Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU3

Riok3, Serine/threonine-protein kinase RIO3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riok3Q9DBU3 Gm28461-201ENSMUST00000190023 484 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Riok3Q9DBU3 Gm37881-201ENSMUST00000193001 421 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Riok3Q9DBU3 Gm37976-201ENSMUST00000193827 345 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Riok3Q9DBU3 Gm34248-201ENSMUST00000200027 474 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Riok3Q9DBU3 Mir7227-201ENSMUST00000200408 59 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Riok3Q9DBU3 Olfr747-202ENSMUST00000205373 1132 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Riok3Q9DBU3 Gm30790-202ENSMUST00000208527 809 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Riok3Q9DBU3 Gm45439-201ENSMUST00000211723 359 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Riok3Q9DBU3 Gm18924-201ENSMUST00000211929 316 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Riok3Q9DBU3 Gm18587-201ENSMUST00000213736 841 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Riok3Q9DBU3 Fkbp1b-202ENSMUST00000219880 246 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Riok3Q9DBU3 AC132315.1-201ENSMUST00000221771 390 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Riok3Q9DBU3 Gm9318-201ENSMUST00000222444 438 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Riok3Q9DBU3 AC134468.2-201ENSMUST00000222549 672 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Riok3Q9DBU3 4930404H11Rik-202ENSMUST00000222756 1271 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Riok3Q9DBU3 AC165092.4-201ENSMUST00000225025 679 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Riok3Q9DBU3 Olfr655-201ENSMUST00000057385 927 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Riok3Q9DBU3 Olfr543-201ENSMUST00000061482 1130 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Riok3Q9DBU3 Gm24622-201ENSMUST00000082619 162 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Riok3Q9DBU3 Mtbp-201ENSMUST00000022998 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Riok3Q9DBU3 B930082K07Rik-201ENSMUST00000181046 2478 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Riok3Q9DBU3 Cyp2e1-201ENSMUST00000026552 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Riok3Q9DBU3 Gm5721-201ENSMUST00000119845 1696 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Riok3Q9DBU3 Tomm40l-202ENSMUST00000111326 2753 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Riok3Q9DBU3 Gm37200-201ENSMUST00000193689 2172 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Riok3Q9DBU3 Zfp446-203ENSMUST00000108536 3705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Riok3Q9DBU3 Sptbn1-201ENSMUST00000006629 8461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Riok3Q9DBU3 Zfp791-201ENSMUST00000098550 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Riok3Q9DBU3 Ube2f-203ENSMUST00000171165 5654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Riok3Q9DBU3 Plxna4-201ENSMUST00000115096 12877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Riok3Q9DBU3 Nup107-202ENSMUST00000167943 3098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Riok3Q9DBU3 Ctnnd1-214ENSMUST00000111688 6146 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Riok3Q9DBU3 Klhl20-201ENSMUST00000111611 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Riok3Q9DBU3 Xrcc4-201ENSMUST00000022115 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Riok3Q9DBU3 Hdac4-202ENSMUST00000097644 8100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Riok3Q9DBU3 Mia3-202ENSMUST00000109158 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Riok3Q9DBU3 Sox2ot-211ENSMUST00000197977 2970 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Riok3Q9DBU3 Olfr272-203ENSMUST00000213989 1973 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Riok3Q9DBU3 Ucn3-201ENSMUST00000058610 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Riok3Q9DBU3 Smoc1-201ENSMUST00000021564 3439 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Riok3Q9DBU3 AC093022.3-201ENSMUST00000226569 1926 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Riok3Q9DBU3 Pear1-203ENSMUST00000090981 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Riok3Q9DBU3 2900011O08Rik-201ENSMUST00000056521 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Riok3Q9DBU3 Gm37702-201ENSMUST00000194357 1872 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Riok3Q9DBU3 Dhx30-203ENSMUST00000165596 3726 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Riok3Q9DBU3 Ttf1-201ENSMUST00000100237 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Riok3Q9DBU3 Cd300a-202ENSMUST00000106582 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Riok3Q9DBU3 AC113304.1-201ENSMUST00000214014 1833 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Riok3Q9DBU3 Stk38l-202ENSMUST00000111644 2274 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Riok3Q9DBU3 