Protein–RNA interactions for Protein: Q8C006

Trim35, Tripartite motif-containing protein 35, mousemouse

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Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim35Q8C006 Gm26910-201ENSMUST00000180450 698 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Trim35Q8C006 Gm8860-201ENSMUST00000193160 445 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Trim35Q8C006 Gm42865-201ENSMUST00000197981 613 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Trim35Q8C006 Trav7-1-201ENSMUST00000198019 337 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Trim35Q8C006 Ltf-209ENSMUST00000198884 616 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Trim35Q8C006 Gm42205-201ENSMUST00000199244 804 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Trim35Q8C006 Gm42375-201ENSMUST00000206226 745 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Trim35Q8C006 Gm30873-201ENSMUST00000207512 1222 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Trim35Q8C006 Olfr673-ps1-201ENSMUST00000210859 411 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Trim35Q8C006 AC162931.1-201ENSMUST00000214184 267 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Trim35Q8C006 CT030657.2-201ENSMUST00000220710 792 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Trim35Q8C006 AC165157.3-201ENSMUST00000220815 103 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Trim35Q8C006 AC124687.5-201ENSMUST00000222734 596 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Trim35Q8C006 AC154669.1-201ENSMUST00000224405 482 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Trim35Q8C006 AC134913.1-201ENSMUST00000224563 504 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Trim35Q8C006 Gm6043-201ENSMUST00000099961 492 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Trim35Q8C006 Dusp3-201ENSMUST00000003612 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Trim35Q8C006 4930471D02Rik-201ENSMUST00000180815 2075 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Trim35Q8C006 Lrrc2-201ENSMUST00000035076 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Trim35Q8C006 Gm28048-201ENSMUST00000160826 2746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Trim35Q8C006 Gm11487-201ENSMUST00000084480 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Trim35Q8C006 Syncrip-211ENSMUST00000174688 3176 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Trim35Q8C006 Acsl6-205ENSMUST00000094194 2554 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Trim35Q8C006 Tsr2-201ENSMUST00000026295 3804 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Trim35Q8C006 Olfr1493-ps1-201ENSMUST00000207208 1777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Trim35Q8C006 Gm35725-201ENSMUST00000221862 2800 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Trim35Q8C006 Ehmt1-204ENSMUST00000114418 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Trim35Q8C006 Cass4-204ENSMUST00000228775 2629 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Trim35Q8C006 Tmem181b-ps-202ENSMUST00000180035 2426 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Trim35Q8C006 Ubash3b-206ENSMUST00000151485 2231 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Trim35Q8C006 Prdm16-206ENSMUST00000105638 8601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Trim35Q8C006 Zzz3-204ENSMUST00000106103 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Trim35Q8C006 Sorbs2-228ENSMUST00000153798 2667 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Trim35Q8C006 AC134898.1-201ENSMUST00000223738 1836 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Trim35Q8C006 Slc30a2-202ENSMUST00000105872 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Trim35Q8C006 Gm45528-201ENSMUST00000209854 3145 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Trim35Q8C006 Dbndd2-203ENSMUST00000109349 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Trim35Q8C006 9230112E08Rik-202ENSMUST00000189441 3352 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Trim35Q8C006 Tnfsf18-201ENSMUST00000086084 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
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Trim35Q8C006 Sorbs1-221ENSMUST00000225786 2314 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Trim35Q8C006 Gm44587-201ENSMUST00000207399 1685 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Trim35Q8C006 Pkd2l2-202ENSMUST00000166156 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Trim35Q8C006 Ptrh2-202ENSMUST00000108022 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
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Trim35Q8C006 Emc1-205ENSMUST00000179784 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
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Trim35Q8C006 Aqp8-202ENSMUST00000098056 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Trim35Q8C006 Cntrl-212ENSMUST00000156933 7189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Trim35Q8C006 Mrpl15-206ENSMUST00000156816 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Trim35Q8C006 Gm28201-201ENSMUST00000189989 2166 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Trim35Q8C006 Vmn1r-ps128-201ENSMUST00000121211 1739 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Trim35Q8C006 Mir744-201ENSMUST00000103261 100 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Trim35Q8C006 Gm14406-201ENSMUST00000108943 531 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Trim35Q8C006 Arpc3-204ENSMUST00000111716 838 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
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Trim35Q8C006 Gm45459-201ENSMUST00000209882 442 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
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Trim35Q8C006 AC167234.1-201ENSMUST00000219929 279 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
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Trim35Q8C006 AC154693.1-201ENSMUST00000223821 523 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
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Trim35Q8C006 Tnnt1-201ENSMUST00000071798 1027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Trim35Q8C006 Rpl21-ps11-201ENSMUST00000077278 480 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Trim35Q8C006 Gm24144-201ENSMUST00000082632 111 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Trim35Q8C006 Gm10240-201ENSMUST00000089785 483 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Trim35Q8C006 Olfr52-201ENSMUST00000099905 960 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Trim35Q8C006 Zscan5b-201ENSMUST00000072662 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Trim35Q8C006 Lpar2-201ENSMUST00000034325 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Trim35Q8C006 Gm15496-201ENSMUST00000129578 2456 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Trim35Q8C006 Gm26710-201ENSMUST00000181265 1793 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Trim35Q8C006 Gp1ba-201ENSMUST00000055184 2710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Trim35Q8C006 Olfr857-203ENSMUST00000217450 2271 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Trim35Q8C006 Gm44597-202ENSMUST00000203287 3516 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Trim35Q8C006 Olfr1043-204ENSMUST00000216028 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
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