Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2C5

Rnf149, E3 ubiquitin-protein ligase RNF149, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf149Q3U2C5 4933405E24Rik-201ENSMUST00000131019 1078 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Rnf149Q3U2C5 Gm16357-201ENSMUST00000144091 474 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Rnf149Q3U2C5 Gm15624-202ENSMUST00000154953 713 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Rnf149Q3U2C5 Gm24286-201ENSMUST00000157632 128 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Rnf149Q3U2C5 Gm22119-201ENSMUST00000175594 99 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Rnf149Q3U2C5 Cyp2c53-ps-201ENSMUST00000175649 897 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Rnf149Q3U2C5 Gm29353-201ENSMUST00000185801 620 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Rnf149Q3U2C5 Ptma-204ENSMUST00000188533 593 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Rnf149Q3U2C5 Gm18875-201ENSMUST00000188563 882 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Rnf149Q3U2C5 Gm29160-201ENSMUST00000190094 699 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Rnf149Q3U2C5 Rd3l-204ENSMUST00000190536 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Rnf149Q3U2C5 Gm37493-201ENSMUST00000193167 433 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Rnf149Q3U2C5 Gm24826-202ENSMUST00000197298 216 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Rnf149Q3U2C5 Gm18430-201ENSMUST00000197534 682 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Rnf149Q3U2C5 Gm42464-202ENSMUST00000198111 774 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Rnf149Q3U2C5 Sox2ot-214ENSMUST00000198758 1286 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Rnf149Q3U2C5 Gm30735-201ENSMUST00000199488 726 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Rnf149Q3U2C5 Gm3511-201ENSMUST00000199823 204 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Rnf149Q3U2C5 Mrln-201ENSMUST00000020090 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Rnf149Q3U2C5 Ghrl-202ENSMUST00000203363 400 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Rnf149Q3U2C5 Gm44225-201ENSMUST00000203582 186 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Rnf149Q3U2C5 Gm5305-201ENSMUST00000204010 746 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Rnf149Q3U2C5 Gm45042-201ENSMUST00000207377 211 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Rnf149Q3U2C5 Gm44565-201ENSMUST00000208194 269 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Rnf149Q3U2C5 Gm45100-201ENSMUST00000209153 391 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Rnf149Q3U2C5 Gm18781-201ENSMUST00000211252 924 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Rnf149Q3U2C5 Gm19007-201ENSMUST00000217746 874 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Rnf149Q3U2C5 Gm2398-201ENSMUST00000218347 883 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Rnf149Q3U2C5 Gm17611-202ENSMUST00000220613 814 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Rnf149Q3U2C5 CT033781.1-201ENSMUST00000223128 454 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Rnf149Q3U2C5 AC159267.1-201ENSMUST00000226702 678 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Rnf149Q3U2C5 AC168062.1-201ENSMUST00000228048 769 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Rnf149Q3U2C5 Olfr1361-201ENSMUST00000055615 954 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Rnf149Q3U2C5 Gm5341-201ENSMUST00000058881 489 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Rnf149Q3U2C5 F730035P03Rik-201ENSMUST00000065741 917 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Rnf149Q3U2C5 Gm5528-201ENSMUST00000076314 480 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Rnf149Q3U2C5 Gm25587-201ENSMUST00000082498 166 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Rnf149Q3U2C5 Cntn4-202ENSMUST00000089208 5179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Rnf149Q3U2C5 St18-208ENSMUST00000140079 5892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Rnf149Q3U2C5 Sptlc3-201ENSMUST00000047370 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Rnf149Q3U2C5 Pomp-202ENSMUST00000201120 3850 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Rnf149Q3U2C5 AA792892-202ENSMUST00000202253 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Rnf149Q3U2C5 Gm45201-201ENSMUST00000207187 2679 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Rnf149Q3U2C5 Gm31181-201ENSMUST00000217731 2283 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Rnf149Q3U2C5 Gm6526-201ENSMUST00000100643 1723 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Rnf149Q3U2C5 Meiob-201ENSMUST00000024972 1703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Rnf149Q3U2C5 Nedd4-207ENSMUST00000184333 4034 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Rnf149Q3U2C5 Nat8f2-201ENSMUST00000045008 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Rnf149Q3U2C5 Atf2-206ENSMUST00000112016 3943 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Rnf149Q3U2C5 CT010453.1-201ENSMUST00000226795 