Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN0

Gm28048, Predicted gene, 28048 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28048F7BCN0 Gm42894-201ENSMUST00000200788 3390 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Gm28048F7BCN0 Gm37086-201ENSMUST00000193082 3452 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Gm28048F7BCN0 Chrnb3-202ENSMUST00000079463 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
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Gm28048F7BCN0 Igkv8-30-201ENSMUST00000103378 368 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
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Gm28048F7BCN0 Gm26417-201ENSMUST00000104274 135 ntBASIC6□□□□□ -1.45
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Gm28048F7BCN0 Gm15928-201ENSMUST00000122455 280 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Gm28048F7BCN0 Gm15242-201ENSMUST00000122459 283 ntBASIC6□□□□□ -1.45
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Gm28048F7BCN0 Gm16984-201ENSMUST00000130003 982 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
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Gm28048F7BCN0 Gm43141-201ENSMUST00000199695 274 ntBASIC6□□□□□ -1.45
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Gm28048F7BCN0 Zfp799-203ENSMUST00000201876 632 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
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Gm28048F7BCN0 A330076H08Rik-203ENSMUST00000208822 1164 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
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Gm28048F7BCN0 Stra6l-202ENSMUST00000107782 4009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
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Gm28048F7BCN0 Olfr121-202ENSMUST00000174675 1494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Gm28048F7BCN0 Gm37863-201ENSMUST00000194911 1457 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Gm28048F7BCN0 Gm44889-203ENSMUST00000208346 1589 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Gm28048F7BCN0 Tmem182-201ENSMUST00000114765 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
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Gm28048F7BCN0 Zfp35-201ENSMUST00000074941 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Gm28048F7BCN0 Nsrp1-201ENSMUST00000102494 3114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
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Gm28048F7BCN0 Lcp1-209ENSMUST00000145303 3841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
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Gm28048F7BCN0 Cfhr2-201ENSMUST00000094489 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm28048F7BCN0 Gm12290-201ENSMUST00000145095 2112 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
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Gm28048F7BCN0 Osbpl9-213ENSMUST00000160271 2604 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm28048F7BCN0 Bmi1-202ENSMUST00000051929 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
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Gm28048F7BCN0 Prh1-203ENSMUST00000177523 993 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
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Gm28048F7BCN0 Scn8a-207ENSMUST00000200959 587 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm28048F7BCN0 Gm33326-201ENSMUST00000209741 3815 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm28048F7BCN0 Gm39271-201ENSMUST00000212881 434 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
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Gm28048F7BCN0 Olfr730-201ENSMUST00000051453 957 ntAPPRIS P2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
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Gm28048F7BCN0 Olfr1129-201ENSMUST00000081034 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm28048F7BCN0 H2al1j-201ENSMUST00000091180 330 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm28048F7BCN0 Prrc2c-201ENSMUST00000028016 8815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm28048F7BCN0 Dnajc15-202ENSMUST00000226459 6193 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm28048F7BCN0 Catsperg2-209ENSMUST00000209126 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm28048F7BCN0 Erap1-201ENSMUST00000169114 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm28048F7BCN0 Sytl5-201ENSMUST00000067529 2301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm28048F7BCN0 Gm44068-201ENSMUST00000204049 2128 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
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