Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Rabgef1Q9JM13 Dmrtc1c2-202ENSMUST00000087899 717 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r194-201ENSMUST00000091737 891 ntAPPRIS P1 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Rabgef1Q9JM13 2310069B03Rik-202ENSMUST00000186147 1833 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
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Rabgef1Q9JM13 Fam193a-201ENSMUST00000094867 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
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Rabgef1Q9JM13 Mapk1ip1l-202ENSMUST00000166743 4542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
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Rabgef1Q9JM13 AC164623.1-201ENSMUST00000217947 2709 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
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Rabgef1Q9JM13 BC067074-201ENSMUST00000078163 3546 ntTSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
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Rabgef1Q9JM13 Golgb1-203ENSMUST00000114812 11012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
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Rabgef1Q9JM13 Lrrcc1-206ENSMUST00000169079 5638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
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Rabgef1Q9JM13 2010110K18Rik-201ENSMUST00000181453 2400 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
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