Eif2ak4-205ENSMUST00000110872 4907 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Riok3Q9DBU3 Olfr1305-203ENSMUST00000213737 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Riok3Q9DBU3 Carf-206ENSMUST00000180952 2157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Riok3Q9DBU3 Shcbp1-201ENSMUST00000022945 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Riok3Q9DBU3 Faf2-201ENSMUST00000026991 1748 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Riok3Q9DBU3 Ccdc163-203ENSMUST00000106463 1159 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Riok3Q9DBU3 0610037L13Rik-203ENSMUST00000106726 515 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Riok3Q9DBU3 Gm12538-201ENSMUST00000120064 486 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Riok3Q9DBU3 Pradc1-204ENSMUST00000126805 953 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Riok3Q9DBU3 Gm2663-201ENSMUST00000166306 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Riok3Q9DBU3 Gm10772-201ENSMUST00000167981 255 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Riok3Q9DBU3 Siglech-208ENSMUST00000173835 833 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Riok3Q9DBU3 Rps28-205ENSMUST00000173844 382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Riok3Q9DBU3 Smarce1-ps1-201ENSMUST00000180067 1077 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Riok3Q9DBU3 Gm7784-201ENSMUST00000180769 989 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Riok3Q9DBU3 Gm16470-201ENSMUST00000182456 998 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Riok3Q9DBU3 1700060O08Rik-201ENSMUST00000185390 281 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Riok3Q9DBU3 Rpl23a-ps10-201ENSMUST00000185511 462 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Riok3Q9DBU3 Gm28342-201ENSMUST00000190308 589 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Riok3Q9DBU3 Tdpoz2-201ENSMUST00000191960 1145 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Riok3Q9DBU3 Mir142-201ENSMUST00000198092 64 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Riok3Q9DBU3 Gm44131-201ENSMUST00000203036 394 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Riok3Q9DBU3 1700012J15Rik-201ENSMUST00000203458 471 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Riok3Q9DBU3 Gm43154-210ENSMUST00000210190 1051 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Riok3Q9DBU3 AC152415.1-201ENSMUST00000213320 440 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Riok3Q9DBU3 Olfr517-202ENSMUST00000216500 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Riok3Q9DBU3 Cryab-206ENSMUST00000217475 1117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Riok3Q9DBU3 AC167013.6-201ENSMUST00000226587 1067 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Riok3Q9DBU3 Ndufa4-201ENSMUST00000031637 468 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Riok3Q9DBU3 Olfr49-201ENSMUST00000059996 1030 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Riok3Q9DBU3 Gpatch2l-201ENSMUST00000071106 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Riok3Q9DBU3 Olfr1386-201ENSMUST00000071905 1128 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Riok3Q9DBU3 Gm10291-201ENSMUST00000094175 999 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Riok3Q9DBU3 Hdac7-203ENSMUST00000116408 4226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Riok3Q9DBU3 Wdr61-202ENSMUST00000118771 3372 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Riok3Q9DBU3 Elovl2-202ENSMUST00000117096 3797 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Riok3Q9DBU3 Gm732-201ENSMUST00000101290 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Riok3Q9DBU3 Zfp541-201ENSMUST00000108509 4561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Riok3Q9DBU3 Gm6567-201ENSMUST00000205529 2095 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Riok3Q9DBU3 Dennd1b-202ENSMUST00000168527 8206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Riok3Q9DBU3 Tmod3-201ENSMUST00000072232 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Riok3Q9DBU3 Gm17751-201ENSMUST00000189132 2004 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Riok3Q9DBU3 Zfp882-201ENSMUST00000110002 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Riok3Q9DBU3 Supt20-ps-201ENSMUST00000117999 1560 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Riok3Q9DBU3 Pdk4-201ENSMUST00000019721 3484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Riok3Q9DBU3 Adgrl2-213ENSMUST00000199059 4637 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Riok3Q9DBU3 Gm26749-201ENSMUST00000181387 1933 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Riok3Q9DBU3 Gpr1-201ENSMUST00000050536 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Riok3Q9DBU3 Kansl3-204ENSMUST00000185912 4527 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Riok3Q9DBU3 Vps45-201ENSMUST00000015891 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Riok3Q9DBU3 Gmeb2-201ENSMUST00000049032 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.2 ms