2201 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Rnf149Q3U2C5 Kcnj16-205ENSMUST00000178798 3678 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Rnf149Q3U2C5 Eif3e-201ENSMUST00000022960 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Rnf149Q3U2C5 Adgrl3-203ENSMUST00000117253 4764 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Rnf149Q3U2C5 Gm36011-201ENSMUST00000208671 2719 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Rnf149Q3U2C5 Gm14180-201ENSMUST00000105066 78 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Rnf149Q3U2C5 Elavl2-209ENSMUST00000107124 4127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Rnf149Q3U2C5 Gm8534-201ENSMUST00000118553 766 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Rnf149Q3U2C5 Gm13900-201ENSMUST00000119402 498 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Rnf149Q3U2C5 Gm13222-201ENSMUST00000119638 138 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Rnf149Q3U2C5 Gm11787-201ENSMUST00000121996 1050 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Rnf149Q3U2C5 Gm12018-201ENSMUST00000150694 3375 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Rnf149Q3U2C5 Gad1os-201ENSMUST00000151851 889 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Rnf149Q3U2C5 E130111B04Rik-201ENSMUST00000156781 450 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Rnf149Q3U2C5 Gm25722-201ENSMUST00000157498 279 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Rnf149Q3U2C5 Gm17212-201ENSMUST00000166666 259 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Rnf149Q3U2C5 Obox3-ps3-201ENSMUST00000177242 1004 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Rnf149Q3U2C5 Gm23139-201ENSMUST00000179454 132 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Rnf149Q3U2C5 Gm26587-201ENSMUST00000180795 989 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Rnf149Q3U2C5 Mir7058-201ENSMUST00000184637 75 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Rnf149Q3U2C5 Mir8120-201ENSMUST00000185035 139 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Rnf149Q3U2C5 Gm29349-201ENSMUST00000188692 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Rnf149Q3U2C5 1700112H15Rik-201ENSMUST00000188766 778 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Rnf149Q3U2C5 Smpx-208ENSMUST00000190091 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Rnf149Q3U2C5 Gm43357-201ENSMUST00000197132 342 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Rnf149Q3U2C5 Gm8182-201ENSMUST00000197863 769 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Rnf149Q3U2C5 Gm44252-201ENSMUST00000204187 330 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Rnf149Q3U2C5 6720469O03Rik-201ENSMUST00000206785 1201 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Rnf149Q3U2C5 Olfr675-203ENSMUST00000214318 3828 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Rnf149Q3U2C5 AC241534.1-201ENSMUST00000218537 399 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Rnf149Q3U2C5 Tpbpb-203ENSMUST00000223978 991 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Rnf149Q3U2C5 Ceacam14-201ENSMUST00000023953 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Rnf149Q3U2C5 1700011L22Rik-201ENSMUST00000034109 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Rnf149Q3U2C5 Ermard-201ENSMUST00000040594 1571 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Rnf149Q3U2C5 Olfr1448-201ENSMUST00000054737 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Rnf149Q3U2C5 Gm5321-201ENSMUST00000072050 447 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Rnf149Q3U2C5 Homer1-203ENSMUST00000080127 3052 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Rnf149Q3U2C5 Defa24-201ENSMUST00000080533 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Rnf149Q3U2C5 Cldn34b3-201ENSMUST00000096389 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Rnf149Q3U2C5 Catsperg2-209ENSMUST00000209126 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Rnf149Q3U2C5 Vmn2r-ps54-202ENSMUST00000150147 2952 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Rnf149Q3U2C5 Igsf10-203ENSMUST00000194546 8393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Rnf149Q3U2C5 Cyp2c65-201ENSMUST00000087236 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Rnf149Q3U2C5 Vps50-201ENSMUST00000001412 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Rnf149Q3U2C5 Olfr904-202ENSMUST00000216724 5197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Rnf149Q3U2C5 Vmn1r86-203ENSMUST00000227220 6445 ntAPPRIS P2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Rnf149Q3U2C5 Gm10307-201ENSMUST00000189839 1337 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Rnf149Q3U2C5 Sorbs2-209ENSMUST00000132139 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Rnf149Q3U2C5 Zfp976-201ENSMUST00000098503 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Rnf149Q3U2C5 AC116476.1-201ENSMUST00000226274 2318 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Rnf149Q3U2C5 Gm30655-202ENSMUST00000222732 2808 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.1 ms