Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 Gimap9-201ENSMUST00000054050 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Usp9yF8VPU6 Oscp1-201ENSMUST00000035497 5013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Usp9yF8VPU6 Ptpro-202ENSMUST00000167002 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Usp9yF8VPU6 Cep57l1-209ENSMUST00000189770 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Usp9yF8VPU6 Foxn3-201ENSMUST00000046859 7705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Usp9yF8VPU6 Med12-202ENSMUST00000087956 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Usp9yF8VPU6 C130071C03Rik-201ENSMUST00000131907 3590 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Usp9yF8VPU6 Olfr1417-203ENSMUST00000214887 3582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Usp9yF8VPU6 Olfr97-203ENSMUST00000213328 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Usp9yF8VPU6 Golgb1-202ENSMUST00000039855 10847 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Usp9yF8VPU6 A330049N07Rik-203ENSMUST00000220010 1989 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Usp9yF8VPU6 Rnf32-201ENSMUST00000001247 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Usp9yF8VPU6 Kmo-202ENSMUST00000097458 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Usp9yF8VPU6 Gm13610-201ENSMUST00000128298 951 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Usp9yF8VPU6 Mir3080-201ENSMUST00000175010 79 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Usp9yF8VPU6 Gm5139-201ENSMUST00000175943 249 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Usp9yF8VPU6 Stx5a-215ENSMUST00000176570 563 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Usp9yF8VPU6 Gm44366-201ENSMUST00000204933 674 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Usp9yF8VPU6 LOC665443-201ENSMUST00000212284 796 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Usp9yF8VPU6 AC163661.1-201ENSMUST00000216546 910 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Usp9yF8VPU6 Gm46192-201ENSMUST00000217894 326 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Usp9yF8VPU6 1700011L22Rik-201ENSMUST00000034109 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Usp9yF8VPU6 Olfr1501-201ENSMUST00000073966 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Usp9yF8VPU6 Gm23330-201ENSMUST00000082660 164 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Usp9yF8VPU6 Zfp2-201ENSMUST00000109128 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Usp9yF8VPU6 Gpbp1l1-201ENSMUST00000030460 3588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Usp9yF8VPU6 Olfr957-202ENSMUST00000216177 1726 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Usp9yF8VPU6 Olfr305-203ENSMUST00000213869 3530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Usp9yF8VPU6 2600014E21Rik-201ENSMUST00000186411 4805 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Usp9yF8VPU6 Olfr324-203ENSMUST00000216965 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Usp9yF8VPU6 Casr-202ENSMUST00000114847 4303 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Usp9yF8VPU6 Gm44121-201ENSMUST00000205169 2006 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Usp9yF8VPU6 Dcp1a-201ENSMUST00000022535 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Usp9yF8VPU6 Mgat4a-201ENSMUST00000042161 7030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Usp9yF8VPU6 Gm30655-202ENSMUST00000222732 2808 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Usp9yF8VPU6 Gm4806-201ENSMUST00000222704 1690 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Usp9yF8VPU6 Cd59a-203ENSMUST00000168176 1806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Usp9yF8VPU6 Plk4-202ENSMUST00000167556 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Usp9yF8VPU6 Gm21781-201ENSMUST00000178920 4838 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Usp9yF8VPU6 Hdac9-204ENSMUST00000209750 3204 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Usp9yF8VPU6 Aadac-201ENSMUST00000029325 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Usp9yF8VPU6 Pde1a-203ENSMUST00000102652 1646 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Usp9yF8VPU6 Il1rapl1-201ENSMUST00000078875 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Usp9yF8VPU6 Medag-202ENSMUST00000201083 2669 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Usp9yF8VPU6 AC155234.1-201ENSMUST00000225610 2823 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Usp9yF8VPU6 Greb1-212ENSMUST00000162112 8058 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Usp9yF8VPU6 Gm24855-201ENSMUST00000104848 97 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Usp9yF8VPU6 Olfr50-201ENSMUST00000112950 1157 ntAPPRIS P1 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Usp9yF8VPU6 Gm16423-201ENSMUST00000120078 947 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Usp9yF8VPU6 Rrm2b-203ENSMUST00000137636 900 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Usp9yF8VPU6 1600025M17Rik-201ENSMUST00000138262 666 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Usp9yF8VPU6 Olfr701-202ENSMUST00000166880 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Usp9yF8VPU6 Obox3-ps6-201ENSMUST00000176273 1005 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Usp9yF8VPU6 Obox3-ps5-201ENSMUST00000176412 1003 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Usp9yF8VPU6 Gm26729-201ENSMUST00000180744 352 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Usp9yF8VPU6 Eloc-206ENSMUST00000186948 641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Usp9yF8VPU6 Halr1-203ENSMUST00000189071 511 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Usp9yF8VPU6 Gm38254-201ENSMUST00000192276 1009 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Usp9yF8VPU6 Gm43383-201ENSMUST00000195981 469 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Usp9yF8VPU6 Gm43018-201ENSMUST00000198075 1275 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Usp9yF8VPU6 Gbp2-ps-201ENSMUST00000198870 1269 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Usp9yF8VPU6 Gm44768-201ENSMUST00000205719 393 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Usp9yF8VPU6 Spata9-201ENSMUST00000022081 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Usp9yF8VPU6 AC168056.2-201ENSMUST00000223591 269 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Usp9yF8VPU6 Vmn1r233-201ENSMUST00000056339 960 ntAPPRIS P1 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Usp9yF8VPU6 Pak7-202ENSMUST00000077200 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Usp9yF8VPU6 Zfp661-201ENSMUST00000077422 2765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Usp9yF8VPU6 Olfr547-201ENSMUST00000098229 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Usp9yF8VPU6 Ikbkg-201ENSMUST00000004330 6918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Usp9yF8VPU6 Gm35850-201ENSMUST00000210956 4653 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Usp9yF8VPU6 4930480K23Rik-201ENSMUST00000180465 3326 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Usp9yF8VPU6 Gm18305-201ENSMUST00000216532 2128 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Usp9yF8VPU6 Pcbp2-202ENSMUST00000078404 2829 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Usp9yF8VPU6 Kat6a-201ENSMUST00000044331 9113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Usp9yF8VPU6 Zscan21-204ENSMUST00000110960 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Usp9yF8VPU6 Cbll1-203ENSMUST00000101499 3900 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Usp9yF8VPU6 Dcn-202ENSMUST00000163448 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Usp9yF8VPU6 9330136K24Rik-201ENSMUST00000180842 2478 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Usp9yF8VPU6 Tcp1-ps1-201ENSMUST00000120941 1466 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Usp9yF8VPU6 Gm28867-201ENSMUST00000190194 2166 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Usp9yF8VPU6 Gm44007-201ENSMUST00000203845 2189 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Usp9yF8VPU6 Naip1-201ENSMUST00000022142 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Usp9yF8VPU6 Ifit1bl2-201ENSMUST00000087357 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Usp9yF8VPU6 Stc1-201ENSMUST00000014957 4197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Usp9yF8VPU6 Olfr1418-202ENSMUST00000214796 4046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Usp9yF8VPU6 Hydin-201ENSMUST00000043141 15783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Usp9yF8VPU6 Igkv9-120-201ENSMUST00000103316 353 ntAPPRIS P1 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Usp9yF8VPU6 Mir1188-201ENSMUST00000116756 120 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Usp9yF8VPU6 Gm15781-201ENSMUST00000120216 323 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Usp9yF8VPU6 Gm14376-201ENSMUST00000145297 297 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Usp9yF8VPU6 Ulbp1-201ENSMUST00000169796 1093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Usp9yF8VPU6 Gm7426-201ENSMUST00000179046 404 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Usp9yF8VPU6 Gm19065-202ENSMUST00000203910 1165 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Usp9yF8VPU6 Gm32172-201ENSMUST00000220029 633 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Usp9yF8VPU6 Snora21-201ENSMUST00000082967 137 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Usp9yF8VPU6 Vmn1r203-201ENSMUST00000091729 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Usp9yF8VPU6 Olfr1271-201ENSMUST00000099751 918 ntAPPRIS P1 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Usp9yF8VPU6 Gm44022-201ENSMUST00000203708 5429 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Usp9yF8VPU6 Pcdh15-208ENSMUST00000125006 4863 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Usp9yF8VPU6 Pcdh15-232ENSMUST00000177420 4878 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.6 ms