Protein–RNA interactions for Protein: B2RU40

Prrt4, Proline-rich transmembrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt4B2RU40 Gm26179-201ENSMUST00000177723 132 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Prrt4B2RU40 1700025F22Rik-203ENSMUST00000181284 562 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Prrt4B2RU40 Gm28070-201ENSMUST00000191502 445 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Prrt4B2RU40 Gm43656-201ENSMUST00000197882 434 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Prrt4B2RU40 Gm8539-201ENSMUST00000199822 501 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Prrt4B2RU40 Gm44431-201ENSMUST00000203500 413 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Prrt4B2RU40 Spin2g-202ENSMUST00000203586 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Prrt4B2RU40 Gm44020-201ENSMUST00000204618 664 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Prrt4B2RU40 Gm45042-201ENSMUST00000207377 211 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Prrt4B2RU40 Gm44849-201ENSMUST00000207595 484 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Prrt4B2RU40 Gm45100-201ENSMUST00000209153 391 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Prrt4B2RU40 Gm45878-201ENSMUST00000211839 241 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Prrt4B2RU40 Olfr852-ps1-201ENSMUST00000212273 226 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Prrt4B2RU40 Gm9231-201ENSMUST00000220817 1009 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Prrt4B2RU40 CT009713.1-201ENSMUST00000224828 853 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Prrt4B2RU40 AC096628.1-201ENSMUST00000226060 641 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Prrt4B2RU40 Olfr1491-201ENSMUST00000052737 960 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Prrt4B2RU40 Vmn1r231-201ENSMUST00000061278 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Prrt4B2RU40 Olfr1387-201ENSMUST00000073824 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Prrt4B2RU40 Tcl1b2-201ENSMUST00000081379 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Prrt4B2RU40 Gm22053-201ENSMUST00000083394 200 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Prrt4B2RU40 4921529L05Rik-201ENSMUST00000203047 1997 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Prrt4B2RU40 D030034A15Rik-201ENSMUST00000215835 3953 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Prrt4B2RU40 Focad-201ENSMUST00000097992 5791 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Prrt4B2RU40 Lpar6-201ENSMUST00000044405 5400 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Prrt4B2RU40 Glmn-203ENSMUST00000100949 1759 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Prrt4B2RU40 Slco6b1-202ENSMUST00000178359 1778 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Prrt4B2RU40 Stk3-205ENSMUST00000226555 2730 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Prrt4B2RU40 Gm15930-201ENSMUST00000156603 2037 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Prrt4B2RU40 Trip12-206ENSMUST00000186465 9590 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Prrt4B2RU40 Ncoa2-203ENSMUST00000081713 8171 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Prrt4B2RU40 Gm5084-202ENSMUST00000224064 3609 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Prrt4B2RU40 Gm38394-201ENSMUST00000179598 10156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Prrt4B2RU40 Kynu-203ENSMUST00000112826 1587 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Prrt4B2RU40 Fam205a4-201ENSMUST00000108026 4130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Prrt4B2RU40 Psg21-202ENSMUST00000182128 2066 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Prrt4B2RU40 Psg21-201ENSMUST00000094793 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Prrt4B2RU40 Stat1-201ENSMUST00000070968 5151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Prrt4B2RU40 Gm44626-201ENSMUST00000207035 2715 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Prrt4B2RU40 1700014D04Rik-203ENSMUST00000180139 3231 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Prrt4B2RU40 Pomp-202ENSMUST00000201120 3850 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Prrt4B2RU40 Rnf219-202ENSMUST00000227640 1632 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Prrt4B2RU40 Vmn1r22-206ENSMUST00000228905 2394 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Prrt4B2RU40 Nfib-201ENSMUST00000050872 8770 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Prrt4B2RU40 Gm38128-201ENSMUST00000192085 3250 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Prrt4B2RU40 Pus3-202ENSMUST00000121246 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Prrt4B2RU40 Gm10735-201ENSMUST00000099162 2943 ntAPPRIS P1 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Prrt4B2RU40 Olfr446-201ENSMUST00000101461 927 ntAPPRIS P1 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Prrt4B2RU40 Gm23437-201ENSMUST00000104036 127 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Prrt4B2RU40 Slc35a5-202ENSMUST00000114600 679 