Protein–RNA interactions for Protein: P20664

Prim1, DNA primase small subunit, mousemouse

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Length 417 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prim1P20664 Taf1-202ENSMUST00000118878 7210 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Prim1P20664 Dram2-203ENSMUST00000121034 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Prim1P20664 Rd3l-203ENSMUST00000189759 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Prim1P20664 Cts3-201ENSMUST00000054702 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Prim1P20664 Akap8-201ENSMUST00000002699 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Prim1P20664 Trp63-201ENSMUST00000040231 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Prim1P20664 Gm26790-201ENSMUST00000181078 2291 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Prim1P20664 Anxa9-201ENSMUST00000015846 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Prim1P20664 Bdp1-204ENSMUST00000109379 7567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Prim1P20664 Ndst3-207ENSMUST00000172537 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Prim1P20664 Gm614-201ENSMUST00000101358 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Prim1P20664 Mir683-2-201ENSMUST00000102099 109 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Prim1P20664 Gm11907-201ENSMUST00000118918 1007 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Prim1P20664 Gm12873-201ENSMUST00000119988 422 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Prim1P20664 Gm12773-201ENSMUST00000120134 587 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Prim1P20664 Gm14186-201ENSMUST00000120804 137 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Prim1P20664 Gm25294-201ENSMUST00000122791 104 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Prim1P20664 Rpl30-206ENSMUST00000142643 505 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Prim1P20664 Gm6401-202ENSMUST00000164232 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Prim1P20664 Gm24417-201ENSMUST00000178123 79 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Prim1P20664 Gm24653-201ENSMUST00000178541 79 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Prim1P20664 Gm25934-201ENSMUST00000178642 79 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Prim1P20664 Mir683-1-201ENSMUST00000179371 109 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Prim1P20664 Gm27617-201ENSMUST00000184321 168 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Prim1P20664 Rps27a-ps1-201ENSMUST00000191424 463 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Prim1P20664 Gm42924-201ENSMUST00000197261 185 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Prim1P20664 Gm43464-201ENSMUST00000198003 317 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Prim1P20664 Gm40319-201ENSMUST00000199785 481 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Prim1P20664 Dcp2-202ENSMUST00000202306 398 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Prim1P20664 A530053G22Rik-203ENSMUST00000204370 612 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Prim1P20664 Arl8b-202ENSMUST00000204483 695 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Prim1P20664 Gm7624-201ENSMUST00000209702 435 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Prim1P20664 Olfr936-202ENSMUST00000216912 937 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Prim1P20664 AC117245.2-201ENSMUST00000216943 570 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Prim1P20664 Olfr643-202ENSMUST00000217217 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Prim1P20664 AC151971.2-201ENSMUST00000217540 909 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Prim1P20664 Gm4898-201ENSMUST00000218519 832 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Prim1P20664 4933409F18Rik-201ENSMUST00000221910 1267 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Prim1P20664 Mif-ps7-201ENSMUST00000223357 327 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Prim1P20664 Gm5316-201ENSMUST00000050391 270 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Prim1P20664 Olfr629-201ENSMUST00000051346 1122 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Prim1P20664 Olfr224-201ENSMUST00000081102 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Prim1P20664 Klrk1-202ENSMUST00000095412 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Prim1P20664 Tpd52l2-208ENSMUST00000149163 3603 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Prim1P20664 Gm37968-201ENSMUST00000195131 3201 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Prim1P20664 Gm44883-201ENSMUST00000206063 3258 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Prim1P20664 Gphn-202ENSMUST00000110388 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Prim1P20664 Ank3-219ENSMUST00000182437 3113 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Prim1P20664 Bcas3-204ENSMUST00000108056 2925 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Prim1P20664 Sept14-203ENSMUST00000182386 1642 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Prim1P20664 Tnfrsf19-202ENSMUST00000111236 3958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Prim1P20664 Caps2-201ENSMUST00000092176 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Prim1P20664 Ank3-210ENSMUST00000182155 6375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Prim1P20664 Nprl2-201ENSMUST00000010201 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Prim1P20664 Gm14418-201ENSMUST00000108955 1415 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Prim1P20664 Mdga2-211ENSMUST00000222623 1449 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Prim1P20664 Ptges-202ENSMUST00000102852 3647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Prim1P20664 Dlk1-206ENSMUST00000109846 4106 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Prim1P20664 Gabpb1-201ENSMUST00000039978 1991 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Prim1P20664 Eya3-201ENSMUST00000020197 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Prim1P20664 Epb41l2-202ENSMUST00000092645 4280 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Prim1P20664 Ankrd49-201ENSMUST00000034406 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Prim1P20664 Tsacc-201ENSMUST00000010682 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Prim1P20664 Fau-ps2-201ENSMUST00000119333 371 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Prim1P20664 Gm14328-201ENSMUST00000122178 408 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
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Prim1P20664 1700125H03Rik-202ENSMUST00000139265 637 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Prim1P20664 Gm24130-201ENSMUST00000158536 151 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
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Prim1P20664 Fxyd5-207ENSMUST00000161684 1172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Prim1P20664 Gm8338-201ENSMUST00000163928 363 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
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Prim1P20664 Gm28363-201ENSMUST00000186341 673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Prim1P20664 Txn-ps1-201ENSMUST00000186385 309 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Prim1P20664 Gm37977-201ENSMUST00000193096 721 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Prim1P20664 Gm37799-201ENSMUST00000194018 547 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
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Prim1P20664 Gm43388-201ENSMUST00000197818 1225 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Prim1P20664 Gm42808-201ENSMUST00000198212 285 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Prim1P20664 Gm21041-201ENSMUST00000214829 823 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Prim1P20664 4930401C15Rik-201ENSMUST00000218300 865 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Prim1P20664 AC129537.1-202ENSMUST00000226619 430 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Prim1P20664 Acrv1-201ENSMUST00000034620 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Prim1P20664 Olfr648-201ENSMUST00000052659 951 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Prim1P20664 Olfr530-201ENSMUST00000074177 1080 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Prim1P20664 Gm12834-201ENSMUST00000121855 2829 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Prim1P20664 Cndp1-201ENSMUST00000070139 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Prim1P20664 Phc2-203ENSMUST00000106080 3885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Prim1P20664 Gm20110-201ENSMUST00000218263 2095 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Prim1P20664 Adad1-201ENSMUST00000029274 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Prim1P20664 Kcnma1-206ENSMUST00000163322 3162 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Prim1P20664 Kcnma1-210ENSMUST00000179836 3177 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Prim1P20664 Cabyr-204ENSMUST00000121018 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Prim1P20664 Gm38062-201ENSMUST00000192541 1856 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Prim1P20664 Gm43519-201ENSMUST00000197239 1872 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Prim1P20664 Tirap-201ENSMUST00000175765 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Prim1P20664 Pofut1-206ENSMUST00000123487 4143 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.4 ms