Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 E330013P04Rik-201ENSMUST00000065383 2070 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 4921518K17Rik-201ENSMUST00000143949 3390 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 Vmn1r6-206ENSMUST00000227847 8073 ntAPPRIS P2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 Gm18957-201ENSMUST00000197623 1813 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 AL607131.1-201ENSMUST00000222575 1835 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 Adad1-201ENSMUST00000029274 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 Adipor2-201ENSMUST00000032272 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 Hipk3-203ENSMUST00000111125 3651 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 Zfp207-202ENSMUST00000053740 1562 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 Gm42503-201ENSMUST00000199080 3706 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 Pard3bos1-202ENSMUST00000138535 1878 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 A730011C13Rik-202ENSMUST00000141787 1877 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 Olfr1391-202ENSMUST00000215671 3235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 Cnpy1-205ENSMUST00000141601 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 Olfr703-202ENSMUST00000216254 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 Usp8-201ENSMUST00000028841 4145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 Mug1-201ENSMUST00000032228 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 Olfr449-202ENSMUST00000204072 1974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 Gm43588-201ENSMUST00000201862 2298 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 Gm7073-203ENSMUST00000190178 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 Gm9256-201ENSMUST00000198106 1420 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 Akt3-202ENSMUST00000111159 4906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 Hcrtr2-201ENSMUST00000063140 3761 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 St18-212ENSMUST00000151281 3533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 Gm26691-201ENSMUST00000180471 4401 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 Gm14762-201ENSMUST00000105109 1771 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 Hmmr-201ENSMUST00000020579 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 Akap5-201ENSMUST00000095610 6687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 AC139941.2-201ENSMUST00000221565 1824 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 Gm14988-201ENSMUST00000117224 1548 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 Skap2-205ENSMUST00000204778 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 Heph-203ENSMUST00000113838 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 Cyp2b23-201ENSMUST00000077356 2189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 Gm19801-201ENSMUST00000218231 1882 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 Gnb1-208ENSMUST00000176637 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 Gm24869-201ENSMUST00000104072 128 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 Gm10936-201ENSMUST00000105264 252 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 Fancl-202ENSMUST00000109509 1187 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 Klrd1-202ENSMUST00000112063 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 Cldn34d-201ENSMUST00000114054 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 Gm14904-201ENSMUST00000117067 335 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 Gm16149-201ENSMUST00000117631 309 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 Gm15105-201ENSMUST00000117777 204 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 Gm12307-201ENSMUST00000120581 590 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 Gm12593-201ENSMUST00000120981 743 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 Gm12222-201ENSMUST00000121368 260 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 Gm11895-201ENSMUST00000122165 467 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 n-R5s48-201ENSMUST00000122482 110 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 4930519F16Rik-202ENSMUST00000127012 685 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 Gm11309-201ENSMUST00000127108 613 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 Btf3-205ENSMUST00000152704 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 Gm12718-202ENSMUST00000156144 660 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 Gm16297-201ENSMUST00000161466 459 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 Gm20637-201ENSMUST00000175715 462 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 Gm26763-201ENSMUST00000180968 1093 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 Gm27026-201ENSMUST00000183003 892 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 Mir7212-201ENSMUST00000184098 61 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 Mir6403-201ENSMUST00000185007 129 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 Mir8120-201ENSMUST00000185035 139 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 1700034P13Rik-204ENSMUST00000189431 555 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 Gm28070-201ENSMUST00000191502 445 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 Gm37689-201ENSMUST00000193139 275 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 Gm5050-201ENSMUST00000197164 775 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 Gm8182-201ENSMUST00000197863 769 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 Gm2762-203ENSMUST00000201658 1234 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 4930513D17Rik-203ENSMUST00000202800 1159 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 Gm45070-201ENSMUST00000208100 246 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 Gm45627-201ENSMUST00000210130 977 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 Gm39158-201ENSMUST00000210178 856 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 AC165256.1-201ENSMUST00000216687 670 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 Gm19217-201ENSMUST00000218238 328 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 AC138290.1-201ENSMUST00000219242 820 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 AC122539.1-201ENSMUST00000219925 329 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 4930407I19Rik-201ENSMUST00000220265 923 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 AC138330.1-201ENSMUST00000220690 1127 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 Gm2099-201ENSMUST00000220979 412 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 AC163354.1-207ENSMUST00000221270 1243 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 CT485612.3-201ENSMUST00000222179 408 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 Dbi-201ENSMUST00000027634 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 Klrd1-201ENSMUST00000032268 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 Olfr1367-201ENSMUST00000059216 1055 ntAPPRIS P1 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 Olfr1377-201ENSMUST00000075177 1063 ntAPPRIS P1 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 Olfr1503-ps1-201ENSMUST00000076614 803 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 Olfr1383-201ENSMUST00000077143 940 ntAPPRIS P1 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 Wfdc13-201ENSMUST00000088260 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 Olfr201-201ENSMUST00000099656 927 ntAPPRIS P1 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 Gm43502-201ENSMUST00000200263 2596 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 AC117232.2-201ENSMUST00000219469 2917 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 Lrrc31-201ENSMUST00000108263 3284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 F830016B08Rik-201ENSMUST00000171297 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 Matr3-215ENSMUST00000190121 2638 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 Gm19667-201ENSMUST00000188984 3334 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 Synj2bp-203ENSMUST00000163402 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 Klra1-201ENSMUST00000032288 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 Cd200r4-202ENSMUST00000176321 2005 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 Gm44677-201ENSMUST00000209151 3739 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 Zfp2-203ENSMUST00000116378 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 Daw1-203ENSMUST00000113436 1351 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 Ifi44l-201ENSMUST00000046739 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 Serpind1-202ENSMUST00000161034 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 103.9 ms