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Prrt4B2RU40 Fam107b-204ENSMUST00000115054 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Prrt4B2RU40 Gm11517-201ENSMUST00000119491 387 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Prrt4B2RU40 Gm11653-201ENSMUST00000119992 1009 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Prrt4B2RU40 Gm11257-201ENSMUST00000121313 315 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Prrt4B2RU40 Olfr75-ps1-201ENSMUST00000135477 938 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Prrt4B2RU40 Gm11672-201ENSMUST00000140380 645 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Prrt4B2RU40 Gm16093-201ENSMUST00000141455 392 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Prrt4B2RU40 2810403D21Rik-207ENSMUST00000152089 852 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Prrt4B2RU40 Mir1981-201ENSMUST00000157934 82 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Prrt4B2RU40 Klk1b7-ps-202ENSMUST00000183762 619 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Prrt4B2RU40 Gm28119-201ENSMUST00000185538 298 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Prrt4B2RU40 Gm5261-201ENSMUST00000185860 713 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Prrt4B2RU40 Gm29013-201ENSMUST00000187431 237 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Prrt4B2RU40 Gm18799-201ENSMUST00000189104 913 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Prrt4B2RU40 1700034P13Rik-204ENSMUST00000189431 555 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Prrt4B2RU40 Gm29369-201ENSMUST00000190674 615 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Prrt4B2RU40 Gm37996-201ENSMUST00000191859 367 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Prrt4B2RU40 Ighv10-4-201ENSMUST00000193702 299 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Prrt4B2RU40 Gm42673-201ENSMUST00000202676 337 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Prrt4B2RU40 Gm44971-201ENSMUST00000206192 337 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Prrt4B2RU40 Gm44722-201ENSMUST00000206473 436 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Prrt4B2RU40 Gm4247-201ENSMUST00000211441 1042 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Prrt4B2RU40 Gm45766-201ENSMUST00000211900 478 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Prrt4B2RU40 Gm7943-201ENSMUST00000212078 1034 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Prrt4B2RU40 Gm46191-201ENSMUST00000218899 433 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Prrt4B2RU40 Spata31-202ENSMUST00000221202 814 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Prrt4B2RU40 Smim15-204ENSMUST00000224390 645 ntAPPRIS P1 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Prrt4B2RU40 Gm21762-202ENSMUST00000225881 830 ntAPPRIS P1 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Prrt4B2RU40 AC123061.2-201ENSMUST00000226234 802 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Prrt4B2RU40 AC131100.2-201ENSMUST00000227701 998 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Prrt4B2RU40 Gkn1-201ENSMUST00000032129 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Prrt4B2RU40 Npm2-201ENSMUST00000062629 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Prrt4B2RU40 Olfr1447-201ENSMUST00000071484 1113 ntAPPRIS P1 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Prrt4B2RU40 Olfr961-201ENSMUST00000076548 949 ntAPPRIS P1 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Prrt4B2RU40 Olfr1446-201ENSMUST00000081236 1044 ntAPPRIS P1 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Prrt4B2RU40 Olfr1044-201ENSMUST00000099906 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Prrt4B2RU40 Abca8b-201ENSMUST00000020948 7423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Prrt4B2RU40 Olfr1396-204ENSMUST00000215553 4237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Prrt4B2RU40 Impg2-204ENSMUST00000160116 3992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Prrt4B2RU40 Vwde-201ENSMUST00000054530 3979 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Prrt4B2RU40 Copa-201ENSMUST00000027833 4351 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Prrt4B2RU40 Vmn2r-ps159-203ENSMUST00000189559 2560 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Prrt4B2RU40 Usp17lc-201ENSMUST00000079348 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Prrt4B2RU40 Mrpl48-208ENSMUST00000150042 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Prrt4B2RU40 Vmn1r11-202ENSMUST00000226968 2522 ntAPPRIS P2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Prrt4B2RU40 C130075A20Rik-201ENSMUST00000198178 4176 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Prrt4B2RU40 Trps1-204ENSMUST00000183757 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Prrt4B2RU40 Sestd1-202ENSMUST00000102660 8990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Prrt4B2RU40 Gm45322-201ENSMUST00000211642 1361 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Prrt4B2RU40 Zhx1-203ENSMUST00000175805 4839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms