ENSMUST00000188984 3334 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
RxraP28700 Zwint-202ENSMUST00000105431 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
RxraP28700 4930402F06Rik-202ENSMUST00000113010 1372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
RxraP28700 Il7-201ENSMUST00000168269 2307 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
RxraP28700 Cfap54-211ENSMUST00000212902 9516 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
RxraP28700 AC116950.1-201ENSMUST00000226322 3250 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
RxraP28700 Olfr1302-202ENSMUST00000214708 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
RxraP28700 Gdpd4-201ENSMUST00000041860 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
RxraP28700 Gm31049-201ENSMUST00000201516 1302 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
RxraP28700 Gm45657-201ENSMUST00000211318 1349 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
RxraP28700 Vcam1-203ENSMUST00000196449 2532 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
RxraP28700 Nipa2-203ENSMUST00000119041 2979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
RxraP28700 Gabpb2-204ENSMUST00000107209 8357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
RxraP28700 Olfr1293-ps-201ENSMUST00000102551 888 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
RxraP28700 Ighv14-4-201ENSMUST00000103475 333 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
RxraP28700 Gm25724-201ENSMUST00000104531 117 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
RxraP28700 Tdpx-ps1-201ENSMUST00000117372 597 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
RxraP28700 Gm13260-201ENSMUST00000117797 1264 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
RxraP28700 Gm13237-201ENSMUST00000122151 635 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
RxraP28700 Gm10660-201ENSMUST00000148610 1203 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
RxraP28700 Gm11423-202ENSMUST00000152784 686 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
RxraP28700 Gm12718-202ENSMUST00000156144 660 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
RxraP28700 Gm23031-201ENSMUST00000157998 119 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
RxraP28700 Gm16006-201ENSMUST00000160938 566 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
RxraP28700 Tnik-211ENSMUST00000161964 3807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
RxraP28700 Vmn1r-ps55-201ENSMUST00000174634 392 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
RxraP28700 Gm27014-201ENSMUST00000182658 937 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
RxraP28700 Gm27178-201ENSMUST00000184962 340 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
RxraP28700 Ighv1-17-201ENSMUST00000194435 350 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
RxraP28700 Gm4410-201ENSMUST00000199349 686 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
RxraP28700 Klrb1-ps1-202ENSMUST00000203057 414 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
RxraP28700 Gm44674-201ENSMUST00000206159 415 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
RxraP28700 Gm44603-201ENSMUST00000206820 367 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
RxraP28700 Gm45042-201ENSMUST00000207377 211 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
RxraP28700 1700034P13Rik-206ENSMUST00000207445 1146 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
RxraP28700 Olfr1247-203ENSMUST00000216424 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
RxraP28700 AC164550.1-201ENSMUST00000217821 1066 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
RxraP28700 Gm8275-201ENSMUST00000219732 424 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
RxraP28700 AC122539.1-201ENSMUST00000219925 329 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
RxraP28700 Gm46348-201ENSMUST00000222917 2151 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
RxraP28700 AC154849.2-201ENSMUST00000223781 974 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
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