Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 Gm29156-201ENSMUST00000187764 499 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Ggta1P23336 Gm37439-201ENSMUST00000193150 856 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Ggta1P23336 Gm42707-202ENSMUST00000196668 618 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Ggta1P23336 Gm9710-201ENSMUST00000198053 499 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Ggta1P23336 Gm42543-201ENSMUST00000198756 353 ntAPPRIS P1 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Ggta1P23336 Trav15n-2-201ENSMUST00000199112 398 ntAPPRIS P1 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Ggta1P23336 Trav15d-2-dv6d-2-201ENSMUST00000199800 398 ntAPPRIS P1 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Ggta1P23336 Gm4860-201ENSMUST00000200368 454 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Ggta1P23336 Gm18012-201ENSMUST00000204558 773 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Ggta1P23336 AC165349.1-201ENSMUST00000217896 424 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Ggta1P23336 CT030657.2-201ENSMUST00000220710 792 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Ggta1P23336 AC108437.1-201ENSMUST00000222170 776 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Ggta1P23336 AC101205.1-201ENSMUST00000227916 907 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Ggta1P23336 Cox20-201ENSMUST00000027781 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Ggta1P23336 Tlr11-201ENSMUST00000063570 2993 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Ggta1P23336 Olfr342-201ENSMUST00000074192 1054 ntAPPRIS P1 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Ggta1P23336 Gm24621-201ENSMUST00000082679 140 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Ggta1P23336 Catsperg1-201ENSMUST00000047846 3566 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Ggta1P23336 Vmn2r11-201ENSMUST00000164875 2586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Ggta1P23336 Gm29502-201ENSMUST00000185979 3739 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Ggta1P23336 Zfp345-201ENSMUST00000109914 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Ggta1P23336 AC153132.1-201ENSMUST00000222625 2705 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Ggta1P23336 Cyp2c68-201ENSMUST00000099472 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Ggta1P23336 D930016D06Rik-202ENSMUST00000181620 3805 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Ggta1P23336 AC131667.1-201ENSMUST00000214665 2175 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Ggta1P23336 Olfr734-203ENSMUST00000217152 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Ggta1P23336 Dab2-201ENSMUST00000078019 3793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Ggta1P23336 Trappc13-206ENSMUST00000179891 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Ggta1P23336 Gm36388-201ENSMUST00000191663 1675 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Ggta1P23336 Olfr66-202ENSMUST00000216303 3080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Ggta1P23336 9930111J21Rik2-201ENSMUST00000093152 2403 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Ggta1P23336 9930111J21Rik1-201ENSMUST00000093153 2403 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Ggta1P23336 Ikzf3-201ENSMUST00000103141 3658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Ggta1P23336 Gm5454-201ENSMUST00000052030 1453 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Ggta1P23336 Pde1a-203ENSMUST00000102652 1646 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Ggta1P23336 Cyp2c69-201ENSMUST00000168838 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Ggta1P23336 Gm10855-201ENSMUST00000100426 2541 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Ggta1P23336 Olfr1426-202ENSMUST00000208703 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Ggta1P23336 Fam196b-202ENSMUST00000165963 5371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Ggta1P23336 Gm8281-201ENSMUST00000100893 612 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Ggta1P23336 Mir708-201ENSMUST00000102189 109 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Ggta1P23336 Ighv12-3-201ENSMUST00000103485 353 ntAPPRIS P1 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Ggta1P23336 Gm25093-201ENSMUST00000103993 132 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Ggta1P23336 Gm23748-201ENSMUST00000104227 131 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Ggta1P23336 Gm14864-201ENSMUST00000116164 1087 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Ggta1P23336 Gm12135-201ENSMUST00000119170 466 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Ggta1P23336 Gm15149-201ENSMUST00000119370 360 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Ggta1P23336 Gm15311-201ENSMUST00000119682 282 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Ggta1P23336 Gm15305-201ENSMUST00000120354 288 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Ggta1P23336 Gm12531-201ENSMUST00000126099 487 