Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ8

Cnga3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga3Q9JJZ8 Gen1-201ENSMUST00000166117 5268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Cnga3Q9JJZ8 Olfr1348-210ENSMUST00000214383 2582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Cnga3Q9JJZ8 Rab30-203ENSMUST00000107180 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Cnga3Q9JJZ8 Gm19272-202ENSMUST00000185181 2217 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Cnga3Q9JJZ8 Asap1-206ENSMUST00000175799 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Cnga3Q9JJZ8 6430584L05Rik-201ENSMUST00000204412 3151 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Cnga3Q9JJZ8 Cabyr-204ENSMUST00000121018 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Cnga3Q9JJZ8 Gm9575-201ENSMUST00000122140 1339 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Cnga3Q9JJZ8 Gm21284-201ENSMUST00000205532 3736 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Cnga3Q9JJZ8 Gabpb2-202ENSMUST00000098873 8272 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Cnga3Q9JJZ8 Slc22a6-201ENSMUST00000010250 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Cnga3Q9JJZ8 Fam47c-201ENSMUST00000105110 1639 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Cnga3Q9JJZ8 Gm28798-201ENSMUST00000186372 2161 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Cnga3Q9JJZ8 Gm28379-202ENSMUST00000187676 2896 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Cnga3Q9JJZ8 Ikzf5-201ENSMUST00000046306 4430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Cnga3Q9JJZ8 Vmn1r50-202ENSMUST00000089417 2059 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Cnga3Q9JJZ8 Gm6811-201ENSMUST00000169389 1533 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Cnga3Q9JJZ8 Vmn1r54-202ENSMUST00000226921 3234 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Cnga3Q9JJZ8 Scn3a-201ENSMUST00000066432 9560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Cnga3Q9JJZ8 Gm45084-201ENSMUST00000207096 1957 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Cnga3Q9JJZ8 Ighv1-53-201ENSMUST00000103523 351 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Cnga3Q9JJZ8 Ighv1-69-201ENSMUST00000103539 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Cnga3Q9JJZ8 Gm26079-201ENSMUST00000104066 133 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Cnga3Q9JJZ8 Gm24790-201ENSMUST00000104285 132 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Cnga3Q9JJZ8 Ccdc32-202ENSMUST00000110833 732 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Cnga3Q9JJZ8 Gm14870-201ENSMUST00000118414 156 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Cnga3Q9JJZ8 Gm13222-201ENSMUST00000119638 138 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Cnga3Q9JJZ8 Gm14038-201ENSMUST00000121500 807 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Cnga3Q9JJZ8 Gm5843-201ENSMUST00000121631 476 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Cnga3Q9JJZ8 Gm3810-201ENSMUST00000122413 476 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Cnga3Q9JJZ8 BB218582-201ENSMUST00000123623 1024 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Cnga3Q9JJZ8 St8sia3os-203ENSMUST00000127716 667 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Cnga3Q9JJZ8 Gm16152-201ENSMUST00000131663 872 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Cnga3Q9JJZ8 Gm21970-201ENSMUST00000160764 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Cnga3Q9JJZ8 Gm21761-201ENSMUST00000179502 516 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Cnga3Q9JJZ8 Gm28620-201ENSMUST00000190463 439 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Cnga3Q9JJZ8 Gm29508-202ENSMUST00000191414 710 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Cnga3Q9JJZ8 AC122844.1-201ENSMUST00000195971 107 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Cnga3Q9JJZ8 Gm29784-201ENSMUST00000196217 406 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Cnga3Q9JJZ8 Gm42626-201ENSMUST00000196866 1148 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Cnga3Q9JJZ8 4930526M16Rik-201ENSMUST00000197305 954 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Cnga3Q9JJZ8 Gm42443-201ENSMUST00000198084 1155 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Cnga3Q9JJZ8 Gm19088-201ENSMUST00000198800 566 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Cnga3Q9JJZ8 Gm18781-201ENSMUST00000211252 924 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Cnga3Q9JJZ8 AC163661.1-201ENSMUST00000216546 910 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Cnga3Q9JJZ8 Sfrp4-204ENSMUST00000222992 1062 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Cnga3Q9JJZ8 AC107663.1-201ENSMUST00000224257 468 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Cnga3Q9JJZ8 Il20-201ENSMUST00000027673 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Cnga3Q9JJZ8 Zfp865-202ENSMUST00000076791 1129 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Cnga3Q9JJZ8 Gm9839-201ENSMUST00000195252 