Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Gm34225-201ENSMUST00000205469 443 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Col5a3Q9JLI2 Il9-201ENSMUST00000022019 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Col5a3Q9JLI2 AC122327.2-201ENSMUST00000220883 120 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Col5a3Q9JLI2 AC122327.3-201ENSMUST00000221852 120 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Col5a3Q9JLI2 AC166341.1-201ENSMUST00000223360 105 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Col5a3Q9JLI2 Sntn-201ENSMUST00000061045 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Col5a3Q9JLI2 Olfr1132-201ENSMUST00000090711 927 ntAPPRIS P1 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Col5a3Q9JLI2 Olfr657-201ENSMUST00000098171 960 ntAPPRIS P1 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Col5a3Q9JLI2 Tpp1-201ENSMUST00000033184 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Col5a3Q9JLI2 Ptpn3-201ENSMUST00000075637 6369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Col5a3Q9JLI2 Inpp5d-211ENSMUST00000170300 3942 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
Col5a3Q9JLI2 Mettl6-201ENSMUST00000055303 3946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Col5a3Q9JLI2 Efl1-205ENSMUST00000179489 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Col5a3Q9JLI2 Slc7a2-204ENSMUST00000118432 3681 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Col5a3Q9JLI2 Cers4-201ENSMUST00000008350 9475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Col5a3Q9JLI2 Nrxn3-205ENSMUST00000163134 7922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Col5a3Q9JLI2 Gm21846-201ENSMUST00000179257 3073 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Col5a3Q9JLI2 Zfp292-201ENSMUST00000047950 9986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Col5a3Q9JLI2 Xpo1-203ENSMUST00000102870 3471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Col5a3Q9JLI2 4930412C18Rik-202ENSMUST00000138390 3839 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Col5a3Q9JLI2 Olfr449-204ENSMUST00000214687 1921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
Col5a3Q9JLI2 Gm37951-201ENSMUST00000192963 3032 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Col5a3Q9JLI2 Gm14356-201ENSMUST00000118322 869 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Col5a3Q9JLI2 Gm13207-201ENSMUST00000119862 773 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Col5a3Q9JLI2 Vmn2r-ps131-201ENSMUST00000176094 1046 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Col5a3Q9JLI2 Gm8009-201ENSMUST00000191672 436 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Col5a3Q9JLI2 Gm37770-201ENSMUST00000192855 772 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Col5a3Q9JLI2 Gm42619-201ENSMUST00000197564 1136 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Col5a3Q9JLI2 Gm43098-201ENSMUST00000199989 1297 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Col5a3Q9JLI2 Gm19033-201ENSMUST00000208516 964 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Col5a3Q9JLI2 CT485607.3-201ENSMUST00000213361 672 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Col5a3Q9JLI2 Gm33619-201ENSMUST00000215633 662 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
Col5a3Q9JLI2 Gm19116-201ENSMUST00000218592 642 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Col5a3Q9JLI2 AC113125.2-201ENSMUST00000226837 362 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Col5a3Q9JLI2 AC125117.2-201ENSMUST00000228344 1140 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Col5a3Q9JLI2 Olfr836-201ENSMUST00000074986 955 ntAPPRIS P2 BASIC7□□□□□ -1.29
Col5a3Q9JLI2 Xlr5b-201ENSMUST00000097221 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Col5a3Q9JLI2 Tial1-211ENSMUST00000165023 2003 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Col5a3Q9JLI2 Ifi202b-201ENSMUST00000000266 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Col5a3Q9JLI2 Tom1l1-202ENSMUST00000107867 2439 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Col5a3Q9JLI2 Bmx-201ENSMUST00000112263 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Col5a3Q9JLI2 Naalad2-201ENSMUST00000001826 2831 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Col5a3Q9JLI2 Slc26a2-201ENSMUST00000037603 2802 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Col5a3Q9JLI2 Ganc-205ENSMUST00000135074 4780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
Col5a3Q9JLI2 Wnk1-218ENSMUST00000161512 1426 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Col5a3Q9JLI2 Frmd4b-204ENSMUST00000113359 4311 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Col5a3Q9JLI2 Gm37783-201ENSMUST00000192025 1856 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Col5a3Q9JLI2 Pak7-202ENSMUST00000077200 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Col5a3Q9JLI2 Kcnc2-202ENSMUST00000218445 4033 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Col5a3Q9JLI2 Mroh2a-201ENSMUST00000061013 7526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Col5a3Q9JLI2 Usp17ld-201ENSMUST00000073394 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Col5a3Q9JLI2 Zfp27-206ENSMUST00000172448 2460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Col5a3Q9JLI2 Pcdh15-227ENSMUST00000152655 3860 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Col5a3Q9JLI2 Krcc1-202ENSMUST00000168700 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Col5a3Q9JLI2 1700014D04Rik-203ENSMUST00000180139 3231 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Col5a3Q9JLI2 Dcn-202ENSMUST00000163448 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Col5a3Q9JLI2 Armc2-203ENSMUST00000160262 4810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Col5a3Q9JLI2 Gm10378-201ENSMUST00000100696 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Col5a3Q9JLI2 Ccdc7b-203ENSMUST00000108745 1047 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Col5a3Q9JLI2 Gm11105-201ENSMUST00000112781 478 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Col5a3Q9JLI2 Gm14457-201ENSMUST00000148069 1161 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Col5a3Q9JLI2 Gm7152-201ENSMUST00000163570 605 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Col5a3Q9JLI2 Gm21772-201ENSMUST00000169213 478 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Col5a3Q9JLI2 Gm17126-201ENSMUST00000172276 523 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
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Col5a3Q9JLI2 Gm40330-201ENSMUST00000196498 669 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Col5a3Q9JLI2 Gm5886-201ENSMUST00000203420 641 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
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Col5a3Q9JLI2 Nqo2-201ENSMUST00000021843 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
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Col5a3Q9JLI2 CT030254.1-201ENSMUST00000225450 1078 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
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Col5a3Q9JLI2 Gm7995-201ENSMUST00000089789 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Col5a3Q9JLI2 Ttc37-201ENSMUST00000091466 5381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Col5a3Q9JLI2 Sptbn1-201ENSMUST00000006629 8461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Col5a3Q9JLI2 Ep400-203ENSMUST00000112435 10420 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Col5a3Q9JLI2 Gm5177-202ENSMUST00000183337 3785 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Col5a3Q9JLI2 Rtel1-202ENSMUST00000054622 4401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Col5a3Q9JLI2 AC132465.2-201ENSMUST00000218673 2728 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Col5a3Q9JLI2 Gm13078-201ENSMUST00000078695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Col5a3Q9JLI2 Gm4994-201ENSMUST00000118379 2187 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Col5a3Q9JLI2 Gm12919-201ENSMUST00000119855 1594 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Col5a3Q9JLI2 Slc1a3-201ENSMUST00000005493 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Col5a3Q9JLI2 Atf7ip-201ENSMUST00000032335 8059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Col5a3Q9JLI2 Fstl5-203ENSMUST00000160261 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Col5a3Q9JLI2 Olfr259-202ENSMUST00000213978 4046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Col5a3Q9JLI2 Gm42866-201ENSMUST00000195919 3304 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Col5a3Q9JLI2 Gm42972-201ENSMUST00000196937 5617 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Col5a3Q9JLI2 Arpp21-210ENSMUST00000159451 2805 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Col5a3Q9JLI2 E030032P16Rik-201ENSMUST00000198813 2931 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Col5a3Q9JLI2 Soat1-201ENSMUST00000051396 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Col5a3Q9JLI2 Gm14000-201ENSMUST00000118670 233 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Col5a3Q9JLI2 Rbpsuh-ps1-201ENSMUST00000119456 1006 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Col5a3Q9JLI2 Gm11622-201ENSMUST00000120525 691 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Col5a3Q9JLI2 Gm11415-201ENSMUST00000128214 480 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Col5a3Q9JLI2 Adam3-210ENSMUST00000171611 1202 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Col5a3Q9JLI2 Gm29353-201ENSMUST00000185801 620 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Col5a3Q9JLI2 Gm37430-201ENSMUST00000193039 196 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
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