Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 Mir99ahg-214ENSMUST00000183333 3422 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Pkp1P97350 Nrg1-203ENSMUST00000207470 5415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Pkp1P97350 Tcf7l2-213ENSMUST00000111662 3715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Pkp1P97350 2610021A01Rik-201ENSMUST00000163475 4004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Pkp1P97350 Vangl1-202ENSMUST00000159388 3207 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Pkp1P97350 Cdk5rap2-206ENSMUST00000144099 11847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Pkp1P97350 Pde1c-202ENSMUST00000114327 6821 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Pkp1P97350 Spta1-201ENSMUST00000027817 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Pkp1P97350 Gm26806-201ENSMUST00000180403 1519 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Pkp1P97350 Eaf2-202ENSMUST00000075946 1878 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Pkp1P97350 Eppin-201ENSMUST00000103100 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Pkp1P97350 Gm3476-201ENSMUST00000112742 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Pkp1P97350 Gm15149-201ENSMUST00000119370 360 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Pkp1P97350 Mgst1-204ENSMUST00000120302 559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Pkp1P97350 Gm12531-201ENSMUST00000126099 487 ntTSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Pkp1P97350 Gm15527-202ENSMUST00000144094 770 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Pkp1P97350 Gm12160-201ENSMUST00000146372 342 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Pkp1P97350 Gm23756-201ENSMUST00000157582 114 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Pkp1P97350 Gm23071-201ENSMUST00000158242 115 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Pkp1P97350 Gm22990-201ENSMUST00000175427 89 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Pkp1P97350 Gm27186-201ENSMUST00000184223 307 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Pkp1P97350 Mir7005-201ENSMUST00000185089 69 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Pkp1P97350 Gm28443-201ENSMUST00000189081 698 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Pkp1P97350 Gm28620-201ENSMUST00000190463 439 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Pkp1P97350 Gm37380-201ENSMUST00000193752 397 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Pkp1P97350 Gm20128-201ENSMUST00000196189 417 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Pkp1P97350 Gm43241-201ENSMUST00000198375 364 ntTSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Pkp1P97350 Gm44147-201ENSMUST00000204658 94 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Pkp1P97350 Gm18838-201ENSMUST00000204855 886 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Pkp1P97350 Gm9367-201ENSMUST00000205703 546 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Pkp1P97350 Gm45196-201ENSMUST00000206751 825 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Pkp1P97350 Gm18559-201ENSMUST00000208249 604 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Pkp1P97350 CT030170.6-203ENSMUST00000222523 1295 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Pkp1P97350 Gm40383-201ENSMUST00000222601 610 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Pkp1P97350 AC154806.1-203ENSMUST00000227370 1032 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Pkp1P97350 A430010J10Rik-201ENSMUST00000054470 408 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Pkp1P97350 Gm17728-201ENSMUST00000076982 399 ntAPPRIS P1 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Pkp1P97350 Olfr66-201ENSMUST00000079117 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Pkp1P97350 Mir425-201ENSMUST00000083645 85 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Pkp1P97350 Gm10160-201ENSMUST00000085094 201 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Pkp1P97350 Gm10568-201ENSMUST00000193244 1634 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Pkp1P97350 Inpp5f-208ENSMUST00000151237 2609 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Pkp1P97350 Add3-201ENSMUST00000025999 4334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Pkp1P97350 Itpr2-201ENSMUST00000053273 8331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Pkp1P97350 Elmo1-202ENSMUST00000180626 2020 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Pkp1P97350 Mum1l1-202ENSMUST00000113042 4182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Pkp1P97350 Gm43707-201ENSMUST00000196451 3187 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Pkp1P97350 Clasp1-210ENSMUST00000188710 10265 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Pkp1P97350 AC022682.2-202ENSMUST00000224394 3943 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Pkp1P97350 Spag17os-202ENSMUST00000145279 3219 