Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Toporsl-201ENSMUST00000029995 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1312-204ENSMUST00000215531 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Vmn2r79-201ENSMUST00000164462 2556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Vmn2r22-201ENSMUST00000170808 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Matr3-205ENSMUST00000186796 1854 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Gm4070-201ENSMUST00000106766 8795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Gvin1-201ENSMUST00000006667 8795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Gabra6-203ENSMUST00000155218 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 S100pbp-201ENSMUST00000049081 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r201-203ENSMUST00000226965 4741 ntAPPRIS P1 BASIC5.32□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Rnf24-201ENSMUST00000059372 5978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Gm44026-201ENSMUST00000203985 2088 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Gm17094-201ENSMUST00000169881 3334 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 CT009718.2-201ENSMUST00000221408 1428 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Tet1-206ENSMUST00000174189 14369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Foxp2-204ENSMUST00000115472 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Gm9968-201ENSMUST00000147504 2990 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Il1b-201ENSMUST00000028881 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Il13ra2-201ENSMUST00000033646 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Trmt10a-201ENSMUST00000040321 4025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 7420700N18Rik-201ENSMUST00000209524 1644 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Mapk9-204ENSMUST00000109178 1302 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Gm29601-201ENSMUST00000187961 1349 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Gm43874-201ENSMUST00000204853 2798 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Celf2-201ENSMUST00000002176 7718 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Ros1-201ENSMUST00000020045 7401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Lsmem1-202ENSMUST00000220951 2152 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Psg20-202ENSMUST00000108482 1871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Pls3-203ENSMUST00000114058 3032 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Olfr446-201ENSMUST00000101461 927 ntAPPRIS P1 BASIC5.31□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Lair1-204ENSMUST00000108600 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Cst8-202ENSMUST00000109947 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Serpinb1-ps1-201ENSMUST00000118548 586 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Gm13325-201ENSMUST00000118746 806 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Rps18-ps1-201ENSMUST00000120838 459 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Olfr408-ps1-201ENSMUST00000121710 941 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Gm11491-201ENSMUST00000129441 1118 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 1700041M05Rik-201ENSMUST00000130055 306 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Gm4835-201ENSMUST00000155839 972 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Gm25717-201ENSMUST00000158631 353 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Gm3208-201ENSMUST00000168281 427 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Gm27401-201ENSMUST00000184052 173 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Gm27458-201ENSMUST00000185108 121 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Gm28958-201ENSMUST00000185864 703 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Gm28801-201ENSMUST00000188761 449 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 1700020D05Rik-201ENSMUST00000189704 1021 ntAPPRIS P1 BASIC5.31□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 1700003L19Rik-201ENSMUST00000190074 746 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Gm7341-201ENSMUST00000192183 926 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Gm42707-202ENSMUST00000196668 618 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Gm38413-201ENSMUST00000197852 348 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Gm33651-201ENSMUST00000200405 456 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Gm17918-201ENSMUST00000205315 574 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Gm45628-201ENSMUST00000210849 274 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Gm30132-202ENSMUST00000212825 819 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 4930471E19Rik-202ENSMUST00000219150 737 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 4930563J15Rik-202ENSMUST00000219752 560 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 CT572999.1-201ENSMUST00000220315 1260 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 AC154461.4-201ENSMUST00000224878 468 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 AC107663.2-201ENSMUST00000225534 1234 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 AC154718.1-201ENSMUST00000226676 250 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Cst8-201ENSMUST00000028931 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Llcfc1-201ENSMUST00000031900 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Rpl22l1-201ENSMUST00000043867 552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Olfr965-201ENSMUST00000069342 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.31□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Vpreb2-201ENSMUST00000075371 429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Elobl-202ENSMUST00000082339 300 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Gm16391-201ENSMUST00000086601 447 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1085-201ENSMUST00000099879 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.31□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 AC137871.4-201ENSMUST00000226323 3901 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Dnah6-201ENSMUST00000064948 12652 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Ugt1a7c-202ENSMUST00000113135 3302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 AC121870.1-201ENSMUST00000216279 4879 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1423-202ENSMUST00000214472 5570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1055-203ENSMUST00000213564 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Prdm9-206ENSMUST00000167994 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Ccl28-201ENSMUST00000099241 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 AC158779.2-201ENSMUST00000227902 1947 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Gm42798-201ENSMUST00000200853 3972 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Cr2-202ENSMUST00000082321 6207 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1385-202ENSMUST00000214948 4412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Gbp3-203ENSMUST00000106222 2629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 4930402F06Rik-202ENSMUST00000113010 1372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Alcam-203ENSMUST00000164728 1885 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Gm5039-202ENSMUST00000218054 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Gm44193-201ENSMUST00000204822 2523 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 BC064078-202ENSMUST00000131176 2299 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Xpo7-202ENSMUST00000167242 15121 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Il18rap-201ENSMUST00000027237 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 A830019P07Rik-201ENSMUST00000178904 1777 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Gm43029-201ENSMUST00000201829 1535 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Iglv1-201ENSMUST00000103746 391 ntAPPRIS P1 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Zfx-202ENSMUST00000113925 879 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Nptn-202ENSMUST00000114121 863 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Fpr3-202ENSMUST00000115565 1220 ntAPPRIS P1 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Cyp4a30-ps-201ENSMUST00000120813 1020 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Gm14990-201ENSMUST00000122354 445 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Gm8093-203ENSMUST00000144982 1020 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Gm11545-201ENSMUST00000146507 375 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Gm15511-201ENSMUST00000152570 557 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Gm24286-201ENSMUST00000157632 128 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 164.5 ms