Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z2

Prpf39, Pre-mRNA-processing factor 39, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf39Q8K2Z2 Olfr1224-ps1-202ENSMUST00000099793 1212 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Prpf39Q8K2Z2 Clcn5-201ENSMUST00000004428 8390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Prpf39Q8K2Z2 Olfr311-203ENSMUST00000216473 2961 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Prpf39Q8K2Z2 Saa4-201ENSMUST00000006952 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Prpf39Q8K2Z2 Vmn1r50-202ENSMUST00000089417 2059 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Prpf39Q8K2Z2 Tcf7l2-209ENSMUST00000111656 3629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Prpf39Q8K2Z2 Gm45297-201ENSMUST00000209893 3483 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Prpf39Q8K2Z2 Fam47c-201ENSMUST00000105110 1639 ntAPPRIS P1 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Prpf39Q8K2Z2 Gm18508-201ENSMUST00000215790 1642 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Prpf39Q8K2Z2 4933427D14Rik-201ENSMUST00000108505 1495 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Prpf39Q8K2Z2 Angptl1-202ENSMUST00000111720 1332 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Prpf39Q8K2Z2 Osbpl9-214ENSMUST00000160774 2765 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Prpf39Q8K2Z2 Zfp110-205ENSMUST00000168247 2499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.29
Prpf39Q8K2Z2 Rrh-201ENSMUST00000029648 1506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
Prpf39Q8K2Z2 Ccdc191-203ENSMUST00000132859 3779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.29
Prpf39Q8K2Z2 Unc13c-202ENSMUST00000184666 8796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.29
Prpf39Q8K2Z2 Fam205a4-201ENSMUST00000108026 4130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.29
Prpf39Q8K2Z2 AC120347.2-201ENSMUST00000222224 2015 ntBASIC6.96□□□□□ -1.29
Prpf39Q8K2Z2 Pcdh15-205ENSMUST00000105429 6719 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.29
Prpf39Q8K2Z2 Arhgap32-203ENSMUST00000174641 13568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.29
Prpf39Q8K2Z2 Olfr694-203ENSMUST00000216118 5035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.29
Prpf39Q8K2Z2 Fancd2-208ENSMUST00000204827 4707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
Prpf39Q8K2Z2 Med23-202ENSMUST00000092646 5098 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
Prpf39Q8K2Z2 Dthd1-201ENSMUST00000170704 2427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Prpf39Q8K2Z2 Foxp1-206ENSMUST00000113326 7029 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Prpf39Q8K2Z2 Mir674-201ENSMUST00000102421 100 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Prpf39Q8K2Z2 Ighv1-53-201ENSMUST00000103523 351 ntAPPRIS P1 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Prpf39Q8K2Z2 Ighv1-69-201ENSMUST00000103539 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Prpf39Q8K2Z2 Gm26079-201ENSMUST00000104066 133 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Prpf39Q8K2Z2 Gm2178-201ENSMUST00000104927 357 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Prpf39Q8K2Z2 Gm13983-201ENSMUST00000118018 865 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Prpf39Q8K2Z2 Gm13265-201ENSMUST00000118090 421 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Prpf39Q8K2Z2 Rps13-ps6-201ENSMUST00000120038 428 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Prpf39Q8K2Z2 Mgst1-204ENSMUST00000120302 559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Prpf39Q8K2Z2 Gm11335-201ENSMUST00000148743 1080 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Prpf39Q8K2Z2 Gtsf1-209ENSMUST00000153930 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Prpf39Q8K2Z2 Gm22915-201ENSMUST00000157615 136 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Prpf39Q8K2Z2 Gm24781-201ENSMUST00000157636 117 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Prpf39Q8K2Z2 Gm20690-201ENSMUST00000177341 315 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Prpf39Q8K2Z2 Gm27156-201ENSMUST00000184589 754 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Prpf39Q8K2Z2 Mir6987-201ENSMUST00000184789 73 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Prpf39Q8K2Z2 Gm29353-201ENSMUST00000185801 620 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Prpf39Q8K2Z2 Gm29508-202ENSMUST00000191414 710 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Prpf39Q8K2Z2 Ighv1-21-201ENSMUST00000194856 351 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Prpf39Q8K2Z2 Gm34144-201ENSMUST00000197039 259 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Prpf39Q8K2Z2 Gm7463-201ENSMUST00000201541 547 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Prpf39Q8K2Z2 Gm3549-201ENSMUST00000203873 794 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Prpf39Q8K2Z2 Gm44411-201ENSMUST00000204172 349 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Prpf39Q8K2Z2 Gm31036-201ENSMUST00000212925 521 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Prpf39Q8K2Z2 AC164881.1-201ENSMUST00000215648 