Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 Angpt2-201ENSMUST00000033846 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Usp8-202ENSMUST00000110416 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Hsdl2-202ENSMUST00000107528 2626 ntTSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Clip4-201ENSMUST00000024854 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Sap130-201ENSMUST00000025109 4015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Cd200r4-203ENSMUST00000176819 1796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Oas2-201ENSMUST00000053909 3869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Gpr89-201ENSMUST00000029738 4598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 A230001M10Rik-203ENSMUST00000198712 1747 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Adam18-201ENSMUST00000033957 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Olfr1394-202ENSMUST00000216273 3024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Frem3-201ENSMUST00000039695 6384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 CT009734.1-201ENSMUST00000227657 1687 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Sorbs2-201ENSMUST00000067065 6337 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Vmn2r55-202ENSMUST00000172743 2346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Gm7534-201ENSMUST00000097849 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Mpp7-201ENSMUST00000115869 4975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Npffr2-201ENSMUST00000048557 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Pogz-201ENSMUST00000042402 4775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Gm11872-201ENSMUST00000141819 2219 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Rdx-203ENSMUST00000163153 4131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Olfr1414-201ENSMUST00000062353 6017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Gm18491-201ENSMUST00000192492 1594 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Fam126b-202ENSMUST00000097724 4581 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Gm18697-201ENSMUST00000191179 2126 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Gm43398-201ENSMUST00000196584 2742 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Nat2-202ENSMUST00000163856 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Gm28993-201ENSMUST00000186236 1499 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Gm37870-201ENSMUST00000192349 1499 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Gm37467-202ENSMUST00000192785 1499 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Gm37252-201ENSMUST00000195063 1499 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Gm38013-202ENSMUST00000195453 1499 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Gm37286-201ENSMUST00000195885 1499 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Pan2-203ENSMUST00000218315 4379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Arhgap12-212ENSMUST00000182559 4265 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Zfp641-202ENSMUST00000169721 3673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Alkbh8-201ENSMUST00000053407 3603 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Vmn1r49-202ENSMUST00000203791 1356 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Slc43a2-201ENSMUST00000042561 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Olfr150-202ENSMUST00000217257 1867 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Olfr845-203ENSMUST00000215572 3446 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Usp37-205ENSMUST00000189257 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Naip1-201ENSMUST00000022142 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Olfr650-ps1-201ENSMUST00000121432 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Ugt3a2-201ENSMUST00000072403 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Gm42576-201ENSMUST00000202336 2846 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Ccr4-201ENSMUST00000054414 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Mrps18c-202ENSMUST00000112898 460 ntTSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Gm7834-201ENSMUST00000117560 437 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Gm15778-201ENSMUST00000118469 608 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Gm13579-201ENSMUST00000118519 517 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Gm11922-201ENSMUST00000118967 475 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Gm24385-201ENSMUST00000122694 350 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Rps12-ps9-201ENSMUST00000139165 399 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 1700125H03Rik-202ENSMUST00000139265 637 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 2610035D17Rik-204ENSMUST00000150712 947 ntTSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Gm15389-201ENSMUST00000153774 666 ntTSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Mir1968-201ENSMUST00000157429 68 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Gm24883-201ENSMUST00000158391 281 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 0610012D04Rik-201ENSMUST00000159031 531 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Insig2-208ENSMUST00000160968 1204 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Gm16573-203ENSMUST00000162231 807 ntTSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Trav9d-4-201ENSMUST00000167409 307 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Mir3072-201ENSMUST00000175610 83 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Vmn1r-ps22-201ENSMUST00000176017 900 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Gm8609-201ENSMUST00000182967 998 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Prl8a8-201ENSMUST00000018389 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Gm7560-201ENSMUST00000187748 873 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Gm7200-201ENSMUST00000188426 1163 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Gm19057-201ENSMUST00000194329 1197 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Gm42808-201ENSMUST00000198212 285 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 D030025E07Rik-204ENSMUST00000198275 653 ntTSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Gm31026-201ENSMUST00000198762 821 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Kitl-201ENSMUST00000020129 1260 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Gm45054-201ENSMUST00000206525 342 ntTSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Olfr1452-ps1-201ENSMUST00000208396 925 ntAPPRIS P1 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Gm44724-203ENSMUST00000208430 998 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Gm44561-201ENSMUST00000208869 264 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Gm29817-201ENSMUST00000210098 172 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Gm15839-202ENSMUST00000211219 664 ntTSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Olfr840-ps1-201ENSMUST00000211827 917 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Gm4898-201ENSMUST00000218519 832 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Uqcrb-201ENSMUST00000021993 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Rpl29-ps2-202ENSMUST00000220540 1165 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 CT030170.6-202ENSMUST00000223186 544 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 CT030662.2-201ENSMUST00000226942 805 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Gm5316-201ENSMUST00000050391 270 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Insig2-202ENSMUST00000071064 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Klk1b8-201ENSMUST00000072204 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Tdgf1-ps2-201ENSMUST00000074412 505 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Olfr1148-201ENSMUST00000077580 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Tardbp-203ENSMUST00000095719 1011 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Ankrd49-201ENSMUST00000034406 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Akap2-206ENSMUST00000107598 6830 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Gm37877-201ENSMUST00000191630 2709 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Gm34184-201ENSMUST00000216477 2713 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Gm5118-201ENSMUST00000184692 2203 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Tdrkh-202ENSMUST00000166032 5692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Slc7a12-201ENSMUST00000037321 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Dusp18-201ENSMUST00000055931 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
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