Protein–RNA interactions for Protein: Q62424

Hoxa13, Homeobox protein Hox-A13, mousemouse

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Length 386 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa13Q62424 Gm5456-201ENSMUST00000170706 844 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Hoxa13Q62424 1110038B12Rik-201ENSMUST00000172501 579 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Hoxa13Q62424 Fam47e-207ENSMUST00000176621 746 ntTSL 3 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Hoxa13Q62424 Gm17045-201ENSMUST00000178600 844 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Hoxa13Q62424 1700054K02Rik-201ENSMUST00000181755 376 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Hoxa13Q62424 Gm18752-201ENSMUST00000192876 608 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Hoxa13Q62424 Gm37285-201ENSMUST00000194465 1139 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Hoxa13Q62424 Gm43748-201ENSMUST00000202329 1233 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Hoxa13Q62424 Gm45589-201ENSMUST00000209366 895 ntTSL 3 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Hoxa13Q62424 AC172194.1-201ENSMUST00000214246 1020 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Hoxa13Q62424 Gm17950-201ENSMUST00000214617 646 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Hoxa13Q62424 AC154904.1-201ENSMUST00000219510 312 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Hoxa13Q62424 Gm2139-201ENSMUST00000222569 1075 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Hoxa13Q62424 Vmn1r16-201ENSMUST00000227168 912 ntAPPRIS P2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Hoxa13Q62424 AC115357.1-201ENSMUST00000227575 466 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Hoxa13Q62424 Ccr1l1-201ENSMUST00000071404 1166 ntAPPRIS P1 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Hoxa13Q62424 Olfr177-201ENSMUST00000072853 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Hoxa13Q62424 Vmn2r114-201ENSMUST00000168033 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Hoxa13Q62424 Aph1c-202ENSMUST00000169282 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Hoxa13Q62424 AC139750.1-201ENSMUST00000223962 1300 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Hoxa13Q62424 Frmpd4-202ENSMUST00000112146 8153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Hoxa13Q62424 Gm34921-201ENSMUST00000219528 1406 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Hoxa13Q62424 Gm43029-201ENSMUST00000201829 1535 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Hoxa13Q62424 Ap4e1-201ENSMUST00000002063 4600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Hoxa13Q62424 Enpp6-201ENSMUST00000039840 4970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Hoxa13Q62424 Dcn-202ENSMUST00000163448 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Hoxa13Q62424 Usp37-201ENSMUST00000044260 7111 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Hoxa13Q62424 Gm42568-201ENSMUST00000195639 1841 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Hoxa13Q62424 Fasl-201ENSMUST00000000834 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Hoxa13Q62424 Prokr2-204ENSMUST00000142766 3932 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Hoxa13Q62424 Pcsk2os1-201ENSMUST00000126735 4233 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Hoxa13Q62424 Gm28583-201ENSMUST00000188903 2141 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Hoxa13Q62424 Kng2-202ENSMUST00000100046 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Hoxa13Q62424 4833423E24Rik-201ENSMUST00000099923 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Hoxa13Q62424 Gm5702-201ENSMUST00000185629 2469 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Hoxa13Q62424 AC132465.2-201ENSMUST00000218673 2728 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Hoxa13Q62424 Scn3a-201ENSMUST00000066432 9560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Hoxa13Q62424 Tsr1-201ENSMUST00000045807 3389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Hoxa13Q62424 Pabpc4l-202ENSMUST00000192793 5252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Hoxa13Q62424 Gm12886-201ENSMUST00000106266 1149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Hoxa13Q62424 Gm10999-201ENSMUST00000108743 207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Hoxa13Q62424 Cpeb4-202ENSMUST00000109412 6303 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Hoxa13Q62424 Plscr2-202ENSMUST00000113044 1239 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Hoxa13Q62424 Gm13983-201ENSMUST00000118018 865 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Hoxa13Q62424 Gm15789-201ENSMUST00000118992 1359 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Hoxa13Q62424 Tex35-203ENSMUST00000119526 679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Hoxa13Q62424 Gm15750-201ENSMUST00000120970 616 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Hoxa13Q62424 Gm14613-201ENSMUST00000122239 752 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Hoxa13Q62424 Mylk3-203ENSMUST00000122452 3036 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Hoxa13Q62424 Gm24382-201ENSMUST00000122698 107 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Hoxa13Q62424 2610204G07Rik-201ENSMUST00000131215 992 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Hoxa13Q62424 Gm15859-201ENSMUST00000132069 710 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Hoxa13Q62424 Tmprss11g-201ENSMUST00000134179 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Hoxa13Q62424 Gm11335-201ENSMUST00000148743 1080 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Hoxa13Q62424 4930451E10Rik-202ENSMUST00000152292 557 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Hoxa13Q62424 Gm23116-201ENSMUST00000158481 67 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Hoxa13Q62424 Adam3-210ENSMUST00000171611 1202 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Hoxa13Q62424 Gm17727-201ENSMUST00000171898 643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Hoxa13Q62424 Gm24155-201ENSMUST00000175259 110 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Hoxa13Q62424 Sncaip-206ENSMUST00000178678 3724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Hoxa13Q62424 Crnde-205ENSMUST00000179400 651 ntTSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Hoxa13Q62424 Gm8919-201ENSMUST00000182028 1014 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Hoxa13Q62424 Gm26916-201ENSMUST00000183304 352 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Hoxa13Q62424 Gm27507-201ENSMUST00000184199 93 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Hoxa13Q62424 Mhrt-202ENSMUST00000185798 447 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Hoxa13Q62424 4930579H20Rik-201ENSMUST00000187815 1516 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Hoxa13Q62424 Gm29044-202ENSMUST00000188980 300 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Hoxa13Q62424 Gm29050-202ENSMUST00000190865 502 ntTSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Hoxa13Q62424 Gm37024-201ENSMUST00000192224 868 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Hoxa13Q62424 Gm37689-201ENSMUST00000193139 275 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Hoxa13Q62424 Zbtb18-206ENSMUST00000193480 3734 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Hoxa13Q62424 Gm43689-201ENSMUST00000195951 427 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Hoxa13Q62424 Gm42707-202ENSMUST00000196668 618 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Hoxa13Q62424 Gm44898-201ENSMUST00000205934 2223 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Hoxa13Q62424 4933430N04Rik-202ENSMUST00000208031 1146 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Hoxa13Q62424 Olfr1486-ps1-201ENSMUST00000208835 220 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Hoxa13Q62424 Gm45626-201ENSMUST00000210093 361 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Hoxa13Q62424 Olfr291-201ENSMUST00000211582 1159 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Hoxa13Q62424 Olfr452-203ENSMUST00000215719 2728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Hoxa13Q62424 AC160966.1-202ENSMUST00000216860 1318 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Hoxa13Q62424 4930545H06Rik-201ENSMUST00000218225 763 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Hoxa13Q62424 AC122533.1-201ENSMUST00000225177 767 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Hoxa13Q62424 AC154461.5-201ENSMUST00000225429 774 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Hoxa13Q62424 Il6-201ENSMUST00000026845 1141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Hoxa13Q62424 Il20-201ENSMUST00000027673 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Hoxa13Q62424 Orm1-201ENSMUST00000030044 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Hoxa13Q62424 4930522N08Rik-201ENSMUST00000031274 916 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Hoxa13Q62424 Olfr1440-201ENSMUST00000054567 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Hoxa13Q62424 Vmn1r68-201ENSMUST00000058362 960 ntAPPRIS P1 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Hoxa13Q62424 A730017C20Rik-201ENSMUST00000058633 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Hoxa13Q62424 Sprr2b-201ENSMUST00000061038 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Hoxa13Q62424 Orm2-201ENSMUST00000075341 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Hoxa13Q62424 Usp17lb-201ENSMUST00000076501 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Hoxa13Q62424 Amer1-201ENSMUST00000084535 8496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Hoxa13Q62424 Gm8444-201ENSMUST00000092020 357 ntAPPRIS P1 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Hoxa13Q62424 Mrgprb5-201ENSMUST00000094389 1037 ntAPPRIS P1 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Hoxa13Q62424 Olfr1233-201ENSMUST00000099784 1042 ntAPPRIS P1 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Hoxa13Q62424 Abca8b-201ENSMUST00000020948 7423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
Hoxa13Q62424 Huwe1-201ENSMUST00000026292 14579 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
Hoxa13Q62424 Spag9-203ENSMUST00000075695 6910 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.1 ms