Protein–RNA interactions for Protein: M0QWN7

Usp35, Ubiquitin-specific peptidase 35, mousemouse

Predictions only

Length 1,009 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp35M0QWN7 Odaph-201ENSMUST00000178614 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Usp35M0QWN7 Gm26801-201ENSMUST00000180591 1219 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Usp35M0QWN7 Zfp572-202ENSMUST00000184208 1078 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Usp35M0QWN7 Gm28416-201ENSMUST00000188334 292 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Usp35M0QWN7 Gm28493-201ENSMUST00000188427 604 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Usp35M0QWN7 Gm28644-201ENSMUST00000191364 585 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Usp35M0QWN7 Gm8101-201ENSMUST00000192796 478 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Usp35M0QWN7 Gm9057-201ENSMUST00000198791 296 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Usp35M0QWN7 Gm7663-201ENSMUST00000201151 1240 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Usp35M0QWN7 Gm44548-201ENSMUST00000208929 192 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Usp35M0QWN7 Gm44582-201ENSMUST00000209125 445 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Usp35M0QWN7 1700047O18Rik-201ENSMUST00000209738 743 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Usp35M0QWN7 Gm6213-201ENSMUST00000209966 638 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Usp35M0QWN7 Gm35021-202ENSMUST00000210289 961 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Usp35M0QWN7 AC113204.1-203ENSMUST00000219475 375 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Usp35M0QWN7 AC055772.1-201ENSMUST00000222646 395 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Usp35M0QWN7 Psg17-201ENSMUST00000004655 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Usp35M0QWN7 Olfr1342-201ENSMUST00000060562 1002 ntAPPRIS P1 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Usp35M0QWN7 Tas2r104-201ENSMUST00000072404 909 ntAPPRIS P1 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Usp35M0QWN7 Adgrg4-201ENSMUST00000096431 1137 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Usp35M0QWN7 Gm10705-201ENSMUST00000098980 461 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Usp35M0QWN7 Gm40649-201ENSMUST00000219795 1457 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Usp35M0QWN7 Gm44530-201ENSMUST00000207920 3559 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Usp35M0QWN7 Zfp638-202ENSMUST00000113835 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Usp35M0QWN7 Gm13057-201ENSMUST00000105776 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Usp35M0QWN7 Gm13043-201ENSMUST00000178489 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Usp35M0QWN7 Gm21036-201ENSMUST00000207544 2611 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Usp35M0QWN7 Ttf1-201ENSMUST00000100237 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 Gpatch11-201ENSMUST00000170759 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 4930505O20Rik-201ENSMUST00000142188 1758 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 4933439N06Rik-201ENSMUST00000203062 1365 ntBASIC7.59□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 Lrguk-204ENSMUST00000228187 10475 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 Gucy1b3-201ENSMUST00000029635 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 Gm38276-201ENSMUST00000192446 1343 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 Eci3-201ENSMUST00000021853 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 Gm17354-201ENSMUST00000170933 3039 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 Vmn1r184-203ENSMUST00000227232 8472 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 Ksr2-202ENSMUST00000180430 13125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 Sema6d-205ENSMUST00000103238 3165 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 Gm35315-202ENSMUST00000210052 3523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 Gm14035-201ENSMUST00000117596 1475 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 Gm15422-201ENSMUST00000117453 541 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 Gm11903-201ENSMUST00000118958 727 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 Sumo2-207ENSMUST00000153892 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 Vwc2l-204ENSMUST00000162182 1195 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 Svs6-201ENSMUST00000017144 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 Vmn2r-ps134-201ENSMUST00000176907 1046 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 Gm23945-201ENSMUST00000179609 92 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 Gm27042-201ENSMUST00000181109 1097 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 Scgb1b21-202ENSMUST00000182901 278 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 Traf1-209ENSMUST00000201690 386 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 Pde6h-203ENSMUST00000204382 211 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 1700051K13Rik-201ENSMUST00000204426 696 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 Gm18690-201ENSMUST00000204488 985 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 Rpl17-ps6-201ENSMUST00000222192 532 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 Vmn1r53-201ENSMUST00000076086 1122 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 Mir484-201ENSMUST00000093566 67 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 Olfr557-201ENSMUST00000098218 1057 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 1700026J12Rik-201ENSMUST00000098226 1127 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 Sult2a3-201ENSMUST00000098809 1018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 Cd274-201ENSMUST00000016640 3622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 Olfr1357-204ENSMUST00000213877 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 Tpte-201ENSMUST00000077194 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 Mef2c-228ENSMUST00000199450 2862 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 Gm9585-201ENSMUST00000219681 1404 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 4921518K17Rik-201ENSMUST00000143949 3390 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 C230057A21Rik-201ENSMUST00000194944 3331 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 Zfp667-201ENSMUST00000086327 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 Noct-202ENSMUST00000144826 9797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 Gm13986-202ENSMUST00000148587 3469 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 Olfr1275-202ENSMUST00000216421 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 Abca4-207ENSMUST00000141135 3606 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 Gm42969-201ENSMUST00000199858 3631 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 4933400C23Rik-201ENSMUST00000188610 1708 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 Rdh11-203ENSMUST00000161204 3262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 Gm42508-201ENSMUST00000199972 3292 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 Etl4-202ENSMUST00000066509 7197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 Kif4-ps-201ENSMUST00000184686 3665 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 Gm44185-201ENSMUST00000204539 3307 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 Gbp11-202ENSMUST00000171587 1329 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 Tph1-201ENSMUST00000049298 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 Mapk10-203ENSMUST00000112847 7196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 4930548H24Rik-201ENSMUST00000031020 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 AC138284.1-201ENSMUST00000214258 3236 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 Mapk8-205ENSMUST00000111945 5756 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 Ighv14-4-201ENSMUST00000103475 333 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 Gm22707-201ENSMUST00000103834 110 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 Fam107b-204ENSMUST00000115054 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 Gm12174-201ENSMUST00000119853 813 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 Gm15007-201ENSMUST00000119982 710 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 Gm16224-201ENSMUST00000127711 412 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 Gm14503-201ENSMUST00000130337 1164 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 Ctcflos-202ENSMUST00000142207 918 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 Gm24157-201ENSMUST00000175265 111 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 Gm29036-201ENSMUST00000189967 877 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 Fabp7-201ENSMUST00000020024 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 Gm32884-201ENSMUST00000205528 732 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 Gm44971-201ENSMUST00000206192 337 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 Gm4585-201ENSMUST00000207218 452 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 AC154562.1-201ENSMUST00000226140 966 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms