Protein–RNA interactions for Protein: Q1RNF8

Samd11, Sterile alpha motif domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 542 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd11Q1RNF8 Odf2-206ENSMUST00000113759 3807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
Samd11Q1RNF8 Ppp1r9a-204ENSMUST00000168998 2966 ntTSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
Samd11Q1RNF8 Gm7972-203ENSMUST00000209180 2184 ntTSL 3 BASIC8.1□□□□□ -1.11
Samd11Q1RNF8 Cyp2c55-201ENSMUST00000025966 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
Samd11Q1RNF8 Sox6-206ENSMUST00000205405 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.09□□□□□ -1.11
Samd11Q1RNF8 Ms4a6b-205ENSMUST00000163078 2680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.09□□□□□ -1.11
Samd11Q1RNF8 Srp54a-201ENSMUST00000021407 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.09□□□□□ -1.11
Samd11Q1RNF8 Phf6-201ENSMUST00000078944 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Samd11Q1RNF8 Kcnj15-203ENSMUST00000113855 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Samd11Q1RNF8 Gm37663-201ENSMUST00000191887 2299 ntBASIC8.09□□□□□ -1.11
Samd11Q1RNF8 AC125487.2-201ENSMUST00000219810 1300 ntBASIC8.09□□□□□ -1.11
Samd11Q1RNF8 Ssmem1-201ENSMUST00000031797 1340 ntTSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Samd11Q1RNF8 Ccr4-201ENSMUST00000054414 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Samd11Q1RNF8 Gm28440-201ENSMUST00000186328 1499 ntTSL 5 BASIC8.09□□□□□ -1.11
Samd11Q1RNF8 4933411O13Rik-201ENSMUST00000050665 1464 ntBASIC8.09□□□□□ -1.11
Samd11Q1RNF8 Grip1-211ENSMUST00000144959 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.09□□□□□ -1.11
Samd11Q1RNF8 Trappc1-204ENSMUST00000108662 635 ntTSL 2 BASIC8.09□□□□□ -1.11
Samd11Q1RNF8 Ncald-202ENSMUST00000116445 858 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.09□□□□□ -1.11
Samd11Q1RNF8 Gm22032-201ENSMUST00000116946 116 ntBASIC8.09□□□□□ -1.11
Samd11Q1RNF8 Ap3s1-ps1-201ENSMUST00000117113 579 ntBASIC8.09□□□□□ -1.11
Samd11Q1RNF8 Gm14065-201ENSMUST00000120848 585 ntBASIC8.09□□□□□ -1.11
Samd11Q1RNF8 Gm4660-201ENSMUST00000131499 403 ntBASIC8.09□□□□□ -1.11
Samd11Q1RNF8 Gm14216-201ENSMUST00000136046 409 ntTSL 3 BASIC8.09□□□□□ -1.11
Samd11Q1RNF8 Gm13261-201ENSMUST00000137351 1020 ntTSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Samd11Q1RNF8 Gm15397-201ENSMUST00000145790 804 ntTSL 3 BASIC8.09□□□□□ -1.11
Samd11Q1RNF8 Gm14343-201ENSMUST00000154524 731 ntTSL 3 BASIC8.09□□□□□ -1.11
Samd11Q1RNF8 Gm23317-201ENSMUST00000157999 129 ntBASIC8.09□□□□□ -1.11
Samd11Q1RNF8 Gm3326-201ENSMUST00000164656 1043 ntBASIC8.09□□□□□ -1.11
Samd11Q1RNF8 Gm26528-201ENSMUST00000181965 283 ntBASIC8.09□□□□□ -1.11
Samd11Q1RNF8 Oaz3-201ENSMUST00000191506 732 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.09□□□□□ -1.11
Samd11Q1RNF8 Gm43004-201ENSMUST00000201872 703 ntBASIC8.09□□□□□ -1.11
Samd11Q1RNF8 Gm44613-202ENSMUST00000205962 691 ntTSL 3 BASIC8.09□□□□□ -1.11
Samd11Q1RNF8 Gm44546-201ENSMUST00000208353 368 ntTSL 2 BASIC8.09□□□□□ -1.11
Samd11Q1RNF8 Gm17995-201ENSMUST00000209266 530 ntBASIC8.09□□□□□ -1.11
Samd11Q1RNF8 AC153537.1-201ENSMUST00000215530 858 ntTSL 5 BASIC8.09□□□□□ -1.11
Samd11Q1RNF8 Prl7d1-201ENSMUST00000021776 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Samd11Q1RNF8 Pah-204ENSMUST00000219813 789 ntTSL 3 BASIC8.09□□□□□ -1.11
Samd11Q1RNF8 4930471E15Rik-201ENSMUST00000221147 626 ntTSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Samd11Q1RNF8 AC151730.1-201ENSMUST00000226106 448 ntBASIC8.09□□□□□ -1.11
Samd11Q1RNF8 AC162857.1-201ENSMUST00000226614 400 ntBASIC8.09□□□□□ -1.11
Samd11Q1RNF8 9530002B09Rik-201ENSMUST00000024032 803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Samd11Q1RNF8 4930568D16Rik-201ENSMUST00000028243 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Samd11Q1RNF8 Olfr801-201ENSMUST00000072063 957 ntAPPRIS P1 BASIC8.09□□□□□ -1.11
Samd11Q1RNF8 Vmn1r218-201ENSMUST00000074992 897 ntAPPRIS P2 BASIC8.09□□□□□ -1.11
Samd11Q1RNF8 n-R5s95-201ENSMUST00000082684 118 ntBASIC8.09□□□□□ -1.11
Samd11Q1RNF8 Vmn1r125-201ENSMUST00000098739 924 ntAPPRIS P1 BASIC8.09□□□□□ -1.11
Samd11Q1RNF8 Olfr544-201ENSMUST00000051201 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.09□□□□□ -1.11
Samd11Q1RNF8 Smarcal1-201ENSMUST00000047615 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Samd11Q1RNF8 Olfr1-201ENSMUST00000120303 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Samd11Q1RNF8 2310058D17Rik-201ENSMUST00000131221 3201 ntTSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Samd11Q1RNF8 Kntc1-201ENSMUST00000031366 6961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Samd11Q1RNF8 Zfp825-202ENSMUST00000202645 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Samd11Q1RNF8 Usp17lb-201ENSMUST00000076501 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Samd11Q1RNF8 Amy1-202ENSMUST00000106540 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Samd11Q1RNF8 Pkib-202ENSMUST00000075992 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Samd11Q1RNF8 6530403H02Rik-202ENSMUST00000182124 3191 ntTSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Samd11Q1RNF8 Gm37109-201ENSMUST00000195475 2254 ntBASIC8.09□□□□□ -1.11
