Protein–RNA interactions for Protein: P20040

H-2 class II histocompatibility antigen, E-Q beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P20040 Gm21889-201ENSMUST00000188487 695 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
P20040 Gm9114-201ENSMUST00000188558 997 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
P20040 Gm20932-201ENSMUST00000189115 694 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
P20040 Gm21721-202ENSMUST00000189253 1225 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
P20040 Gm21920-201ENSMUST00000190042 695 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
P20040 Gm28171-201ENSMUST00000190100 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
P20040 Gm20803-202ENSMUST00000190968 1230 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
P20040 Gm20867-202ENSMUST00000190987 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
P20040 Gm44836-201ENSMUST00000205869 336 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
P20040 Gm31374-202ENSMUST00000214913 914 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
P20040 Aldoa-ps4-201ENSMUST00000216332 753 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
P20040 AC153955.3-201ENSMUST00000216787 646 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
P20040 AC108401.2-201ENSMUST00000220316 346 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
P20040 Scp2d1-201ENSMUST00000028918 760 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
P20040 Olfr299-201ENSMUST00000057734 993 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
P20040 Olfr1306-201ENSMUST00000099607 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
P20040 Bnc2-201ENSMUST00000102820 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
P20040 Gm43335-201ENSMUST00000198299 3276 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
P20040 Gm43526-201ENSMUST00000196666 1565 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
P20040 Ugt2b38-201ENSMUST00000072818 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
P20040 Kcnj6-203ENSMUST00000165538 3637 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
P20040 Zfp184-201ENSMUST00000006903 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
P20040 Vmn2r62-201ENSMUST00000169130 2580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
P20040 Gm9268-202ENSMUST00000173815 2565 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
P20040 Vmn1r220-204ENSMUST00000227950 6238 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
P20040 Gsdmc4-201ENSMUST00000063530 1988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
P20040 E330011O21Rik-204ENSMUST00000210839 1361 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
P20040 AC159006.2-201ENSMUST00000228734 4144 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
P20040 Pde7a-201ENSMUST00000091314 4454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
P20040 2610044O15Rik8-202ENSMUST00000186619 2337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
P20040 Gm13749-201ENSMUST00000133244 1432 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
P20040 Gcnt2-203ENSMUST00000110191 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
P20040 Gm40518-202ENSMUST00000214538 4080 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
P20040 AC187103.1-201ENSMUST00000224641 1475 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
P20040 Vmn1r196-205ENSMUST00000228557 5790 ntAPPRIS P2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
P20040 Gm37474-201ENSMUST00000194812 1814 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
P20040 Mageb18-202ENSMUST00000113955 2163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
P20040 Zfp708-202ENSMUST00000109743 2536 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
P20040 Gm36660-201ENSMUST00000218323 3871 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
P20040 Eif4a2-203ENSMUST00000115341 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
P20040 Vmn2r61-201ENSMUST00000166131 2598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
P20040 Gm5886-203ENSMUST00000203983 2613 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
P20040 Gm9871-203ENSMUST00000204837 1560 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
P20040 Trbv1-201ENSMUST00000103262 417 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
P20040 Gm11889-201ENSMUST00000118402 1079 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
P20040 Gm12174-201ENSMUST00000119853 813 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
P20040 Gm6142-201ENSMUST00000120290 325 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
P20040 Gm13754-201ENSMUST00000120486 998 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
P20040 Atp5l-ps2-201ENSMUST00000121382 314 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
P20040 2210409E12Rik-201ENSMUST00000122062 346 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
P20040 Tnfsf10-202ENSMUST00000174840 989 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
P20040 Gm21839-201ENSMUST00000179536 378 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
P20040 Gm27178-201ENSMUST00000184962 340 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
P20040 Gm29048-201ENSMUST00000185342 615 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
P20040 Gm29403-201ENSMUST00000185491 615 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
P20040 Gm28234-201ENSMUST00000185657 615 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
P20040 Gm28248-201ENSMUST00000186093 615 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
P20040 Gm29633-202ENSMUST00000186217 615 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
P20040 Gm28829-201ENSMUST00000186231 615 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
P20040 Gm28261-201ENSMUST00000186417 615 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
P20040 Gm28815-201ENSMUST00000186751 615 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
P20040 Gm28608-201ENSMUST00000186860 615 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
P20040 Stpg4-203ENSMUST00000187078 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
P20040 Gm28122-201ENSMUST00000187088 615 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
P20040 Gm28420-201ENSMUST00000187340 615 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
P20040 Krtdap-203ENSMUST00000187493 420 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
P20040 Gm28106-201ENSMUST00000187640 615 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
P20040 Gm28698-201ENSMUST00000187734 615 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
P20040 Gm29224-201ENSMUST00000187965 615 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
P20040 Gm29189-201ENSMUST00000188018 615 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
P20040 Gm29476-201ENSMUST00000188397 615 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
P20040 Gm29505-201ENSMUST00000188424 615 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
P20040 Gm28125-201ENSMUST00000188470 615 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
P20040 Gm29391-201ENSMUST00000188545 615 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
P20040 Gm29280-201ENSMUST00000188571 615 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
P20040 Gm28349-201ENSMUST00000188590 615 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
P20040 Gm29652-201ENSMUST00000188622 615 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
P20040 Gm28819-206ENSMUST00000188816 615 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
P20040 Gm29079-201ENSMUST00000188875 615 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
P20040 Gm28213-201ENSMUST00000189183 615 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
P20040 Gm29382-201ENSMUST00000189549 615 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
P20040 Gm29377-205ENSMUST00000189603 615 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
P20040 Gm28327-201ENSMUST00000189638 615 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
P20040 Gm28790-201ENSMUST00000189642 615 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
P20040 Krtdap-205ENSMUST00000189673 345 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
P20040 Gm28907-201ENSMUST00000189700 615 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
P20040 Gm29586-207ENSMUST00000189745 615 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
P20040 Gm29115-201ENSMUST00000189870 615 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
P20040 Krtdap-206ENSMUST00000189962 323 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
P20040 Gm28366-201ENSMUST00000190147 615 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
P20040 Gm29212-201ENSMUST00000190384 615 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
P20040 Gm29533-201ENSMUST00000190403 615 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
P20040 Gm28162-201ENSMUST00000190545 615 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
P20040 Gm29030-201ENSMUST00000190848 615 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
P20040 Krtdap-209ENSMUST00000190990 403 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
P20040 Gm28742-201ENSMUST00000191001 615 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
P20040 Gm28899-201ENSMUST00000191161 615 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
P20040 Gm29567-201ENSMUST00000191188 615 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
P20040 Gm28222-201ENSMUST00000191210 615 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
P20040 Gm28776-201ENSMUST00000191282 615 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
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