Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Gm22710-201ENSMUST00000116892 125 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 Gm13463-201ENSMUST00000119020 233 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 Gm15621-201ENSMUST00000119162 364 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 Gm13988-201ENSMUST00000119363 288 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 Gm12104-201ENSMUST00000120359 979 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 Gm4887-201ENSMUST00000122230 1053 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 Mpv17l-202ENSMUST00000124947 768 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 Gm15527-202ENSMUST00000144094 770 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 Gm22820-201ENSMUST00000157205 329 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 Gm26486-201ENSMUST00000158021 110 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 Gm16113-201ENSMUST00000159629 372 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 Gm9672-201ENSMUST00000166437 425 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 Cyp2c53-ps-201ENSMUST00000175649 897 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 Dnah7c-201ENSMUST00000178395 612 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 Gm8506-201ENSMUST00000186661 829 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 1700123O21Rik-201ENSMUST00000190515 677 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 Gm38256-201ENSMUST00000192097 950 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 Gm43436-201ENSMUST00000199308 147 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 Gm7463-201ENSMUST00000201541 547 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 1700028E10Rik-204ENSMUST00000201853 767 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 AC115793.1-201ENSMUST00000216605 215 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 Olfr643-202ENSMUST00000217217 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 AC163354.2-201ENSMUST00000221741 649 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 AC108947.1-201ENSMUST00000224274 1000 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 Olfr1501-201ENSMUST00000073966 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 Olfr1076-201ENSMUST00000076263 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 Gm21731-201ENSMUST00000079524 489 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 n-R5s169-201ENSMUST00000083110 120 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 Gm94-201ENSMUST00000096570 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 Gm6166-201ENSMUST00000098689 409 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 Olfr1224-ps1-202ENSMUST00000099793 1212 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 Pja2-202ENSMUST00000024889 4345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 Gm38412-201ENSMUST00000199205 3895 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 Gla-201ENSMUST00000033621 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 Bnc2-201ENSMUST00000102820 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 Gm10475-201ENSMUST00000084713 1796 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 Aox3-201ENSMUST00000040999 4606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 Gimd1-203ENSMUST00000212594 1432 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 Olfr1048-202ENSMUST00000215607 2981 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 Efcab2-201ENSMUST00000027775 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 Spin4-201ENSMUST00000096367 4173 ntAPPRIS P1 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 5430401H09Rik-202ENSMUST00000218836 2620 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 Olfr1275-203ENSMUST00000217539 1661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 Gm10767-201ENSMUST00000099412 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 Gramd1b-204ENSMUST00000121357 7334 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 Slf1-201ENSMUST00000151524 3747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 Gm45793-201ENSMUST00000207900 1342 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 Gm26544-201ENSMUST00000181404 2763 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 Tceal1-201ENSMUST00000055104 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 Cxcr1-202ENSMUST00000190313 1451 ntAPPRIS P1 BASIC5.71□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 Gm9874-202ENSMUST00000194957 1464 ntBASIC5.71□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 Haus2-202ENSMUST00000110706 3055 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 Atp2b4-202ENSMUST00000112264 3324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 Gm18451-201ENSMUST00000196759 1719 ntBASIC5.71□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 Gm42705-201ENSMUST00000200176 2465 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 Tmem182-201ENSMUST00000114765 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 Pde1a-203ENSMUST00000102652 1646 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 AC164567.3-201ENSMUST00000217743 2869 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 Fryl-201ENSMUST00000094700 9852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 Gm22781-201ENSMUST00000104083 137 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 Trappc2-201ENSMUST00000112192 1294 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 Serpina3h-202ENSMUST00000116393 1226 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 Gm12874-201ENSMUST00000117190 913 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 Gm14201-201ENSMUST00000117627 289 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 Gm13207-201ENSMUST00000119862 773 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 Gm6067-201ENSMUST00000121648 491 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 Gm12027-201ENSMUST00000146531 949 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 Gm44-201ENSMUST00000172155 993 ntAPPRIS P1 BASIC5.71□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 Rian-203ENSMUST00000181527 989 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 Gm28006-201ENSMUST00000183841 122 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 Gm29048-201ENSMUST00000185342 615 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
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Ccl20O89093 Gm28219-201ENSMUST00000185452 696 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 Gm29403-201ENSMUST00000185491 615 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 Gm28542-201ENSMUST00000185545 696 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 1700003P14Rik-201ENSMUST00000185602 1078 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 Gm28303-201ENSMUST00000185642 747 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
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Ccl20O89093 Gm29244-201ENSMUST00000185825 696 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 Gm29437-201ENSMUST00000185865 696 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 Gm29412-201ENSMUST00000185869 696 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 Gm28910-201ENSMUST00000185921 696 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 Gm28812-201ENSMUST00000185963 696 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 Gm29468-201ENSMUST00000185978 696 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 Gm28248-201ENSMUST00000186093 615 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 Gm28335-201ENSMUST00000186204 696 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 Gm29633-202ENSMUST00000186217 615 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 Gm28854-201ENSMUST00000186218 696 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 Gm28829-201ENSMUST00000186231 615 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 Gm28636-201ENSMUST00000186353 696 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 Gm29043-201ENSMUST00000186371 623 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 Gm28261-201ENSMUST00000186417 615 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 Gm28452-201ENSMUST00000186623 696 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 Gm29298-201ENSMUST00000186704 696 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 Gm28815-201ENSMUST00000186751 615 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 Gm28580-201ENSMUST00000186767 88 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 Gm28185-201ENSMUST00000186815 694 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 Gm28608-201ENSMUST00000186860 615 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 Gm28227-201ENSMUST00000186862 696 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 Gm28796-201ENSMUST00000186905 696 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
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