Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEC0

Nup88, Nuclear pore complex protein Nup88, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 753 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup88Q8CEC0 Gm9046-201ENSMUST00000218329 2409 ntAPPRIS P1 BASIC7.9□□□□□ -1.15
Nup88Q8CEC0 Kcnj16-201ENSMUST00000106635 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
Nup88Q8CEC0 Smim15-201ENSMUST00000095458 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
Nup88Q8CEC0 Arl5b-201ENSMUST00000017562 6933 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Nup88Q8CEC0 Olfr458-202ENSMUST00000216650 1799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Nup88Q8CEC0 Olfr1390-202ENSMUST00000215014 2875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Nup88Q8CEC0 AC144772.2-201ENSMUST00000228830 2859 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Nup88Q8CEC0 Ntrk3-202ENSMUST00000039438 3977 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Nup88Q8CEC0 AC107763.1-202ENSMUST00000225021 2663 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Nup88Q8CEC0 Olfr972-203ENSMUST00000216167 1522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Nup88Q8CEC0 Gm43279-201ENSMUST00000202376 2512 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Nup88Q8CEC0 Olfr60-205ENSMUST00000216027 3300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Nup88Q8CEC0 Gm12573-201ENSMUST00000118158 286 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Nup88Q8CEC0 Gm13754-201ENSMUST00000120486 998 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Nup88Q8CEC0 1700026D11Rik-203ENSMUST00000144501 535 ntTSL 3 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Nup88Q8CEC0 Gm13629-202ENSMUST00000152740 645 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Nup88Q8CEC0 Gm9359-201ENSMUST00000163721 1221 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Nup88Q8CEC0 Gm18808-201ENSMUST00000173316 462 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Nup88Q8CEC0 Gm24812-201ENSMUST00000175315 284 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Nup88Q8CEC0 Gm20738-201ENSMUST00000177666 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Nup88Q8CEC0 Gm20823-201ENSMUST00000179949 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Nup88Q8CEC0 Gm20865-202ENSMUST00000181163 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Nup88Q8CEC0 Gm21868-201ENSMUST00000185623 1230 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Nup88Q8CEC0 Gm29049-201ENSMUST00000185705 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Nup88Q8CEC0 Gm20924-202ENSMUST00000186910 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Nup88Q8CEC0 Gm20816-202ENSMUST00000187846 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Nup88Q8CEC0 Gm20809-202ENSMUST00000187943 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Nup88Q8CEC0 Gm21728-201ENSMUST00000188442 695 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Nup88Q8CEC0 Gm21889-201ENSMUST00000188487 695 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Nup88Q8CEC0 Gm28443-201ENSMUST00000189081 698 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Nup88Q8CEC0 Gm20932-201ENSMUST00000189115 694 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Nup88Q8CEC0 Gm21721-202ENSMUST00000189253 1225 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Nup88Q8CEC0 Gm21920-201ENSMUST00000190042 695 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Nup88Q8CEC0 Gm28171-201ENSMUST00000190100 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Nup88Q8CEC0 Gm20803-202ENSMUST00000190968 1230 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Nup88Q8CEC0 Gm20867-202ENSMUST00000190987 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Nup88Q8CEC0 Gm37191-201ENSMUST00000193346 388 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Nup88Q8CEC0 Gm43377-201ENSMUST00000201640 455 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Nup88Q8CEC0 Olfr574-201ENSMUST00000052997 1041 ntAPPRIS P2 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Nup88Q8CEC0 Gm14851-201ENSMUST00000077452 351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Nup88Q8CEC0 Gm29017-201ENSMUST00000190598 2092 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Nup88Q8CEC0 Vmn1r50-202ENSMUST00000089417 2059 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Nup88Q8CEC0 Depdc1a-202ENSMUST00000106041 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Nup88Q8CEC0 Usp17la-201ENSMUST00000067695 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Nup88Q8CEC0 Eif4a2-203ENSMUST00000115341 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Nup88Q8CEC0 Tmcc3-203ENSMUST00000117929 3317 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Nup88Q8CEC0 2610001J05Rik-201ENSMUST00000139231 3177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Nup88Q8CEC0 Csnk1g1-213ENSMUST00000206528 1740 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Nup88Q8CEC0 Kcnmb2-205ENSMUST00000192429 2357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Nup88Q8CEC0 Sspo-201ENSMUST00000043676 15148 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Nup88Q8CEC0 Tulp4-201ENSMUST00000039655 9687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Nup88Q8CEC0 Fam47c-201ENSMUST00000105110 1639 ntAPPRIS P1 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Nup88Q8CEC0 N4bp2-204ENSMUST00000201489 9055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Nup88Q8CEC0 Olfr1239-203ENSMUST00000217181 1516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Nup88Q8CEC0 Kpna2-201ENSMUST00000018506 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Nup88Q8CEC0 Myt1l-202ENSMUST00000049784 7202 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Nup88Q8CEC0 C030015A19Rik-201ENSMUST00000203368 2551 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Nup88Q8CEC0 Fam160a1-201ENSMUST00000094148 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Nup88Q8CEC0 C87436-201ENSMUST00000050497 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Nup88Q8CEC0 Gm20877-201ENSMUST00000100105 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Nup88Q8CEC0 Gm16073-201ENSMUST00000116032 517 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Nup88Q8CEC0 Zfp616-203ENSMUST00000116546 531 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Nup88Q8CEC0 Gm14865-201ENSMUST00000117523 494 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Nup88Q8CEC0 Gm5601-201ENSMUST00000118909 972 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Nup88Q8CEC0 Gm4886-201ENSMUST00000121874 1176 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Nup88Q8CEC0 Gm15551-201ENSMUST00000132762 535 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Nup88Q8CEC0 Nudt7-205ENSMUST00000147605 966 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Nup88Q8CEC0 Gm24286-201ENSMUST00000157632 128 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Nup88Q8CEC0 Gm9672-201ENSMUST00000166437 425 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Nup88Q8CEC0 Gm20917-201ENSMUST00000179922 990 ntAPPRIS P1 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Nup88Q8CEC0 Gm29197-201ENSMUST00000185922 702 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Nup88Q8CEC0 Gm8883-201ENSMUST00000187594 454 ntTSL 3 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Nup88Q8CEC0 2310046K23Rik-201ENSMUST00000193521 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Nup88Q8CEC0 Gm35801-201ENSMUST00000193927 479 ntTSL 3 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Nup88Q8CEC0 Trav13n-1-201ENSMUST00000198359 331 ntAPPRIS P1 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Nup88Q8CEC0 Gm7452-201ENSMUST00000200764 788 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Nup88Q8CEC0 Gm44111-201ENSMUST00000204649 399 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Nup88Q8CEC0 Gm36696-201ENSMUST00000205418 438 ntTSL 2 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Nup88Q8CEC0 Agr2-201ENSMUST00000020898 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Nup88Q8CEC0 Tespa1-202ENSMUST00000217702 1102 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Nup88Q8CEC0 AC133203.1-201ENSMUST00000228241 301 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Nup88Q8CEC0 Olfr424-201ENSMUST00000053941 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Nup88Q8CEC0 Mir106b-201ENSMUST00000083580 82 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Nup88Q8CEC0 Olfr1132-201ENSMUST00000090711 927 ntAPPRIS P1 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Nup88Q8CEC0 Olfr633-201ENSMUST00000098188 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Nup88Q8CEC0 Olfr1306-201ENSMUST00000099607 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Nup88Q8CEC0 Zscan4d-201ENSMUST00000067210 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Nup88Q8CEC0 Dpcr1-201ENSMUST00000095467 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Nup88Q8CEC0 Ptprd-219ENSMUST00000174531 4509 ntTSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Nup88Q8CEC0 Vmn1r90-209ENSMUST00000227855 7362 ntAPPRIS P2 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Nup88Q8CEC0 Unc13c-202ENSMUST00000184666 8796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Nup88Q8CEC0 Gm18310-201ENSMUST00000206494 3912 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Nup88Q8CEC0 Atp2b1-201ENSMUST00000020107 7130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Nup88Q8CEC0 Abcc9-201ENSMUST00000073173 7433 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Nup88Q8CEC0 Adar-201ENSMUST00000029563 3753 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Nup88Q8CEC0 Gm44956-201ENSMUST00000208277 2887 ntTSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Nup88Q8CEC0 Gbp4-201ENSMUST00000100962 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Nup88Q8CEC0 Gm28600-202ENSMUST00000189502 1495 ntTSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Nup88Q8CEC0 Gm28173-201ENSMUST00000191190 1496 ntTSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Nup88Q8CEC0 Gje1-201ENSMUST00000020016 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
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