Protein–RNA interactions for Protein: P56857

Cldn18, Claudin-18, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn18P56857 Mir3060-201ENSMUST00000175339 83 ntBASIC6□□□□□ -1.45
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Cldn18P56857 Gtpbp4-ps3-201ENSMUST00000184093 136 ntBASIC6□□□□□ -1.45
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Cldn18P56857 Gm29156-201ENSMUST00000187764 499 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Cldn18P56857 Gm29508-202ENSMUST00000191414 710 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Cldn18P56857 4930568G15Rik-202ENSMUST00000195635 996 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Cldn18P56857 Gm43160-201ENSMUST00000196453 421 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Cldn18P56857 Igkv4-83-201ENSMUST00000196933 334 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Cldn18P56857 Iglc3-201ENSMUST00000200235 452 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
Cldn18P56857 Gm7463-201ENSMUST00000201541 547 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Cldn18P56857 Gm21048-201ENSMUST00000202470 1166 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Cldn18P56857 Gm8479-201ENSMUST00000203825 718 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Cldn18P56857 Gm43867-201ENSMUST00000203860 525 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Cldn18P56857 Gm44386-201ENSMUST00000204288 429 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Cldn18P56857 Gm9367-201ENSMUST00000205703 546 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Cldn18P56857 Gm45589-201ENSMUST00000209366 895 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
Cldn18P56857 Gm34623-201ENSMUST00000210900 977 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Cldn18P56857 Gm39317-201ENSMUST00000213360 1138 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Cldn18P56857 Mobp-206ENSMUST00000214943 435 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
Cldn18P56857 Gm36278-201ENSMUST00000217030 918 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Cldn18P56857 AC154816.1-201ENSMUST00000222688 634 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
Cldn18P56857 AC165106.1-201ENSMUST00000227580 408 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Cldn18P56857 Olfr960-201ENSMUST00000077060 1067 ntAPPRIS P2 BASIC6□□□□□ -1.45
Cldn18P56857 Gm26530-201ENSMUST00000180969 3941 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Cldn18P56857 Bbx-203ENSMUST00000089404 4024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Cldn18P56857 Ctnna2-206ENSMUST00000162273 3277 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Cldn18P56857 Abca14-201ENSMUST00000084640 5384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Cldn18P56857 Gm20121-201ENSMUST00000198547 1594 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Cldn18P56857 Zfp462-203ENSMUST00000098070 10465 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
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Cldn18P56857 Smurf2-206ENSMUST00000167787 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Cldn18P56857 C630043F03Rik-201ENSMUST00000122923 2581 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Cldn18P56857 Gm37107-201ENSMUST00000195326 2552 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Cldn18P56857 Stat4-202ENSMUST00000168302 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Cldn18P56857 Akap9-201ENSMUST00000044492 13123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Cldn18P56857 AC139941.2-201ENSMUST00000221565 1824 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Cldn18P56857 Gm4876-203ENSMUST00000139701 2225 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Cldn18P56857 Vmn1r54-202ENSMUST00000226921 3234 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Cldn18P56857 Oxgr1-201ENSMUST00000058213 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
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Cldn18P56857 Psg21-201ENSMUST00000094793 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
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Cldn18P56857 Redrum-201ENSMUST00000181269 1774 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
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Cldn18P56857 Usp17lc-201ENSMUST00000079348 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Cldn18P56857 Gm20275-201ENSMUST00000215963 1387 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
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Cldn18P56857 Mrpl42-202ENSMUST00000217777 455 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Cldn18P56857 Olfr258-ps1-202ENSMUST00000218625 1085 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
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Cldn18P56857 Dlg1-206ENSMUST00000115205 4364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Cldn18P56857 Ptprz1-206ENSMUST00000202579 6871 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Cldn18P56857 Nlrp1a-202ENSMUST00000108518 3767 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Cldn18P56857 Zfp934-209ENSMUST00000222746 2206 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Cldn18P56857 Slc7a2-201ENSMUST00000057784 7910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Cldn18P56857 Gm43606-201ENSMUST00000195938 3556 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Cldn18P56857 Mpdz-202ENSMUST00000107258 7241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Cldn18P56857 Krit1-202ENSMUST00000171023 5582 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Cldn18P56857 Gm44186-201ENSMUST00000204118 2752 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Cldn18P56857 Mbnl3-204ENSMUST00000136404 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Cldn18P56857 Gm43128-201ENSMUST00000202212 1621 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Cldn18P56857 Gm6811-201ENSMUST00000169389 1533 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Cldn18P56857 Ranbp6-201ENSMUST00000099525 4575 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Cldn18P56857 Tex28-202ENSMUST00000114328 1421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.5 ms