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Ggta1P23336 2500004C02Rik-202ENSMUST00000128026 1898 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Ggta1P23336 Gm15265-202ENSMUST00000143287 814 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Ggta1P23336 3000002C10Rik-203ENSMUST00000144161 3977 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Ggta1P23336 2900079G21Rik-202ENSMUST00000144424 2944 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Ggta1P23336 Gm25395-201ENSMUST00000157343 272 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Ggta1P23336 Airn-202ENSMUST00000159731 435 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Ggta1P23336 Gm6726-201ENSMUST00000172786 681 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Ggta1P23336 Gm20491-201ENSMUST00000173765 1241 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Ggta1P23336 Gm9285-201ENSMUST00000177691 697 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Ggta1P23336 Gm8237-202ENSMUST00000178594 447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Ggta1P23336 D13Ertd608e-201ENSMUST00000179131 417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Ggta1P23336 Gm27152-201ENSMUST00000183828 99 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Ggta1P23336 Gm27507-201ENSMUST00000184199 93 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Ggta1P23336 Fcer1a-202ENSMUST00000193017 826 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Ggta1P23336 Ccl2-201ENSMUST00000000193 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Ggta1P23336 Gm42443-201ENSMUST00000198084 1155 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Ggta1P23336 Gm32585-201ENSMUST00000198586 764 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Ggta1P23336 1700028E10Rik-206ENSMUST00000202216 557 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Ggta1P23336 Gm45335-201ENSMUST00000210618 401 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Ggta1P23336 Gm20234-201ENSMUST00000214134 717 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Ggta1P23336 Mrpl42-202ENSMUST00000217777 455 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Ggta1P23336 CT009711.2-201ENSMUST00000225352 934 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Ggta1P23336 Pln-201ENSMUST00000046221 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Ggta1P23336 Kcne3-201ENSMUST00000049333 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Ggta1P23336 Vmn1r53-201ENSMUST00000076086 1122 ntAPPRIS P1 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Ggta1P23336 Pcmtd2-202ENSMUST00000108754 3499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Ggta1P23336 Vmn1r90-209ENSMUST00000227855 7362 ntAPPRIS P2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Ggta1P23336 Olfr798-202ENSMUST00000204979 3590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Ggta1P23336 Zhx1-203ENSMUST00000175805 4839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Ggta1P23336 Vmn1r52-204ENSMUST00000227578 2370 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Ggta1P23336 Gm43410-201ENSMUST00000197510 2234 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Ggta1P23336 Dlg1-206ENSMUST00000115205 4364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Ggta1P23336 1700014D04Rik-203ENSMUST00000180139 3231 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Ggta1P23336 Gm45061-201ENSMUST00000204395 2095 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Ggta1P23336 Gm37347-201ENSMUST00000193969 3071 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Ggta1P23336 Mapre1-201ENSMUST00000028981 7336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Ggta1P23336 Slc25a40-202ENSMUST00000170496 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Ggta1P23336 Mapre2-202ENSMUST00000115830 2496 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Ggta1P23336 D830026I12Rik-203ENSMUST00000151170 1607 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Ggta1P23336 Kcnc2-202ENSMUST00000218445 4033 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Ggta1P23336 Gm1698-201ENSMUST00000136749 2313 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Ggta1P23336 Vmn2r114-201ENSMUST00000168033 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Ggta1P23336 Kmt2c-201ENSMUST00000045291 14967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Ggta1P23336 Gm37595-201ENSMUST00000192668 1742 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Ggta1P23336 Cyp2c67-201ENSMUST00000067328 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Ggta1P23336 Ino80d-206ENSMUST00000172416 13438 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Ggta1P23336 Gm5084-202ENSMUST00000224064 3609 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Ggta1P23336 Tmcc3-203ENSMUST00000117929 3317 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Ggta1P23336 Gm13141-201ENSMUST00000117417 456 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Ggta1P23336 Gm13137-201ENSMUST00000118035 345 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.3 ms