1437 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Cnga3Q9JJZ8 Nlrp1c-ps-202ENSMUST00000174668 3422 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Cnga3Q9JJZ8 Adsl-201ENSMUST00000023043 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Cnga3Q9JJZ8 Dclk1-202ENSMUST00000070418 7012 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Cnga3Q9JJZ8 Gm38178-201ENSMUST00000194502 2471 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Cnga3Q9JJZ8 Rlim-201ENSMUST00000070705 7429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Cnga3Q9JJZ8 Gm21781-201ENSMUST00000178920 4838 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Cnga3Q9JJZ8 Gm28993-201ENSMUST00000186236 1499 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Cnga3Q9JJZ8 Gm37870-201ENSMUST00000192349 1499 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Cnga3Q9JJZ8 Gm37467-202ENSMUST00000192785 1499 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Cnga3Q9JJZ8 Gm37252-201ENSMUST00000195063 1499 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Cnga3Q9JJZ8 Gm38013-202ENSMUST00000195453 1499 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Cnga3Q9JJZ8 Gm37286-201ENSMUST00000195885 1499 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Cnga3Q9JJZ8 Olfr131-203ENSMUST00000215940 1614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Cnga3Q9JJZ8 Bglap3-202ENSMUST00000107542 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Cnga3Q9JJZ8 Vmn1r57-204ENSMUST00000228062 2365 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Cnga3Q9JJZ8 Tbp-211ENSMUST00000162505 12794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Cnga3Q9JJZ8 Synb-201ENSMUST00000059362 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Cnga3Q9JJZ8 Gm12292-201ENSMUST00000122911 2433 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Cnga3Q9JJZ8 Mapre2-202ENSMUST00000115830 2496 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Cnga3Q9JJZ8 Zfp935-202ENSMUST00000221747 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Cnga3Q9JJZ8 Brwd3-205ENSMUST00000150434 11619 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Cnga3Q9JJZ8 Gm45112-201ENSMUST00000208576 5125 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Cnga3Q9JJZ8 Gm3139-203ENSMUST00000202642 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Cnga3Q9JJZ8 Krcc1-202ENSMUST00000168700 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Cnga3Q9JJZ8 Psd3-203ENSMUST00000093468 1739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Cnga3Q9JJZ8 Colec10-201ENSMUST00000036737 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Cnga3Q9JJZ8 Pabpc4l-201ENSMUST00000166505 5218 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Cnga3Q9JJZ8 Gm23979-201ENSMUST00000104071 128 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Cnga3Q9JJZ8 Gm8534-201ENSMUST00000118553 766 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Cnga3Q9JJZ8 Gm15149-201ENSMUST00000119370 360 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Cnga3Q9JJZ8 Gm11245-201ENSMUST00000119419 1037 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Cnga3Q9JJZ8 Gm7113-201ENSMUST00000120477 958 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Cnga3Q9JJZ8 Gm11882-201ENSMUST00000121463 506 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Cnga3Q9JJZ8 1700025O08Rik-201ENSMUST00000123729 456 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Cnga3Q9JJZ8 Gm15935-202ENSMUST00000141656 298 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Cnga3Q9JJZ8 Gm11335-201ENSMUST00000148743 1080 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Cnga3Q9JJZ8 Gm25989-201ENSMUST00000158761 133 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Cnga3Q9JJZ8 Gm6401-202ENSMUST00000164232 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Cnga3Q9JJZ8 Gm17079-201ENSMUST00000167231 666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Cnga3Q9JJZ8 Mir7212-201ENSMUST00000184098 61 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Cnga3Q9JJZ8 Gm27299-201ENSMUST00000184593 103 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Cnga3Q9JJZ8 1700102P08Rik-202ENSMUST00000192995 658 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Cnga3Q9JJZ8 Gm17918-201ENSMUST00000205315 574 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Cnga3Q9JJZ8 Gm45693-201ENSMUST00000211391 1157 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Cnga3Q9JJZ8 AC069561.1-201ENSMUST00000213750 424 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Cnga3Q9JJZ8 AC165349.1-201ENSMUST00000217896 424 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Cnga3Q9JJZ8 Gm17849-201ENSMUST00000219788 853 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Cnga3Q9JJZ8 Gm5928-201ENSMUST00000221839 466 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Cnga3Q9JJZ8 AC154573.2-201ENSMUST00000224174 378 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Cnga3Q9JJZ8 CT009527.2-201ENSMUST00000225386 606 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.8 ms