Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Z1

Nop56, Nucleolar protein 56, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 580 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop56Q9D6Z1 4930545L23Rik-201ENSMUST00000138303 2502 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
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Nop56Q9D6Z1 Spire1-201ENSMUST00000045105 5033 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Nop56Q9D6Z1 Zfp729a-201ENSMUST00000012314 9455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Nop56Q9D6Z1 Fbxw21-203ENSMUST00000198076 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Nop56Q9D6Z1 Svil-201ENSMUST00000025079 7433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
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Nop56Q9D6Z1 BC028471-203ENSMUST00000202022 4113 ntTSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Nop56Q9D6Z1 Sh3rf2-202ENSMUST00000074679 4444 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Nop56Q9D6Z1 Cyp2c69-201ENSMUST00000168838 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Nop56Q9D6Z1 Ptgfr-202ENSMUST00000106126 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
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Nop56Q9D6Z1 A930038B10Rik-201ENSMUST00000180412 4084 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
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Nop56Q9D6Z1 Rsrc1-209ENSMUST00000162693 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
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Nop56Q9D6Z1 Gm8323-201ENSMUST00000168436 1201 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Nop56Q9D6Z1 Gm21293-201ENSMUST00000170919 864 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Nop56Q9D6Z1 Commd3-212ENSMUST00000171845 938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Nop56Q9D6Z1 Vmn2r-ps114-201ENSMUST00000177016 1280 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
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Nop56Q9D6Z1 Gm28908-201ENSMUST00000189002 356 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Nop56Q9D6Z1 Gm29078-201ENSMUST00000190611 356 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Nop56Q9D6Z1 4930563F08Rik-201ENSMUST00000198640 515 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
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Nop56Q9D6Z1 Kif15-201ENSMUST00000040717 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Nop56Q9D6Z1 Zfp473-204ENSMUST00000120798 3559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
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Nop56Q9D6Z1 Cxcr6-201ENSMUST00000049810 1897 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Nop56Q9D6Z1 Tmc2-201ENSMUST00000077988 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Nop56Q9D6Z1 Myct1-201ENSMUST00000051809 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Nop56Q9D6Z1 AC169985.1-201ENSMUST00000223648 2439 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Nop56Q9D6Z1 Npffr2-201ENSMUST00000048557 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Nop56Q9D6Z1 Alpk1-206ENSMUST00000198955 4498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Nop56Q9D6Z1 Akap9-201ENSMUST00000044492 13123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Nop56Q9D6Z1 Ceacam15-201ENSMUST00000108498 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Nop56Q9D6Z1 Gm37100-201ENSMUST00000193344 1353 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Nop56Q9D6Z1 Scp2-ps2-203ENSMUST00000216438 1370 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Nop56Q9D6Z1 Arid5b-203ENSMUST00000218532 3025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Nop56Q9D6Z1 Ep400-201ENSMUST00000041558 10608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Nop56Q9D6Z1 Gm21036-201ENSMUST00000207544 2611 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Nop56Q9D6Z1 Gm44186-201ENSMUST00000204118 2752 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Nop56Q9D6Z1 Vmn1r198-204ENSMUST00000227167 5990 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Nop56Q9D6Z1 Unc13c-202ENSMUST00000184666 8796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Nop56Q9D6Z1 Nxt2-204ENSMUST00000112916 2532 ntTSL 3 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Nop56Q9D6Z1 Gm19176-201ENSMUST00000222149 1831 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Nop56Q9D6Z1 Ighj1-201ENSMUST00000103430 53 ntAPPRIS P1 BASIC7.74□□□□□ -1.17
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