Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V6

Hdac5, Histone deacetylase 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac5Q9Z2V6 1700034P13Rik-204ENSMUST00000189431 555 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hdac5Q9Z2V6 Gm29238-201ENSMUST00000189709 695 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Hdac5Q9Z2V6 Gm28607-201ENSMUST00000190142 339 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Hdac5Q9Z2V6 Gm28121-201ENSMUST00000191420 339 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Hdac5Q9Z2V6 Gm37585-201ENSMUST00000195440 280 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Hdac5Q9Z2V6 Hax1-204ENSMUST00000197725 648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hdac5Q9Z2V6 Olfr1357-203ENSMUST00000205085 1012 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hdac5Q9Z2V6 Olfr494-201ENSMUST00000209743 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hdac5Q9Z2V6 Gm36173-201ENSMUST00000219101 1163 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hdac5Q9Z2V6 4930567K20Rik-203ENSMUST00000220108 646 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hdac5Q9Z2V6 Gm46317-201ENSMUST00000221103 393 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Hdac5Q9Z2V6 AC162183.1-201ENSMUST00000224843 472 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Hdac5Q9Z2V6 Olfr781-201ENSMUST00000075613 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hdac5Q9Z2V6 Olfr1261-201ENSMUST00000077785 921 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hdac5Q9Z2V6 Eif4e2-207ENSMUST00000113235 3473 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hdac5Q9Z2V6 Zfp963-201ENSMUST00000130458 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hdac5Q9Z2V6 Nprl2-201ENSMUST00000010201 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hdac5Q9Z2V6 C87499-201ENSMUST00000053304 1901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hdac5Q9Z2V6 Inpp5d-211ENSMUST00000170300 3942 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hdac5Q9Z2V6 4930555G01Rik-201ENSMUST00000112770 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hdac5Q9Z2V6 Gm3099-201ENSMUST00000112787 2065 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hdac5Q9Z2V6 Asxl2-202ENSMUST00000111215 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hdac5Q9Z2V6 Lrriq3-202ENSMUST00000192383 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hdac5Q9Z2V6 Gm45807-201ENSMUST00000209142 2874 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Hdac5Q9Z2V6 Lsamp-202ENSMUST00000099761 8794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hdac5Q9Z2V6 Clasp2-207ENSMUST00000214522 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hdac5Q9Z2V6 Bdnf-210ENSMUST00000111051 4125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Hdac5Q9Z2V6 Gm37937-201ENSMUST00000194130 2168 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Hdac5Q9Z2V6 Adam22-206ENSMUST00000115386 9056 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Hdac5Q9Z2V6 Cpvl-203ENSMUST00000204674 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Hdac5Q9Z2V6 Gm18537-202ENSMUST00000206215 1503 ntBASIC11.4□□□□□ -0.59
Hdac5Q9Z2V6 Ntsr1-201ENSMUST00000029084 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Hdac5Q9Z2V6 Rai14-207ENSMUST00000227506 4732 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Hdac5Q9Z2V6 Lrrc1-201ENSMUST00000113421 2630 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hdac5Q9Z2V6 5430401H09Rik-202ENSMUST00000218836 2620 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hdac5Q9Z2V6 Erp44-201ENSMUST00000030028 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hdac5Q9Z2V6 Lingo2-201ENSMUST00000065173 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hdac5Q9Z2V6 Zfp939-201ENSMUST00000061201 2131 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Hdac5Q9Z2V6 Rrp12-201ENSMUST00000038677 4319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hdac5Q9Z2V6 3830406C13Rik-206ENSMUST00000223762 2292 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hdac5Q9Z2V6 Gm26730-201ENSMUST00000181270 1338 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hdac5Q9Z2V6 Nt5dc1-201ENSMUST00000047885 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hdac5Q9Z2V6 Olfr770-204ENSMUST00000204712 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hdac5Q9Z2V6 Gm16233-201ENSMUST00000136170 1623 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hdac5Q9Z2V6 Rgs9-203ENSMUST00000106704 3464 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hdac5Q9Z2V6 Olfr1284-201ENSMUST00000062407 1774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hdac5Q9Z2V6 Kpna2-202ENSMUST00000106768 541 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hdac5Q9Z2V6 Gmfg-202ENSMUST00000108289 477 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hdac5Q9Z2V6 Eif2s3x-202ENSMUST00000113922 1103 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hdac5Q9Z2V6 Gm12306-201ENSMUST00000117256 171 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Hdac5Q9Z2V6 