664 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Prpf39Q8K2Z2 Erh-204ENSMUST00000218364 665 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Prpf39Q8K2Z2 Gm2754-201ENSMUST00000223383 589 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Prpf39Q8K2Z2 Lalba-201ENSMUST00000023726 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Prpf39Q8K2Z2 Gm26899-201ENSMUST00000181963 3328 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Prpf39Q8K2Z2 6430584L05Rik-201ENSMUST00000204412 3151 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Prpf39Q8K2Z2 Olfr1426-202ENSMUST00000208703 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Prpf39Q8K2Z2 Gm26530-201ENSMUST00000180969 3941 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Prpf39Q8K2Z2 Adh7-201ENSMUST00000090171 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Prpf39Q8K2Z2 Zfp934-209ENSMUST00000222746 2206 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Prpf39Q8K2Z2 Ttll6-201ENSMUST00000107680 3485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Prpf39Q8K2Z2 Gm37953-201ENSMUST00000195293 1884 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Prpf39Q8K2Z2 AC152922.2-201ENSMUST00000213353 3879 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Prpf39Q8K2Z2 Vmn1r176-204ENSMUST00000227129 2955 ntAPPRIS P1 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Prpf39Q8K2Z2 Vmn1r176-207ENSMUST00000228793 2959 ntAPPRIS P1 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Prpf39Q8K2Z2 Gm8878-201ENSMUST00000173552 1725 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Prpf39Q8K2Z2 Aass-201ENSMUST00000031707 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Prpf39Q8K2Z2 Npy2r-201ENSMUST00000029633 3364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Prpf39Q8K2Z2 Gsdmc4-201ENSMUST00000063530 1988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Prpf39Q8K2Z2 Vamp4-207ENSMUST00000155003 1428 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Prpf39Q8K2Z2 Gm44661-201ENSMUST00000208830 3503 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Prpf39Q8K2Z2 P2ry14-203ENSMUST00000196081 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Prpf39Q8K2Z2 AC122305.1-201ENSMUST00000214803 3921 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Prpf39Q8K2Z2 Gm26981-201ENSMUST00000182453 3169 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Prpf39Q8K2Z2 Gm17039-201ENSMUST00000165145 4901 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Prpf39Q8K2Z2 Cfap61-206ENSMUST00000133433 3998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Prpf39Q8K2Z2 Trappc8-206ENSMUST00000225661 5191 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Prpf39Q8K2Z2 Igkv8-24-201ENSMUST00000103384 365 ntAPPRIS P1 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Prpf39Q8K2Z2 Gm13739-201ENSMUST00000118020 530 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Prpf39Q8K2Z2 Gm6987-201ENSMUST00000119319 428 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Prpf39Q8K2Z2 Gm16330-201ENSMUST00000128324 297 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Prpf39Q8K2Z2 Etfbkmt-207ENSMUST00000147934 1092 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Prpf39Q8K2Z2 Tmbim6-203ENSMUST00000159531 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Prpf39Q8K2Z2 Gm25617-201ENSMUST00000179548 133 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Prpf39Q8K2Z2 Gm29197-201ENSMUST00000185922 702 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Prpf39Q8K2Z2 Gm28846-201ENSMUST00000189161 368 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Prpf39Q8K2Z2 Gm8883-204ENSMUST00000189680 699 ntTSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Prpf39Q8K2Z2 Gm10640-202ENSMUST00000190947 1134 ntTSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Prpf39Q8K2Z2 Gm43396-201ENSMUST00000197506 706 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Prpf39Q8K2Z2 Gm25617-202ENSMUST00000198387 132 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Prpf39Q8K2Z2 Gm43377-201ENSMUST00000201640 455 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Prpf39Q8K2Z2 Gm7712-201ENSMUST00000222214 337 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Prpf39Q8K2Z2 Gm35619-201ENSMUST00000222548 600 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Prpf39Q8K2Z2 AC151730.1-201ENSMUST00000226106 448 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Prpf39Q8K2Z2 Cd48-202ENSMUST00000068584 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Prpf39Q8K2Z2 Olfr1129-201ENSMUST00000081034 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Prpf39Q8K2Z2 Gm23054-201ENSMUST00000082804 162 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Prpf39Q8K2Z2 Bglap2-201ENSMUST00000098956 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Prpf39Q8K2Z2 Gm28993-201ENSMUST00000186236 1499 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Prpf39Q8K2Z2 Gm37870-201ENSMUST00000192349 1499 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Prpf39Q8K2Z2 Gm37467-202ENSMUST00000192785 1499 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.3 ms