Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX9

Usp39, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp39Q3TIX9 Olfr1457-201ENSMUST00000075170 954 ntAPPRIS P1 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Usp39Q3TIX9 Olfr1469-201ENSMUST00000077538 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Usp39Q3TIX9 Gm26130-201ENSMUST00000083171 138 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Usp39Q3TIX9 Gm25189-201ENSMUST00000083911 164 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Usp39Q3TIX9 Ndufa9-201ENSMUST00000088194 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Usp39Q3TIX9 Gm18359-201ENSMUST00000173024 1459 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Usp39Q3TIX9 Lrrc6-201ENSMUST00000023006 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Usp39Q3TIX9 Mep1b-201ENSMUST00000082235 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Usp39Q3TIX9 4930594C11Rik-201ENSMUST00000192316 2755 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Usp39Q3TIX9 Kat6a-202ENSMUST00000110696 9041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Usp39Q3TIX9 Skil-201ENSMUST00000029194 6717 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Usp39Q3TIX9 Cd44-207ENSMUST00000111194 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Usp39Q3TIX9 Gm17039-201ENSMUST00000165145 4901 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Usp39Q3TIX9 Olfr1396-204ENSMUST00000215553 4237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Usp39Q3TIX9 Cxcr2-202ENSMUST00000106899 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Usp39Q3TIX9 AC121504.1-201ENSMUST00000221385 2705 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Usp39Q3TIX9 AC139758.3-201ENSMUST00000226853 2704 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Usp39Q3TIX9 Polk-204ENSMUST00000221645 1644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Usp39Q3TIX9 Fam160a1-201ENSMUST00000094148 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Usp39Q3TIX9 Gbp11-202ENSMUST00000171587 1329 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Usp39Q3TIX9 2700099C18Rik-204ENSMUST00000183133 1333 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Usp39Q3TIX9 Mef2c-227ENSMUST00000199432 3498 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Usp39Q3TIX9 Alg6-201ENSMUST00000097961 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Usp39Q3TIX9 Gm44723-201ENSMUST00000207369 4000 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Usp39Q3TIX9 Gm29379-201ENSMUST00000186305 2166 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Usp39Q3TIX9 Gm28276-201ENSMUST00000188508 2166 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Usp39Q3TIX9 Gm28201-201ENSMUST00000189989 2166 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Usp39Q3TIX9 Bglap3-202ENSMUST00000107542 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Usp39Q3TIX9 Vmn1r9-203ENSMUST00000228714 4573 ntAPPRIS P1 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Usp39Q3TIX9 Atp13a5-201ENSMUST00000075806 4598 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Usp39Q3TIX9 Ranbp6-201ENSMUST00000099525 4575 ntAPPRIS P1 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Usp39Q3TIX9 AC122263.1-201ENSMUST00000228636 2805 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Usp39Q3TIX9 Tgtp1-201ENSMUST00000068063 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Usp39Q3TIX9 Gm36388-201ENSMUST00000191663 1675 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Usp39Q3TIX9 4930440C22Rik-201ENSMUST00000185490 1565 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Usp39Q3TIX9 Tor1aip2-202ENSMUST00000065648 2529 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Usp39Q3TIX9 Gm31805-201ENSMUST00000211921 4031 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Usp39Q3TIX9 Olfr1330-202ENSMUST00000105035 1027 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Usp39Q3TIX9 Sult2a7-201ENSMUST00000108524 897 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Usp39Q3TIX9 Mrps36-ps2-201ENSMUST00000118658 309 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Usp39Q3TIX9 Gm11255-201ENSMUST00000120448 1180 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Usp39Q3TIX9 Gm14713-201ENSMUST00000122362 686 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Usp39Q3TIX9 1700011I03Rik-204ENSMUST00000135806 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Usp39Q3TIX9 Gm3208-201ENSMUST00000168281 427 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Usp39Q3TIX9 Ipcef1-209ENSMUST00000170680 1174 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Usp39Q3TIX9 Gm20528-202ENSMUST00000174821 802 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Usp39Q3TIX9 Gm26907-201ENSMUST00000181794 729 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Usp39Q3TIX9 Gm26851-201ENSMUST00000181867 918 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Usp39Q3TIX9 Pea15b-201ENSMUST00000182806 387 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Usp39Q3TIX9 6530403H02Rik-203ENSMUST00000183168 843 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Usp39Q3TIX9 Klk1b7-ps-202ENSMUST00000183762 619 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Usp39Q3TIX9 Scgb2b31-ps-201ENSMUST00000188734 328 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Usp39Q3TIX9 Scgb2b32-ps-201ENSMUST00000190326 337 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Usp39Q3TIX9 4930540E01Rik-201ENSMUST00000192569 1146 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Usp39Q3TIX9 4930590L14Rik-201ENSMUST00000196030 836 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Usp39Q3TIX9 5033423K11Rik-202ENSMUST00000202802 1162 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Usp39Q3TIX9 Tas2r146-ps1-201ENSMUST00000203065 934 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Usp39Q3TIX9 Gm44585-201ENSMUST00000207150 607 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Usp39Q3TIX9 Gm44681-201ENSMUST00000208447 842 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Usp39Q3TIX9 Olfr706-201ENSMUST00000209025 1087 ntAPPRIS P1 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Usp39Q3TIX9 Sult2a7-204ENSMUST00000211740 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Usp39Q3TIX9 Gm7688-201ENSMUST00000212857 337 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Usp39Q3TIX9 Olfr221-203ENSMUST00000214342 1062 ntAPPRIS P1 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Usp39Q3TIX9 Gm18996-201ENSMUST00000214851 755 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Usp39Q3TIX9 Gm30239-201ENSMUST00000220776 780 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Usp39Q3TIX9 A1cf-203ENSMUST00000224400 1204 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Usp39Q3TIX9 AC154634.2-201ENSMUST00000225983 1184 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Usp39Q3TIX9 Olfr844-201ENSMUST00000054106 930 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Usp39Q3TIX9 Olfr1360-201ENSMUST00000079135 980 ntAPPRIS P1 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Usp39Q3TIX9 Gm22504-201ENSMUST00000082963 139 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Usp39Q3TIX9 Ipcef1-202ENSMUST00000086896 1196 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Usp39Q3TIX9 Slxl1-201ENSMUST00000088740 730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Usp39Q3TIX9 Olfr305-202ENSMUST00000213255 3749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Usp39Q3TIX9 Zkscan16-201ENSMUST00000107554 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Usp39Q3TIX9 Gm15169-201ENSMUST00000126095 2753 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Usp39Q3TIX9 Gm44186-201ENSMUST00000204118 2752 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Usp39Q3TIX9 Rbfox1-201ENSMUST00000056416 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Usp39Q3TIX9 Cep85l-201ENSMUST00000095691 2560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Usp39Q3TIX9 B130024G19Rik-203ENSMUST00000190320 5451 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Usp39Q3TIX9 Mllt10-202ENSMUST00000114669 3865 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Usp39Q3TIX9 Trim30c-201ENSMUST00000106828 1716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Usp39Q3TIX9 AC126549.1-201ENSMUST00000225044 3687 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Usp39Q3TIX9 Tmem229b-202ENSMUST00000070174 3656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Usp39Q3TIX9 Csde1-201ENSMUST00000029446 4318 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Usp39Q3TIX9 Gm43638-201ENSMUST00000201519 2297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Usp39Q3TIX9 4930432O09Rik-201ENSMUST00000219710 1986 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Usp39Q3TIX9 Tnfsf10-201ENSMUST00000046383 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Usp39Q3TIX9 Gm37525-201ENSMUST00000193499 2871 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Usp39Q3TIX9 Gm27179-201ENSMUST00000184652 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Usp39Q3TIX9 BC053393-201ENSMUST00000050937 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Usp39Q3TIX9 Ctnna2-206ENSMUST00000162273 3277 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Usp39Q3TIX9 Gm28445-201ENSMUST00000187686 1498 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Usp39Q3TIX9 Tns4-201ENSMUST00000017751 4755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Usp39Q3TIX9 Gm45174-201ENSMUST00000208884 3065 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Usp39Q3TIX9 Olfr66-202ENSMUST00000216303 3080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Usp39Q3TIX9 Gdpd4-201ENSMUST00000041860 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Usp39Q3TIX9 Plcb1-201ENSMUST00000070724 3853 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Usp39Q3TIX9 Gm44093-201ENSMUST00000204381 1802 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Usp39Q3TIX9 9630041A04Rik-201ENSMUST00000112841 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Usp39Q3TIX9 Gm14904-201ENSMUST00000117067 335 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.9 ms