Samd11Q1RNF8 Pbdc1-201ENSMUST00000033577 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Samd11Q1RNF8 Zfhx3-204ENSMUST00000220518 17152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.09□□□□□ -1.11
Samd11Q1RNF8 Gprin3-201ENSMUST00000051065 8339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Samd11Q1RNF8 Papss2-201ENSMUST00000025833 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Samd11Q1RNF8 Gm5118-201ENSMUST00000184692 2203 ntTSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.12
Samd11Q1RNF8 Gm19028-201ENSMUST00000189614 1873 ntBASIC8.09□□□□□ -1.12
Samd11Q1RNF8 Olfr467-202ENSMUST00000208563 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.09□□□□□ -1.12
Samd11Q1RNF8 Olfr467-203ENSMUST00000214253 1855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.09□□□□□ -1.12
Samd11Q1RNF8 Tars2-203ENSMUST00000098857 3228 ntTSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Samd11Q1RNF8 Oxtr-202ENSMUST00000204027 3721 ntTSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Samd11Q1RNF8 Gm4319-201ENSMUST00000191139 2048 ntTSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Samd11Q1RNF8 Gm18259-201ENSMUST00000220991 2010 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
Samd11Q1RNF8 Vmn1r44-213ENSMUST00000228700 2004 ntAPPRIS P1 BASIC8.08□□□□□ -1.12
Samd11Q1RNF8 4921504E06Rik-201ENSMUST00000062060 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Samd11Q1RNF8 Serpinb3b-201ENSMUST00000086694 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Samd11Q1RNF8 Gtdc1-201ENSMUST00000049051 2197 ntTSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Samd11Q1RNF8 Ptk6-201ENSMUST00000016511 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Samd11Q1RNF8 Olfr994-204ENSMUST00000217218 1460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.08□□□□□ -1.12
Samd11Q1RNF8 Dglucy-208ENSMUST00000167322 2941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Samd11Q1RNF8 Gm42546-201ENSMUST00000201584 2592 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
Samd11Q1RNF8 Mak-201ENSMUST00000021792 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Samd11Q1RNF8 Gm22781-201ENSMUST00000104083 137 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
Samd11Q1RNF8 Rpl12-ps1-201ENSMUST00000116168 498 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
Samd11Q1RNF8 Rps12-ps10-201ENSMUST00000117447 399 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
Samd11Q1RNF8 Rps12-ps16-201ENSMUST00000118529 399 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
Samd11Q1RNF8 Gm4910-201ENSMUST00000119605 366 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
Samd11Q1RNF8 Gm23426-201ENSMUST00000122483 318 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
Samd11Q1RNF8 Gm16984-201ENSMUST00000130003 982 ntTSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Samd11Q1RNF8 9530034E10Rik-201ENSMUST00000146982 502 ntTSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Samd11Q1RNF8 Gm26183-201ENSMUST00000157685 139 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
Samd11Q1RNF8 Gm25432-201ENSMUST00000158284 66 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
Samd11Q1RNF8 Gm22428-201ENSMUST00000158554 132 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
Samd11Q1RNF8 Gm22698-201ENSMUST00000175375 108 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
Samd11Q1RNF8 Vmn1r-ps146-201ENSMUST00000176131 525 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
Samd11Q1RNF8 Rps12-ps13-201ENSMUST00000178365 399 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
Samd11Q1RNF8 Rps12-ps11-201ENSMUST00000178427 399 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
Samd11Q1RNF8 Rps12-ps12-201ENSMUST00000179020 399 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
Samd11Q1RNF8 Rps12-ps17-201ENSMUST00000179067 399 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
Samd11Q1RNF8 Rps12-ps6-201ENSMUST00000179239 399 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
Samd11Q1RNF8 Rps12-ps14-201ENSMUST00000179356 399 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
Samd11Q1RNF8 Rps12-ps18-201ENSMUST00000179420 399 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
Samd11Q1RNF8 Rps12-ps15-201ENSMUST00000179567 399 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
Samd11Q1RNF8 Gm20594-201ENSMUST00000179797 449 ntAPPRIS P1 BASIC8.08□□□□□ -1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.9 ms