Protein–RNA interactions for Protein: Q02111

Prkcq, Protein kinase C theta type, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcqQ02111 Gm5600-202ENSMUST00000211589 2331 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
PrkcqQ02111 Dnajb4-202ENSMUST00000050073 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
PrkcqQ02111 Slc22a6-201ENSMUST00000010250 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
PrkcqQ02111 Vmn2r-ps133-201ENSMUST00000176979 2569 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
PrkcqQ02111 Nxpe4-203ENSMUST00000216998 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
PrkcqQ02111 Zc3h11a-204ENSMUST00000191896 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
PrkcqQ02111 Pole-201ENSMUST00000007296 7163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
PrkcqQ02111 Gm22671-201ENSMUST00000104420 134 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
PrkcqQ02111 Tceal7-201ENSMUST00000113116 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
PrkcqQ02111 Gm15105-201ENSMUST00000117777 204 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
PrkcqQ02111 Olfr1274-ps-201ENSMUST00000120681 1035 ntAPPRIS P1 BASIC6.9□□□□□ -1.3
PrkcqQ02111 Gm11689-201ENSMUST00000120766 302 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
PrkcqQ02111 Gm12630-201ENSMUST00000121575 784 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
PrkcqQ02111 AV064505-201ENSMUST00000124572 522 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
PrkcqQ02111 Gm12923-201ENSMUST00000127060 667 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
PrkcqQ02111 4933431E20Rik-206ENSMUST00000138472 483 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
PrkcqQ02111 Cav1-209ENSMUST00000150901 380 ntTSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
PrkcqQ02111 Gm26323-201ENSMUST00000157743 175 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
PrkcqQ02111 Gm7289-201ENSMUST00000168993 734 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
PrkcqQ02111 Pde1c-208ENSMUST00000170774 2132 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
PrkcqQ02111 Plac1-203ENSMUST00000174390 907 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
PrkcqQ02111 Gm20637-201ENSMUST00000175715 462 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
PrkcqQ02111 Polr2k-202ENSMUST00000180159 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
PrkcqQ02111 Gm28335-201ENSMUST00000186204 696 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
PrkcqQ02111 Gm28558-201ENSMUST00000187373 696 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
PrkcqQ02111 Gm28585-201ENSMUST00000187587 442 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
PrkcqQ02111 Gm28734-201ENSMUST00000188104 696 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
PrkcqQ02111 Gm28968-201ENSMUST00000190413 696 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
PrkcqQ02111 Gm29626-202ENSMUST00000191517 425 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
PrkcqQ02111 Gm37026-201ENSMUST00000191917 535 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
PrkcqQ02111 Gm38229-201ENSMUST00000191931 696 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
PrkcqQ02111 Gm38283-201ENSMUST00000193041 695 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
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PrkcqQ02111 Gm38035-201ENSMUST00000194427 696 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
PrkcqQ02111 Trbv9-201ENSMUST00000194494 290 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
PrkcqQ02111 Gm38350-201ENSMUST00000194789 696 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
PrkcqQ02111 Gm34144-201ENSMUST00000197039 259 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
PrkcqQ02111 Gm20559-201ENSMUST00000201032 433 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
PrkcqQ02111 Gm44442-201ENSMUST00000204298 422 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
PrkcqQ02111 Gm44836-201ENSMUST00000205869 336 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
PrkcqQ02111 Zfp78-203ENSMUST00000207314 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
PrkcqQ02111 Gm9604-201ENSMUST00000211175 433 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
PrkcqQ02111 Gm45666-201ENSMUST00000211474 277 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
PrkcqQ02111 Mylf-ps-201ENSMUST00000222174 421 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
PrkcqQ02111 AC158536.1-201ENSMUST00000222510 256 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
PrkcqQ02111 AC163651.2-202ENSMUST00000222628 1192 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
PrkcqQ02111 Gm9315-201ENSMUST00000222696 908 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
PrkcqQ02111 Gm8075-202ENSMUST00000223088 682 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
PrkcqQ02111 AC159188.3-201ENSMUST00000224199 880 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
PrkcqQ02111 4932702P03Rik-203ENSMUST00000225028 670 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
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PrkcqQ02111 CT009556.4-201ENSMUST00000227092 200 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
PrkcqQ02111 AC157572.1-201ENSMUST00000227187 825 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
PrkcqQ02111 Myl12a-201ENSMUST00000024846 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
PrkcqQ02111 Cypt4-201ENSMUST00000053956 629 ntAPPRIS P1 BASIC6.9□□□□□ -1.3
PrkcqQ02111 Olfr1262-201ENSMUST00000061701 1024 ntAPPRIS P1 BASIC6.9□□□□□ -1.3
PrkcqQ02111 Ms4a5-201ENSMUST00000067673 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
PrkcqQ02111 Olfr384-201ENSMUST00000072993 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.9□□□□□ -1.3
PrkcqQ02111 Olfr535-201ENSMUST00000074897 991 ntAPPRIS P1 BASIC6.9□□□□□ -1.3
PrkcqQ02111 Rhox4e-201ENSMUST00000089075 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
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PrkcqQ02111 Ccr2-203ENSMUST00000168841 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
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PrkcqQ02111 AC165080.3-201ENSMUST00000217162 3116 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
PrkcqQ02111 A830008E24Rik-202ENSMUST00000190485 5226 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
PrkcqQ02111 Ttc41-202ENSMUST00000075632 4366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
PrkcqQ02111 AC131068.3-201ENSMUST00000228438 1456 ntBASIC6.9□□□□□ -1.31
PrkcqQ02111 Gm43285-201ENSMUST00000196563 3592 ntBASIC6.9□□□□□ -1.31
PrkcqQ02111 Htr2a-201ENSMUST00000036653 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
PrkcqQ02111 Srgap1-201ENSMUST00000020322 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
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PrkcqQ02111 Cept1-202ENSMUST00000068301 2814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
PrkcqQ02111 Dapp1-203ENSMUST00000136613 2950 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
PrkcqQ02111 Smarca2-246ENSMUST00000209085 1841 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
PrkcqQ02111 Gm6679-201ENSMUST00000191467 1869 ntBASIC6.9□□□□□ -1.31
PrkcqQ02111 Olfr43-204ENSMUST00000215550 1854 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.31
PrkcqQ02111 BC053393-201ENSMUST00000050937 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
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PrkcqQ02111 Catsperg1-201ENSMUST00000047846 3566 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
PrkcqQ02111 Ckap5-202ENSMUST00000099716 6574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
PrkcqQ02111 Trpm8-204ENSMUST00000171176 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
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PrkcqQ02111 Cul5-202ENSMUST00000120122 5945 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
PrkcqQ02111 Vmn2r11-201ENSMUST00000164875 2586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
PrkcqQ02111 Olfr90-206ENSMUST00000217397 2680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
PrkcqQ02111 5031410I06Rik-201ENSMUST00000063524 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
PrkcqQ02111 Gm7347-201ENSMUST00000095004 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
PrkcqQ02111 Csmd1-201ENSMUST00000082104 14182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
PrkcqQ02111 Gm10845-202ENSMUST00000228217 3389 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
PrkcqQ02111 Mdm4-202ENSMUST00000067429 3490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
PrkcqQ02111 Gm14728-201ENSMUST00000122196 492 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
PrkcqQ02111 Gm7420-201ENSMUST00000162836 842 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
PrkcqQ02111 Gm8356-202ENSMUST00000164917 984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
PrkcqQ02111 Gm17546-201ENSMUST00000168960 733 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
PrkcqQ02111 Vmn1r139-201ENSMUST00000169730 894 ntAPPRIS P1 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms