Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEG0

Ccdc71, Coiled-coil domain-containing protein 71, mousemouse

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Length 433 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc71Q8VEG0 Scaper-202ENSMUST00000214747 5231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ccdc71Q8VEG0 C8a-203ENSMUST00000106808 3539 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ccdc71Q8VEG0 Gm7980-201ENSMUST00000168107 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ccdc71Q8VEG0 Olfr1122-202ENSMUST00000215371 5036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ccdc71Q8VEG0 4930404I05Rik-201ENSMUST00000125902 2675 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ccdc71Q8VEG0 Gm38386-201ENSMUST00000194293 3421 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Ccdc71Q8VEG0 Cbll1-203ENSMUST00000101499 3900 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ccdc71Q8VEG0 Patj-204ENSMUST00000107029 4342 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ccdc71Q8VEG0 Pum2-204ENSMUST00000163569 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ccdc71Q8VEG0 Mak-206ENSMUST00000225084 3573 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ccdc71Q8VEG0 Tmcc3-203ENSMUST00000117929 3317 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ccdc71Q8VEG0 AC140280.1-201ENSMUST00000227826 1847 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Ccdc71Q8VEG0 Actl11-201ENSMUST00000085073 3993 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ccdc71Q8VEG0 Bdnf-211ENSMUST00000176893 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ccdc71Q8VEG0 Mcm10-201ENSMUST00000027980 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ccdc71Q8VEG0 Zfp37-204ENSMUST00000220873 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ccdc71Q8VEG0 Tek-202ENSMUST00000073939 4549 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ccdc71Q8VEG0 Apobec3-203ENSMUST00000165537 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Ccdc71Q8VEG0 Tnik-214ENSMUST00000162485 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Ccdc71Q8VEG0 Casr-202ENSMUST00000114847 4303 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Ccdc71Q8VEG0 C87436-201ENSMUST00000050497 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Ccdc71Q8VEG0 Olfr770-203ENSMUST00000204250 1644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Ccdc71Q8VEG0 E330034G19Rik-204ENSMUST00000162224 1350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Ccdc71Q8VEG0 Scn3a-201ENSMUST00000066432 9560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Ccdc71Q8VEG0 Scd1-201ENSMUST00000041331 4836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Ccdc71Q8VEG0 Olfr239-203ENSMUST00000214406 3773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Ccdc71Q8VEG0 Gm39214-201ENSMUST00000210912 1542 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Ccdc71Q8VEG0 Pecam1-202ENSMUST00000080853 3283 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Ccdc71Q8VEG0 Gm37902-201ENSMUST00000192839 1683 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Ccdc71Q8VEG0 Phc1-208ENSMUST00000160696 4213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Ccdc71Q8VEG0 Olfr358-201ENSMUST00000100146 1059 ntAPPRIS P1 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Ccdc71Q8VEG0 Igkv9-120-201ENSMUST00000103316 353 ntAPPRIS P1 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Ccdc71Q8VEG0 Snora35-201ENSMUST00000104579 128 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Ccdc71Q8VEG0 Gm13265-201ENSMUST00000118090 421 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Ccdc71Q8VEG0 Gm7058-201ENSMUST00000119209 902 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Ccdc71Q8VEG0 Gm13578-201ENSMUST00000120849 590 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Ccdc71Q8VEG0 Gm15300-201ENSMUST00000122324 279 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Ccdc71Q8VEG0 Fthl17-ps3-201ENSMUST00000126259 513 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Ccdc71Q8VEG0 Gm26410-201ENSMUST00000157670 261 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Ccdc71Q8VEG0 Gm24687-201ENSMUST00000157758 241 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Ccdc71Q8VEG0 Lrrc4-202ENSMUST00000171353 883 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Ccdc71Q8VEG0 1700120O09Rik-201ENSMUST00000177127 977 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Ccdc71Q8VEG0 Ccl27b-201ENSMUST00000177785 425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Ccdc71Q8VEG0 Gm23450-201ENSMUST00000178285 91 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Ccdc71Q8VEG0 Gm27005-201ENSMUST00000182783 921 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Ccdc71Q8VEG0 Mocs2-217ENSMUST00000184781 1250 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Ccdc71Q8VEG0 Gm18700-201ENSMUST00000185791 553 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Ccdc71Q8VEG0 2310008N11Rik-201ENSMUST00000189978 568 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Ccdc71Q8VEG0 Gm30708-201ENSMUST00000202183 312 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Ccdc71Q8VEG0 Gm44075-201ENSMUST00000204208 216 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Ccdc71Q8VEG0 2310008N11Rik-203ENSMUST00000210732 601 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Ccdc71Q8VEG0 AC112680.2-201ENSMUST00000213119 595 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Ccdc71Q8VEG0 Gm5831-201ENSMUST00000216016 1209 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Ccdc71Q8VEG0 Gm4803-201ENSMUST00000218729 1279 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Ccdc71Q8VEG0 AC122327.2-201ENSMUST00000220883 120 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Ccdc71Q8VEG0 AC122327.3-201ENSMUST00000221852 120 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
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Ccdc71Q8VEG0 Clec2g-202ENSMUST00000075789 729 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
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Ccdc71Q8VEG0 Nyap2-201ENSMUST00000068275 4919 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
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Ccdc71Q8VEG0 Fmn1-209ENSMUST00000161731 4262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
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Ccdc71Q8VEG0 Abraxas2-201ENSMUST00000084497 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Ccdc71Q8VEG0 Mageb18-202ENSMUST00000113955 2163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Ccdc71Q8VEG0 Pira2-201ENSMUST00000108615 3462 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Ccdc71Q8VEG0 Gm15922-201ENSMUST00000118068 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Ccdc71Q8VEG0 Rian-209ENSMUST00000182406 3476 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Ccdc71Q8VEG0 Prokr2-204ENSMUST00000142766 3932 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Ccdc71Q8VEG0 A930038B10Rik-201ENSMUST00000180412 4084 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Ccdc71Q8VEG0 Tmem56-201ENSMUST00000029777 6248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Ccdc71Q8VEG0 Chil4-201ENSMUST00000082219 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Ccdc71Q8VEG0 Rprd2-201ENSMUST00000090791 7756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Ccdc71Q8VEG0 Aktip-204ENSMUST00000120426 1687 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Ccdc71Q8VEG0 Trp63-202ENSMUST00000065523 5257 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Ccdc71Q8VEG0 Gm24048-201ENSMUST00000102411 106 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Ccdc71Q8VEG0 Rps13-ps6-201ENSMUST00000120038 428 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Ccdc71Q8VEG0 Gm11622-201ENSMUST00000120525 691 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Ccdc71Q8VEG0 Gm11217-201ENSMUST00000141162 1729 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Ccdc71Q8VEG0 Gm8837-201ENSMUST00000161037 1107 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Ccdc71Q8VEG0 Speer1-201ENSMUST00000172106 1123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Ccdc71Q8VEG0 Gm20491-201ENSMUST00000173765 1241 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Ccdc71Q8VEG0 Gm20475-201ENSMUST00000174884 263 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Ccdc71Q8VEG0 Gm29612-201ENSMUST00000191490 2168 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Ccdc71Q8VEG0 Gm37974-201ENSMUST00000193668 220 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Ccdc71Q8VEG0 4930590H14Rik-201ENSMUST00000193999 551 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Ccdc71Q8VEG0 Slamf7-205ENSMUST00000194791 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Ccdc71Q8VEG0 Gm37068-201ENSMUST00000195168 640 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Ccdc71Q8VEG0 Olrf445-ps1-201ENSMUST00000204960 314 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
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