Vmn1r-ps1-201ENSMUST00000118738 573 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Hdac5Q9Z2V6 Defa-ps1-201ENSMUST00000119062 282 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Hdac5Q9Z2V6 Defa-ps6-201ENSMUST00000122172 282 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Hdac5Q9Z2V6 Gm23981-201ENSMUST00000157136 106 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Hdac5Q9Z2V6 Gm9141-201ENSMUST00000159355 1007 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Hdac5Q9Z2V6 Vmn1r-ps59-201ENSMUST00000172698 199 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Hdac5Q9Z2V6 Mthfr-ps1-201ENSMUST00000174153 601 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Hdac5Q9Z2V6 Vmn2r-ps37-201ENSMUST00000174682 1044 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Hdac5Q9Z2V6 Gm25690-201ENSMUST00000175439 77 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Hdac5Q9Z2V6 Gm6176-201ENSMUST00000178209 906 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hdac5Q9Z2V6 Gm4567-201ENSMUST00000178591 906 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hdac5Q9Z2V6 Gm10668-201ENSMUST00000179491 906 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hdac5Q9Z2V6 2010005H15Rik-202ENSMUST00000187183 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hdac5Q9Z2V6 Olfr1391-201ENSMUST00000187509 938 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hdac5Q9Z2V6 1700021A07Rik-202ENSMUST00000187763 485 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hdac5Q9Z2V6 Gm28784-201ENSMUST00000187817 1011 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hdac5Q9Z2V6 Gm29525-201ENSMUST00000189844 699 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Hdac5Q9Z2V6 Gm4545-201ENSMUST00000190797 603 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Hdac5Q9Z2V6 Gm29018-202ENSMUST00000191356 313 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hdac5Q9Z2V6 Gm29523-201ENSMUST00000191415 699 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Hdac5Q9Z2V6 Gm43096-201ENSMUST00000196173 421 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Hdac5Q9Z2V6 Igkv12-47-201ENSMUST00000196961 356 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Hdac5Q9Z2V6 Gm43148-201ENSMUST00000198237 520 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Hdac5Q9Z2V6 Trav3-2-201ENSMUST00000198999 305 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Hdac5Q9Z2V6 Dcp2-202ENSMUST00000202306 398 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hdac5Q9Z2V6 Gm43971-201ENSMUST00000205010 743 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hdac5Q9Z2V6 Gm38430-201ENSMUST00000209888 1240 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Hdac5Q9Z2V6 Gm45299-201ENSMUST00000210199 420 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Hdac5Q9Z2V6 Gm7495-201ENSMUST00000215099 426 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Hdac5Q9Z2V6 Gm32443-201ENSMUST00000217880 707 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hdac5Q9Z2V6 Gm19074-201ENSMUST00000218915 1429 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Hdac5Q9Z2V6 Olfr480-201ENSMUST00000071658 1029 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Hdac5Q9Z2V6 Rgr-201ENSMUST00000022338 4240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hdac5Q9Z2V6 Ssh2-201ENSMUST00000037912 9178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hdac5Q9Z2V6 Olfr523-203ENSMUST00000213953 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hdac5Q9Z2V6 Gm17821-201ENSMUST00000223448 1693 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Hdac5Q9Z2V6 Olfr1318-201ENSMUST00000058176 1690 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hdac5Q9Z2V6 Pdgfd-201ENSMUST00000058692 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hdac5Q9Z2V6 6430562O15Rik-202ENSMUST00000180808 3997 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hdac5Q9Z2V6 Mmaa-201ENSMUST00000048718 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hdac5Q9Z2V6 C5ar2-201ENSMUST00000098792 3429 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hdac5Q9Z2V6 Tlr4-202ENSMUST00000107365 1866 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hdac5Q9Z2V6 Ttc39d-202ENSMUST00000134652 2438 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hdac5Q9Z2V6 AC163040.2-201ENSMUST00000223462 3534 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hdac5Q9Z2V6 Gm37022-201ENSMUST00000192517 2254 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Hdac5Q9Z2V6 Gm14226-201ENSMUST00000130870 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hdac5Q9Z2V6 6330549D23Rik-203ENSMUST00000160818 3228 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hdac5Q9Z2V6 Ccdc127-203ENSMUST00000160021 2682 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hdac5Q9Z2V6 Gm17101-201ENSMUST00000169520 1588 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Hdac5Q9Z2V6 Olfr1315-ps1-203ENSMUST00000217078 1559 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms