Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPM3

Trim17, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM17, mousemouse

Predictions only

Length 477 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim17Q7TPM3 Gm4042-201ENSMUST00000216946 637 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 AC159205.7-201ENSMUST00000225988 692 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 AC105324.1-201ENSMUST00000227844 386 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Cma2-202ENSMUST00000228263 857 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Tmed6-201ENSMUST00000034393 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Mir296-201ENSMUST00000083587 79 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 6330410L21Rik-201ENSMUST00000199846 3871 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Gm43339-201ENSMUST00000200032 1606 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Gm26861-201ENSMUST00000180807 5278 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Olfr1015-203ENSMUST00000215945 2479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Atp1a4-201ENSMUST00000111243 3470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Mdm4-202ENSMUST00000067429 3490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Olfr308-202ENSMUST00000214977 4991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Sphkap-205ENSMUST00000160953 8154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Adam28-202ENSMUST00000111072 3025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Olfr1220-203ENSMUST00000213288 4223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 AC122346.1-201ENSMUST00000225266 3732 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Gm21043-201ENSMUST00000199316 1517 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Olfr1391-202ENSMUST00000215671 3235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Gm14827-201ENSMUST00000146644 3089 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Tbc1d24-213ENSMUST00000201805 3806 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 AC159193.3-201ENSMUST00000221902 2622 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 AC124680.1-201ENSMUST00000223923 1585 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Vmn1r35-204ENSMUST00000227749 2254 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Csnk1g1-201ENSMUST00000034949 7208 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Klb-201ENSMUST00000031096 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Vmn1r70-204ENSMUST00000228090 3185 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.21□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Gm42503-201ENSMUST00000199080 3706 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Sgip1-203ENSMUST00000080728 3712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Zfp930-204ENSMUST00000212681 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Slamf1-201ENSMUST00000015460 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Cdc42bpa-202ENSMUST00000097450 5160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Trim17Q7TPM3 Gm21781-201ENSMUST00000178920 4838 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Trim17Q7TPM3 Adam4-201ENSMUST00000085319 2504 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Trim17Q7TPM3 Itih5l-ps-201ENSMUST00000145639 3964 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Trim17Q7TPM3 Gm38082-201ENSMUST00000192800 6882 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Trim17Q7TPM3 Lonrf2-201ENSMUST00000039612 5077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Trim17Q7TPM3 Igkv6-20-201ENSMUST00000103388 375 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Trim17Q7TPM3 Trav19-201ENSMUST00000103674 446 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Trim17Q7TPM3 Gm22267-201ENSMUST00000104008 131 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Trim17Q7TPM3 Rps12-ps10-201ENSMUST00000117447 399 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Trim17Q7TPM3 Gm11987-201ENSMUST00000118524 381 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Trim17Q7TPM3 Rps12-ps16-201ENSMUST00000118529 399 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Trim17Q7TPM3 Gm16226-203ENSMUST00000161197 395 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Trim17Q7TPM3 Gm2026-203ENSMUST00000174416 532 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Trim17Q7TPM3 Rps12-ps13-201ENSMUST00000178365 399 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Trim17Q7TPM3 Rps12-ps11-201ENSMUST00000178427 399 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Trim17Q7TPM3 Rps12-ps12-201ENSMUST00000179020 399 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Trim17Q7TPM3 Rps12-ps17-201ENSMUST00000179067 399 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Trim17Q7TPM3 Rps12-ps6-201ENSMUST00000179239 399 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Trim17Q7TPM3 Rps12-ps14-201ENSMUST00000179356 399 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Trim17Q7TPM3 Rps12-ps18-201ENSMUST00000179420 399 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Trim17Q7TPM3 Rps12-ps15-201ENSMUST00000179567 399 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Trim17Q7TPM3 Rps12l1-201ENSMUST00000183090 399 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Trim17Q7TPM3 Mir6403-201ENSMUST00000185007 129 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Trim17Q7TPM3 Gm28885-201ENSMUST00000185615 563 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Trim17Q7TPM3 Gm35801-201ENSMUST00000193927 479 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Trim17Q7TPM3 Rps12-ps4-201ENSMUST00000208689 397 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Trim17Q7TPM3 Gm34424-201ENSMUST00000213400 782 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Trim17Q7TPM3 Gm22351-201ENSMUST00000083925 107 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Trim17Q7TPM3 Olfr1259-201ENSMUST00000090695 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Trim17Q7TPM3 Bglap2-201ENSMUST00000098956 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Trim17Q7TPM3 Hao2-201ENSMUST00000029464 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Trim17Q7TPM3 Far1-201ENSMUST00000033018 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Trim17Q7TPM3 Olfr994-204ENSMUST00000217218 1460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Trim17Q7TPM3 Trp53bp1-201ENSMUST00000110647 9405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Trim17Q7TPM3 Ank3-240ENSMUST00000183169 6870 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Trim17Q7TPM3 Olfr1048-202ENSMUST00000215607 2981 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Trim17Q7TPM3 Skil-201ENSMUST00000029194 6717 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Trim17Q7TPM3 Sytl2-207ENSMUST00000190837 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Trim17Q7TPM3 Gm37911-201ENSMUST00000193099 1545 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Trim17Q7TPM3 Olfr60-203ENSMUST00000211031 2650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Trim17Q7TPM3 Olfr60-204ENSMUST00000215023 2692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Trim17Q7TPM3 Olfr338-201ENSMUST00000072114 5780 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Trim17Q7TPM3 Olfr259-203ENSMUST00000215828 4095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Trim17Q7TPM3 Mstn-201ENSMUST00000027269 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Trim17Q7TPM3 Adsl-201ENSMUST00000023043 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Trim17Q7TPM3 Atp13a5-201ENSMUST00000075806 4598 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Trim17Q7TPM3 Spata22-201ENSMUST00000117445 3200 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Trim17Q7TPM3 Zfp184-201ENSMUST00000006903 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Trim17Q7TPM3 Sbf2-208ENSMUST00000166020 5481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Trim17Q7TPM3 Gm13986-202ENSMUST00000148587 3469 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Trim17Q7TPM3 Anks4b-201ENSMUST00000033201 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Trim17Q7TPM3 Ranbp6-201ENSMUST00000099525 4575 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Trim17Q7TPM3 Tnfrsf22-201ENSMUST00000075588 4170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Trim17Q7TPM3 Atp8b4-202ENSMUST00000040149 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Trim17Q7TPM3 Wdr37-202ENSMUST00000054251 4626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Trim17Q7TPM3 Gm28175-202ENSMUST00000209336 1477 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Trim17Q7TPM3 Trim5-201ENSMUST00000051795 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Trim17Q7TPM3 Gm25785-201ENSMUST00000104129 125 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Trim17Q7TPM3 Klra3-202ENSMUST00000111998 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Trim17Q7TPM3 Fate1-202ENSMUST00000114569 1053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Trim17Q7TPM3 Gm11799-201ENSMUST00000116110 460 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Trim17Q7TPM3 Gm11920-201ENSMUST00000118491 563 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Trim17Q7TPM3 Gm12740-201ENSMUST00000118794 308 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Trim17Q7TPM3 Hspe1-ps4-201ENSMUST00000119538 286 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Trim17Q7TPM3 Mgst1-204ENSMUST00000120302 559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Trim17Q7TPM3 BC064078-201ENSMUST00000122939 570 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Trim17Q7TPM3 Gm4660-201ENSMUST00000131499 403 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Trim17Q7TPM3 Gm14216-201ENSMUST00000136046 409 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
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