Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 Gm765-201ENSMUST00000164491 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Usp27Q8CEG8 Gm16503-201ENSMUST00000104964 3283 ntAPPRIS P1 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Usp27Q8CEG8 Gm23437-201ENSMUST00000104036 127 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Usp27Q8CEG8 Cd209d-201ENSMUST00000011445 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
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Usp27Q8CEG8 Gm16297-201ENSMUST00000161466 459 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
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Usp27Q8CEG8 Gm23018-201ENSMUST00000177928 109 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
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Usp27Q8CEG8 Gm34144-201ENSMUST00000197039 259 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
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Usp27Q8CEG8 Tarm1-202ENSMUST00000203020 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Usp27Q8CEG8 Fancd2-208ENSMUST00000204827 4707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
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Usp27Q8CEG8 Tdo2-204ENSMUST00000193879 1616 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
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Usp27Q8CEG8 Uqcrh-201ENSMUST00000050580 402 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
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Usp27Q8CEG8 Uqcrh-202ENSMUST00000078676 547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
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Usp27Q8CEG8 Efcab14-201ENSMUST00000074425 4300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
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Usp27Q8CEG8 Gm32717-201ENSMUST00000219147 2409 ntAPPRIS P1 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Usp27Q8CEG8 Gm9029-201ENSMUST00000219232 2410 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Usp27Q8CEG8 Gm32802-201ENSMUST00000219565 2409 ntAPPRIS P1 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Usp27Q8CEG8 Gm9045-201ENSMUST00000219760 2409 ntAPPRIS P1 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Usp27Q8CEG8 Zfp426-203ENSMUST00000163348 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Usp27Q8CEG8 Tank-205ENSMUST00000112502 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Usp27Q8CEG8 Zfp27-202ENSMUST00000159920 3381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Usp27Q8CEG8 Tank-201ENSMUST00000078074 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
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