Protein–RNA interactions for Protein: M0QWN7

Usp35, Ubiquitin-specific peptidase 35, mousemouse

Predictions only

Length 1,009 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp35M0QWN7 AC080021.1-201ENSMUST00000228104 700 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 5530400C23Rik-201ENSMUST00000048459 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 Olfr1491-201ENSMUST00000052737 960 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 Btn2a2-201ENSMUST00000041541 2226 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 Phc3-204ENSMUST00000108255 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 Gm11217-201ENSMUST00000141162 1729 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 Olfr1045-202ENSMUST00000215763 2960 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 A830010M20Rik-203ENSMUST00000100951 4545 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 Gm44186-201ENSMUST00000204118 2752 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 Gm8700-201ENSMUST00000222187 3054 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 Hipk3-203ENSMUST00000111125 3651 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 Gm44289-201ENSMUST00000204144 1390 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 Sirpb1c-202ENSMUST00000108349 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 Abca8b-201ENSMUST00000020948 7423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 Gm45112-201ENSMUST00000208576 5125 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 Utp20-201ENSMUST00000004470 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 Aass-201ENSMUST00000031707 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 Zfp184-201ENSMUST00000006903 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 Skap2-205ENSMUST00000204778 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 Gm28587-201ENSMUST00000187181 3005 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 5830444B04Rik-204ENSMUST00000166921 2870 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 9330159M07Rik-201ENSMUST00000180712 2702 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 Gm5946-202ENSMUST00000182652 2724 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 Vmn1r81-202ENSMUST00000227080 13256 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 Dock7-214ENSMUST00000205650 6297 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 Gimd1-203ENSMUST00000212594 1432 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 D6Ertd474e-201ENSMUST00000100817 2149 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 Gm10936-201ENSMUST00000105264 252 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 Cst8-202ENSMUST00000109947 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 Gm5752-201ENSMUST00000117771 594 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 Gm11858-201ENSMUST00000117935 838 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 Gm12879-201ENSMUST00000120003 1182 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 Gm26480-201ENSMUST00000122619 297 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 Trim30e-ps1-202ENSMUST00000151294 731 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 Cfap61-212ENSMUST00000152515 640 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 Gm16113-201ENSMUST00000159629 372 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 Gm15934-201ENSMUST00000162062 525 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 Mir7082-201ENSMUST00000183526 92 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 Mir378d-201ENSMUST00000184232 110 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 Gm27178-201ENSMUST00000184962 340 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 Gm8524-201ENSMUST00000186232 379 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 Gm29016-201ENSMUST00000187523 1013 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 Gm29349-201ENSMUST00000188692 174 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 Gm35801-201ENSMUST00000193927 479 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 Gm43655-201ENSMUST00000197367 222 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 Ccl24-202ENSMUST00000201401 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 Gpn1-206ENSMUST00000202394 631 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 Gm19039-201ENSMUST00000204363 575 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 Helt-202ENSMUST00000210652 1282 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 Rtp4-204ENSMUST00000211349 842 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 AC122273.1-202ENSMUST00000213884 695 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 Tgm4-206ENSMUST00000215247 951 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 Olfr1441-203ENSMUST00000216506 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 Gm2089-201ENSMUST00000218294 479 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 AC147615.1-201ENSMUST00000218914 441 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 Gm18960-201ENSMUST00000222962 713 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 AL591207.2-201ENSMUST00000222991 337 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 AC159205.2-201ENSMUST00000223759 816 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 AC154627.1-201ENSMUST00000228799 1286 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 Vmn1r89-201ENSMUST00000053008 951 ntAPPRIS P2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 3110018I06Rik-201ENSMUST00000082269 1005 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 Ccdc158-201ENSMUST00000060930 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 Gm10439-201ENSMUST00000101181 1977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 Olfr1294-202ENSMUST00000208675 1983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 CT025566.1-202ENSMUST00000224800 2511 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 Parp8-201ENSMUST00000022239 3098 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 Gm43557-201ENSMUST00000197100 2370 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 Cyp2j7-201ENSMUST00000162514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 Trpm3-202ENSMUST00000074770 6710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 Impact-201ENSMUST00000025290 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 Gm44956-201ENSMUST00000208277 2887 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 Gm8822-201ENSMUST00000118948 2347 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 Stk3-205ENSMUST00000226555 2730 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 Ogdh-203ENSMUST00000093350 4075 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 Slc22a29-201ENSMUST00000113298 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 Csmd1-201ENSMUST00000082104 14182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 Gm26544-201ENSMUST00000181404 2763 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 Zfp748-202ENSMUST00000181892 5293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 Brd8-201ENSMUST00000003876 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 Gria4-204ENSMUST00000212533 5207 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 Scaper-202ENSMUST00000214747 5231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 Gm31805-201ENSMUST00000211921 4031 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 Gm45876-201ENSMUST00000212698 2709 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 Gm31562-201ENSMUST00000213973 2747 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 Gm20767-202ENSMUST00000225683 1427 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 4930553P18Rik-201ENSMUST00000201164 1659 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 Zfp934-208ENSMUST00000222429 1653 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 Arhgap6-203ENSMUST00000112127 3973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 Lmbrd2-204ENSMUST00000227556 8099 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 Cul4b-202ENSMUST00000050083 3090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 Gm13983-201ENSMUST00000118018 865 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 Gm13798-201ENSMUST00000118285 139 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 Olfr1127-ps1-201ENSMUST00000119555 892 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 Rpl15-ps1-201ENSMUST00000120694 564 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 Gm12754-201ENSMUST00000121908 454 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 Gm15187-201ENSMUST00000122329 264 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 Gm5970-201ENSMUST00000131638 1216 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 Mir1930-201ENSMUST00000158799 84 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 Gm16138-201ENSMUST00000159341 821 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 Crxos-205ENSMUST00000171280 571 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.1 ms