Protein–RNA interactions for Protein: P11260

Lire1, LINE-1 retrotransposable element ORF1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lire1P11260 Zfp719-201ENSMUST00000058104 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Lire1P11260 Scfd1-201ENSMUST00000021335 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Lire1P11260 Pvt1-202ENSMUST00000181416 3319 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Lire1P11260 Chil6-201ENSMUST00000029510 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Lire1P11260 CT030159.2-201ENSMUST00000221233 1742 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Lire1P11260 Gm38811-201ENSMUST00000203781 3478 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Lire1P11260 AC159196.3-201ENSMUST00000224307 1841 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Lire1P11260 Krt222-202ENSMUST00000103132 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Lire1P11260 Gm43189-201ENSMUST00000196040 3069 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Lire1P11260 Cops2-202ENSMUST00000110462 1853 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Lire1P11260 Teddm1b-201ENSMUST00000055314 2527 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Lire1P11260 Aox1-201ENSMUST00000001027 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Lire1P11260 Gm14510-201ENSMUST00000116165 1092 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Lire1P11260 Gm5228-201ENSMUST00000117186 357 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Lire1P11260 Gm13521-201ENSMUST00000118922 866 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Lire1P11260 Gm12375-201ENSMUST00000119331 921 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Lire1P11260 Sh3d2c-ps1-201ENSMUST00000121498 904 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Lire1P11260 Gm7546-201ENSMUST00000146119 966 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Lire1P11260 Gm25281-201ENSMUST00000157270 104 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Lire1P11260 Gm4340-201ENSMUST00000163113 807 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Lire1P11260 Gm5039-201ENSMUST00000177747 435 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Lire1P11260 Gm8332-201ENSMUST00000179468 435 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Lire1P11260 Gm2035-201ENSMUST00000180053 435 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Lire1P11260 Gm5445-201ENSMUST00000180224 480 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Lire1P11260 Gm16617-201ENSMUST00000181008 675 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Lire1P11260 Pea15b-201ENSMUST00000182806 387 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Lire1P11260 Gm27373-201ENSMUST00000184017 184 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Lire1P11260 1700054A03Rik-201ENSMUST00000187368 780 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Lire1P11260 Gm5305-201ENSMUST00000204010 746 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Lire1P11260 Tgm4-206ENSMUST00000215247 951 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Lire1P11260 AC167222.1-201ENSMUST00000219379 660 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Lire1P11260 Gm21936-201ENSMUST00000221442 435 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Lire1P11260 AC133598.3-204ENSMUST00000224260 767 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Lire1P11260 CT010480.3-201ENSMUST00000224712 259 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Lire1P11260 AC154738.4-201ENSMUST00000228310 414 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Lire1P11260 Olfr13-201ENSMUST00000059512 1054 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Lire1P11260 Gpr15-201ENSMUST00000089318 1290 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Lire1P11260 Olfr458-201ENSMUST00000090156 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Lire1P11260 Olfr1259-201ENSMUST00000090695 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Lire1P11260 Trim24-202ENSMUST00000120238 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Lire1P11260 Zfp184-205ENSMUST00000176511 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Lire1P11260 Zbed4-ps2-201ENSMUST00000187003 3448 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
Lire1P11260 AC122408.2-201ENSMUST00000217901 1391 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
Lire1P11260 Lilrb4a-203ENSMUST00000219696 1441 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Lire1P11260 Il15ra-217ENSMUST00000148748 1542 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Lire1P11260 Wdr37-202ENSMUST00000054251 4626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
Lire1P11260 Map2-205ENSMUST00000114015 5440 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Lire1P11260 Gm38412-201ENSMUST00000199205 3895 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Lire1P11260 Obox3-202ENSMUST00000095217 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Lire1P11260 AC159193.1-201ENSMUST00000222872 2517 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
Lire1P11260 P2ry13-201ENSMUST00000040622 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Lire1P11260 Ndrg3-202ENSMUST00000072298 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Lire1P11260 Gm42514-201ENSMUST00000196636 1832 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Lire1P11260 Kcnrg-202ENSMUST00000225582 1821 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Lire1P11260 Zfp667-201ENSMUST00000086327 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Lire1P11260 Pank1-202ENSMUST00000112460 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Lire1P11260 Zkscan7-204ENSMUST00000214957 5650 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Lire1P11260 Olfr720-204ENSMUST00000217642 4832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Lire1P11260 Olfr542-ps1-202ENSMUST00000218525 4039 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Lire1P11260 Adgrf5-201ENSMUST00000113599 8535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Lire1P11260 Zfp874a-202ENSMUST00000075255 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Lire1P11260 AU023762-203ENSMUST00000209897 2179 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Lire1P11260 Olfr266-202ENSMUST00000213616 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Lire1P11260 Gm13712-201ENSMUST00000117484 2295 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Lire1P11260 Prelp-201ENSMUST00000048432 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Lire1P11260 Igkv9-123-201ENSMUST00000103313 377 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Lire1P11260 Ighv1-31-201ENSMUST00000103511 294 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Lire1P11260 Ighv1-37-201ENSMUST00000103514 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Lire1P11260 Ighv1-42-201ENSMUST00000103516 294 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Lire1P11260 Ighv1-43-201ENSMUST00000103517 294 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Lire1P11260 Ighv1-66-201ENSMUST00000103537 399 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Lire1P11260 Ighv1-75-201ENSMUST00000103544 373 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Lire1P11260 9630041A04Rik-201ENSMUST00000112841 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Lire1P11260 Gm14904-201ENSMUST00000117067 335 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Lire1P11260 Gm11810-201ENSMUST00000118311 333 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Lire1P11260 Gm14158-201ENSMUST00000118409 308 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Lire1P11260 Gm12634-201ENSMUST00000122157 992 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Lire1P11260 Gm12720-201ENSMUST00000123834 472 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Lire1P11260 Gimap6-203ENSMUST00000126422 425 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Lire1P11260 Il1rn-205ENSMUST00000142093 321 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Lire1P11260 Gm25164-201ENSMUST00000158908 116 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Lire1P11260 Gm6507-201ENSMUST00000159767 652 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Lire1P11260 Phf11b-201ENSMUST00000166121 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Lire1P11260 Gm9286-201ENSMUST00000173586 508 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Lire1P11260 Smarca2-210ENSMUST00000176475 983 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Lire1P11260 Gm28782-201ENSMUST00000185980 414 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Lire1P11260 Stpg4-203ENSMUST00000187078 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Lire1P11260 Gm37689-201ENSMUST00000193139 275 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Lire1P11260 Ighv1-29-201ENSMUST00000194116 342 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Lire1P11260 Gm37173-201ENSMUST00000194498 1017 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Lire1P11260 Gm43387-201ENSMUST00000196896 1066 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Lire1P11260 Gm42424-201ENSMUST00000198319 376 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Lire1P11260 Gm18593-201ENSMUST00000200754 1139 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Lire1P11260 2210412B16Rik-201ENSMUST00000201281 498 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Lire1P11260 5033423K11Rik-202ENSMUST00000202802 1162 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Lire1P11260 Gm44621-201ENSMUST00000207643 1166 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Lire1P11260 Olfr706-201ENSMUST00000209025 1087 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Lire1P11260 Gm35520-201ENSMUST00000209235 784 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Lire1P11260 Gm45241-201ENSMUST00000211237 634 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Lire1P11260 Gm35998-201ENSMUST00000212862 838 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms