Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Olfr305-203ENSMUST00000213869 3530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
P10404 Mme-201ENSMUST00000029400 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
P10404 Gm16427-201ENSMUST00000179091 1449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
P10404 Lilrb4a-203ENSMUST00000219696 1441 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
P10404 Tmem45a2-203ENSMUST00000227043 1447 ntAPPRIS P1 BASIC6.48□□□□□ -1.37
P10404 Pnisr-201ENSMUST00000029911 4545 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
P10404 Vmn1r220-203ENSMUST00000227679 7868 ntAPPRIS P1 BASIC6.48□□□□□ -1.37
P10404 Vmn1r220-206ENSMUST00000228854 7854 ntAPPRIS P1 BASIC6.48□□□□□ -1.37
P10404 AC161884.1-201ENSMUST00000225436 2174 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
P10404 Gabpb2-202ENSMUST00000098873 8272 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
P10404 Ndst3-201ENSMUST00000029602 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
P10404 Slc26a2-201ENSMUST00000037603 2802 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
P10404 Srgap1-201ENSMUST00000020322 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
P10404 4931406B18Rik-203ENSMUST00000163619 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
P10404 Sncaip-206ENSMUST00000178678 3724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
P10404 Gm36283-203ENSMUST00000220211 3732 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
P10404 Dis3l-202ENSMUST00000113890 3224 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
P10404 Gm37786-201ENSMUST00000191714 3225 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
P10404 Ints2-202ENSMUST00000108039 4369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
P10404 Lrrc40-201ENSMUST00000072080 4142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
P10404 AC135119.1-202ENSMUST00000228435 2203 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
P10404 Olfr78-202ENSMUST00000168007 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
P10404 Fam160a1-201ENSMUST00000094148 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
P10404 Elavl4-207ENSMUST00000106603 3761 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
P10404 Cmtr2-201ENSMUST00000056972 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
P10404 Nat2-202ENSMUST00000163856 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
P10404 Cdh8-207ENSMUST00000155527 3159 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
P10404 Phc3-210ENSMUST00000177992 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
P10404 Gm45250-201ENSMUST00000209414 3592 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
P10404 Gm36380-201ENSMUST00000210339 4379 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
P10404 Adgrf1-201ENSMUST00000047399 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
P10404 Trim40-203ENSMUST00000172711 1539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
P10404 Bmpr1a-202ENSMUST00000165280 1945 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
P10404 Skil-202ENSMUST00000117728 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
P10404 Il18r1-205ENSMUST00000193793 1652 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
P10404 Rps27a-201ENSMUST00000102844 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
P10404 Gm22661-201ENSMUST00000104192 132 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
P10404 Gm14879-201ENSMUST00000117308 507 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
P10404 Gm15110-201ENSMUST00000117545 881 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
P10404 Olfr1073-ps1-201ENSMUST00000117635 381 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
P10404 Mgst1-202ENSMUST00000118091 1030 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
P10404 Gm15916-201ENSMUST00000118355 736 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
P10404 Gm15233-201ENSMUST00000118747 400 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
P10404 Gm11907-201ENSMUST00000118918 1007 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
P10404 Gm15785-201ENSMUST00000119145 694 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
P10404 Mgst1-203ENSMUST00000120230 1027 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
P10404 Gm8084-201ENSMUST00000120807 752 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
P10404 Gm12140-201ENSMUST00000121214 544 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
P10404 Gm13380-201ENSMUST00000124322 718 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
P10404 AI847159-203ENSMUST00000141786 915 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
P10404 Platr14-205ENSMUST00000146553 770 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
P10404 Fpr2-202ENSMUST00000149944 883 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
P10404 Gm22224-201ENSMUST00000157357 93 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
P10404 Gm26393-201ENSMUST00000157625 129 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
P10404 Gm24198-201ENSMUST00000157812 108 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
P10404 Gm23663-201ENSMUST00000158045 80 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
P10404 Spink10-206ENSMUST00000162511 684 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
P10404 Gm42936-201ENSMUST00000174019 652 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
P10404 Vmn1r25-201ENSMUST00000176572 1101 ntAPPRIS P1 BASIC6.47□□□□□ -1.37
P10404 Gm5698-201ENSMUST00000178317 724 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
P10404 Gm6526-202ENSMUST00000179860 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
P10404 Gm5798-202ENSMUST00000179987 582 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
P10404 6530411M01Rik-201ENSMUST00000181618 1033 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
P10404 Gm9149-201ENSMUST00000182724 1007 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
P10404 Gm6799-201ENSMUST00000186919 573 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
P10404 Ly6e-208ENSMUST00000188042 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
P10404 Gm7200-201ENSMUST00000188426 1163 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
P10404 Olfr318-201ENSMUST00000189911 1026 ntAPPRIS P1 BASIC6.47□□□□□ -1.37
P10404 Gm28639-201ENSMUST00000191519 481 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
P10404 Gm28548-201ENSMUST00000191599 409 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
P10404 Gm29739-201ENSMUST00000191760 529 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
P10404 Gm37381-202ENSMUST00000194643 657 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
P10404 Mllt11-202ENSMUST00000196025 624 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
P10404 Gm42538-201ENSMUST00000196233 566 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
P10404 Gm4872-201ENSMUST00000205210 1299 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
P10404 6720469O03Rik-201ENSMUST00000206785 1201 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
P10404 Gm18060-201ENSMUST00000207407 564 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
P10404 Gm6230-201ENSMUST00000208077 780 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
P10404 Smarca2-231ENSMUST00000208091 1140 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
P10404 Gm44833-201ENSMUST00000208368 331 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
P10404 Gm45658-201ENSMUST00000209197 580 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
P10404 Gm45299-201ENSMUST00000210199 420 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
P10404 Gm8556-201ENSMUST00000210437 664 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
P10404 Gm45900-201ENSMUST00000211879 409 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
P10404 Gm33103-201ENSMUST00000212717 527 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
P10404 Olfr950-ps1-201ENSMUST00000213804 878 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
P10404 AC154307.1-201ENSMUST00000214799 90 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
P10404 4930471E19Rik-202ENSMUST00000219150 737 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
P10404 AC153975.1-201ENSMUST00000220087 926 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
P10404 AC123920.1-201ENSMUST00000221449 384 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
P10404 AC154851.1-201ENSMUST00000221591 655 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
P10404 Anxa13-202ENSMUST00000227274 1201 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
P10404 AC122035.2-201ENSMUST00000228698 462 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
P10404 4930563M21Rik-201ENSMUST00000060468 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
P10404 Olfr818-201ENSMUST00000074308 957 ntAPPRIS P1 BASIC6.47□□□□□ -1.37
P10404 Olfr107-201ENSMUST00000077008 1033 ntAPPRIS P1 BASIC6.47□□□□□ -1.37
P10404 Gm4956-201ENSMUST00000082032 1148 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
P10404 Olfr1133-201ENSMUST00000099855 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.47□□□□□ -1.37
P10404 CT009711.1-201ENSMUST00000223992 3040 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
P10404 Olfr727-202ENSMUST00000215317 2616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.5 ms