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Pkp1P97350 Kdm5d-207ENSMUST00000189069 2177 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Pkp1P97350 Gm38414-201ENSMUST00000209819 1488 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Pkp1P97350 E330013P04Rik-203ENSMUST00000190698 2996 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Pkp1P97350 Med12-203ENSMUST00000117203 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Pkp1P97350 Zscan4d-201ENSMUST00000067210 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Pkp1P97350 Brox-202ENSMUST00000163528 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Pkp1P97350 Gm18701-201ENSMUST00000188281 1536 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Pkp1P97350 A730017L22Rik-201ENSMUST00000128176 3055 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Pkp1P97350 Cfap221-202ENSMUST00000174370 2871 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Pkp1P97350 Slc22a8-202ENSMUST00000170817 3398 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Pkp1P97350 Emsy-207ENSMUST00000205911 5079 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Pkp1P97350 Gm15007-201ENSMUST00000119982 710 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Pkp1P97350 Gm12827-201ENSMUST00000132690 660 ntTSL 3 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Pkp1P97350 Gm11545-201ENSMUST00000146507 375 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Pkp1P97350 Fabp12-204ENSMUST00000172126 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Pkp1P97350 Gm25617-201ENSMUST00000179548 133 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Pkp1P97350 Gm28258-201ENSMUST00000189033 587 ntTSL 3 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Pkp1P97350 Cfhr2-202ENSMUST00000194186 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Pkp1P97350 Gm43400-201ENSMUST00000197294 1254 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Pkp1P97350 Gm25617-202ENSMUST00000198387 132 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Pkp1P97350 Gm43098-201ENSMUST00000199989 1297 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Pkp1P97350 Gm21054-201ENSMUST00000203981 380 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Pkp1P97350 Gm2225-201ENSMUST00000209570 377 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Pkp1P97350 Helt-202ENSMUST00000210652 1282 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Pkp1P97350 Gm2754-201ENSMUST00000223383 589 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Pkp1P97350 Arhgdib-201ENSMUST00000032344 1193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Pkp1P97350 Gm9788-201ENSMUST00000057038 906 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Pkp1P97350 Olfr49-201ENSMUST00000059996 1030 ntAPPRIS P1 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Pkp1P97350 Fpr2-201ENSMUST00000064068 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Pkp1P97350 Gm28392-201ENSMUST00000077630 393 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Pkp1P97350 Mdm4-202ENSMUST00000067429 3490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Pkp1P97350 AC122305.1-201ENSMUST00000214803 3921 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Pkp1P97350 9530086O07Rik-201ENSMUST00000203503 2685 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Pkp1P97350 Olfr1391-202ENSMUST00000215671 3235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Pkp1P97350 Lonrf2-201ENSMUST00000039612 5077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Pkp1P97350 Tmem167b-202ENSMUST00000106622 2752 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Pkp1P97350 Olfr1239-203ENSMUST00000217181 1516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Pkp1P97350 Chil4-201ENSMUST00000082219 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Pkp1P97350 Cdc42bpa-204ENSMUST00000111117 9161 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Pkp1P97350 Cnga1-201ENSMUST00000087213 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Pkp1P97350 Nova1-201ENSMUST00000021438 7154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Pkp1P97350 Shprh-202ENSMUST00000054814 7225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Pkp1P97350 Pde1a-202ENSMUST00000102651 1673 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Pkp1P97350 Pde1a-201ENSMUST00000090756 1661 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Pkp1P97350 Gm31805-201ENSMUST00000211921 4031 ntTSL 3 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Pkp1P97350 Errfi1-202ENSMUST00000073600 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Pkp1P97350 Vmn2r84-201ENSMUST00000094502 3034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Pkp1P97350 Eif4e-201ENSMUST00000029803 4991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Pkp1P97350 Spire1-201ENSMUST00000045105 5033 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Pkp1P97350 Dnajc5b-202ENSMUST00000118735 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.9 ms