Protein–RNA interactions for Protein: P20664

Prim1, DNA primase small subunit, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prim1P20664 Gm45873-201ENSMUST00000211865 1915 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Prim1P20664 Add1-201ENSMUST00000001108 3898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Prim1P20664 4930534H03Rik-201ENSMUST00000216311 1669 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Prim1P20664 Gm20236-201ENSMUST00000193037 4540 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Prim1P20664 Gm37094-201ENSMUST00000193352 4540 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Prim1P20664 Kif1a-204ENSMUST00000171796 8206 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Prim1P20664 Gm42847-201ENSMUST00000201732 2553 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Prim1P20664 Entpd5-205ENSMUST00000120942 4881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Prim1P20664 Cd300a-201ENSMUST00000045151 4633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Prim1P20664 Sec16b-203ENSMUST00000111700 4369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Prim1P20664 Gm6787-201ENSMUST00000123120 1454 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Prim1P20664 Tead1-206ENSMUST00000164363 1495 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Prim1P20664 Cacna1f-202ENSMUST00000115726 6079 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
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Prim1P20664 Defa33-201ENSMUST00000120874 426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
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Prim1P20664 Defa2-201ENSMUST00000170275 426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
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Prim1P20664 Gm44023-201ENSMUST00000203710 469 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Prim1P20664 Gm17984-201ENSMUST00000205286 859 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Prim1P20664 Gm18207-201ENSMUST00000205486 526 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Prim1P20664 Gm7570-201ENSMUST00000215246 698 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Prim1P20664 Gm19168-201ENSMUST00000218804 1091 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Prim1P20664 AC127279.1-201ENSMUST00000220140 637 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
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Prim1P20664 Mcts1-201ENSMUST00000000365 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
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Prim1P20664 Adgrg1-202ENSMUST00000179619 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
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Prim1P20664 Cntnap2-205ENSMUST00000199100 6279 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
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Prim1P20664 Mkrn2-201ENSMUST00000000449 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Prim1P20664 Svs1-201ENSMUST00000037696 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Prim1P20664 Zfp939-201ENSMUST00000061201 2131 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Prim1P20664 Tardbp-202ENSMUST00000084125 7477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Prim1P20664 Zscan26-201ENSMUST00000032820 3918 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Prim1P20664 Polq-201ENSMUST00000054034 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Prim1P20664 Pcm1-201ENSMUST00000045218 6624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Prim1P20664 Rab7b-202ENSMUST00000064679 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Prim1P20664 Ing5-201ENSMUST00000027505 4533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Prim1P20664 Gm44013-201ENSMUST00000204392 2262 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Prim1P20664 Pot1a-209ENSMUST00000166445 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
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Prim1P20664 BC051142-203ENSMUST00000114175 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Prim1P20664 Abr-204ENSMUST00000108407 4811 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
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Prim1P20664 Olfr1186-201ENSMUST00000121619 1090 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Prim1P20664 Gm13964-201ENSMUST00000133815 734 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Prim1P20664 Scarna17-201ENSMUST00000158064 79 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Prim1P20664 Gm22076-201ENSMUST00000158601 84 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Prim1P20664 Trav7n-6-201ENSMUST00000178100 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Prim1P20664 Gm26824-201ENSMUST00000180506 1164 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Prim1P20664 Ranbp2-ps6-201ENSMUST00000183722 381 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Prim1P20664 Gm27187-202ENSMUST00000184873 606 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Prim1P20664 Gm8304-201ENSMUST00000185744 584 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
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Prim1P20664 Gm18291-201ENSMUST00000190791 301 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Prim1P20664 6430573P05Rik-201ENSMUST00000192562 508 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Prim1P20664 Gm37339-201ENSMUST00000194142 392 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Prim1P20664 Gm6639-201ENSMUST00000196349 429 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Prim1P20664 Mrpl24-201ENSMUST00000019854 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Prim1P20664 Gm18131-201ENSMUST00000199241 449 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Prim1P20664 Gm43150-201ENSMUST00000200931 636 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Prim1P20664 RMST_1.1-206ENSMUST00000218255 309 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Prim1P20664 1810014B01Rik-205ENSMUST00000218691 323 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Prim1P20664 AC116589.7-201ENSMUST00000221061 239 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Prim1P20664 AC164117.1-201ENSMUST00000221726 239 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Prim1P20664 AC133203.2-201ENSMUST00000226709 464 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Prim1P20664 9430069I07Rik-202ENSMUST00000227772 572 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Prim1P20664 Olfr506-201ENSMUST00000077343 1008 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
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