Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES64

Ush1c, Harmonin, mousemouse

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Length 910 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ush1cQ9ES64 Gm44225-201ENSMUST00000203582 186 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
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Ush1cQ9ES64 Gm20751-201ENSMUST00000210260 1270 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Ush1cQ9ES64 Gm6581-201ENSMUST00000214545 260 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Ush1cQ9ES64 Gm34047-201ENSMUST00000223547 606 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Ush1cQ9ES64 n-R5s60-201ENSMUST00000083299 119 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Ush1cQ9ES64 Sry-201ENSMUST00000091178 1188 ntAPPRIS P1 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Ush1cQ9ES64 Rhox4b-201ENSMUST00000096458 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
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Ush1cQ9ES64 Cct8-203ENSMUST00000175977 1470 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Ush1cQ9ES64 Gm4994-201ENSMUST00000118379 2187 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
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Ush1cQ9ES64 Gm765-201ENSMUST00000164491 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Ush1cQ9ES64 Gm11346-204ENSMUST00000149751 2893 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Ush1cQ9ES64 Gm37163-201ENSMUST00000195439 1690 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Ush1cQ9ES64 Gm10601-201ENSMUST00000120436 1422 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Ush1cQ9ES64 Gm10165-201ENSMUST00000217666 2380 ntTSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
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Ush1cQ9ES64 Tpk1-203ENSMUST00000114644 2148 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Ush1cQ9ES64 Pln-206ENSMUST00000220197 1854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Ush1cQ9ES64 Fap-209ENSMUST00000174448 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
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Ush1cQ9ES64 Skil-203ENSMUST00000118204 2904 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
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Ush1cQ9ES64 Olfr286-201ENSMUST00000073612 3821 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
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Ush1cQ9ES64 Sptlc3-201ENSMUST00000047370 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
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Ush1cQ9ES64 Sytl2-202ENSMUST00000107210 3718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Ush1cQ9ES64 Palmd-202ENSMUST00000119557 3305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Ush1cQ9ES64 Scd4-201ENSMUST00000058856 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Ush1cQ9ES64 Fkbp15-202ENSMUST00000084528 3329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Ush1cQ9ES64 Clock-204ENSMUST00000202122 5508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Ush1cQ9ES64 Pdzph1-201ENSMUST00000025064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Ush1cQ9ES64 Nfatc3-206ENSMUST00000212742 3207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Ush1cQ9ES64 Hnrnpc-207ENSMUST00000227536 1301 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Ush1cQ9ES64 Zc4h2-202ENSMUST00000119640 2075 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
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Ush1cQ9ES64 AC131747.2-201ENSMUST00000226121 1895 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Ush1cQ9ES64 Pramel7-201ENSMUST00000026957 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Ush1cQ9ES64 Zfp788-203ENSMUST00000100275 3177 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Ush1cQ9ES64 Gm10636-201ENSMUST00000197639 2419 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Ush1cQ9ES64 Gm36947-201ENSMUST00000194709 2249 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Ush1cQ9ES64 Nmur2-201ENSMUST00000037682 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Ush1cQ9ES64 Psd3-206ENSMUST00000120071 9203 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Ush1cQ9ES64 Trbv1-201ENSMUST00000103262 417 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Ush1cQ9ES64 Igkv14-126-201ENSMUST00000103310 358 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Ush1cQ9ES64 Gm13871-201ENSMUST00000107318 936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Ush1cQ9ES64 Gm11757-201ENSMUST00000107320 936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Ush1cQ9ES64 Gm11758-201ENSMUST00000107326 936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
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