Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Dmtf1-207ENSMUST00000183973 2408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.15
Ccdc47Q9D024 Tbc1d24-213ENSMUST00000201805 3806 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
Ccdc47Q9D024 Gm43638-201ENSMUST00000201519 2297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.15
Ccdc47Q9D024 Plcb4-202ENSMUST00000110109 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
Ccdc47Q9D024 Pde1c-208ENSMUST00000170774 2132 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
Ccdc47Q9D024 Bbx-205ENSMUST00000114488 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
Ccdc47Q9D024 Gm43876-201ENSMUST00000203831 3229 ntBASIC7.9□□□□□ -1.15
Ccdc47Q9D024 Atp10b-201ENSMUST00000077659 6825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Ccdc47Q9D024 Olfr539-202ENSMUST00000218865 11486 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Ccdc47Q9D024 Ptbp3-212ENSMUST00000174586 6640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Ccdc47Q9D024 Dlgap5-208ENSMUST00000180299 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Ccdc47Q9D024 Olfr1513-202ENSMUST00000215147 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Ccdc47Q9D024 Atf2-203ENSMUST00000100009 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Ccdc47Q9D024 Stat4-202ENSMUST00000168302 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Ccdc47Q9D024 Acsm2-207ENSMUST00000167935 6738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Ccdc47Q9D024 Gm15813-201ENSMUST00000142286 2541 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Ccdc47Q9D024 Fbxw19-201ENSMUST00000076617 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Ccdc47Q9D024 Rfx3-201ENSMUST00000046898 4274 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Ccdc47Q9D024 Vmn1r35-203ENSMUST00000227354 2319 ntAPPRIS P1 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Ccdc47Q9D024 4931423N10Rik-202ENSMUST00000114505 1392 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Ccdc47Q9D024 Pcdh15-214ENSMUST00000129404 6857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Ccdc47Q9D024 Gm6327-201ENSMUST00000171185 1335 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Ccdc47Q9D024 Cdc42se1-202ENSMUST00000107199 652 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Ccdc47Q9D024 Vamp7-ps-201ENSMUST00000120334 655 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Ccdc47Q9D024 Gm12629-201ENSMUST00000145751 711 ntTSL 3 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Ccdc47Q9D024 Gm24176-201ENSMUST00000158928 121 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Ccdc47Q9D024 1700022N22Rik-201ENSMUST00000180932 709 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Ccdc47Q9D024 Gm5345-201ENSMUST00000183076 1014 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Ccdc47Q9D024 Gm27360-201ENSMUST00000183487 80 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Ccdc47Q9D024 Trav6d-4-202ENSMUST00000183820 338 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Ccdc47Q9D024 Gm27152-201ENSMUST00000183828 99 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Ccdc47Q9D024 Gm28528-201ENSMUST00000188560 857 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Ccdc47Q9D024 Gm44823-201ENSMUST00000204775 1107 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Ccdc47Q9D024 Gm4585-201ENSMUST00000207218 452 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Ccdc47Q9D024 Gm20751-201ENSMUST00000210260 1270 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Ccdc47Q9D024 Gm18781-201ENSMUST00000211252 924 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Ccdc47Q9D024 AC172194.1-201ENSMUST00000214246 1020 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Ccdc47Q9D024 CT030175.1-201ENSMUST00000220822 408 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Ccdc47Q9D024 Gm19047-201ENSMUST00000220922 1099 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Ccdc47Q9D024 Rbp7-201ENSMUST00000030848 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Ccdc47Q9D024 Olfr49-201ENSMUST00000059996 1030 ntAPPRIS P1 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Ccdc47Q9D024 Ly6c1-201ENSMUST00000065408 844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Ccdc47Q9D024 Olfr342-201ENSMUST00000074192 1054 ntAPPRIS P1 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Ccdc47Q9D024 Gm6887-201ENSMUST00000080945 482 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Ccdc47Q9D024 Olfr461-201ENSMUST00000089490 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Ccdc47Q9D024 Gbp4-201ENSMUST00000100962 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Ccdc47Q9D024 Nlrp10-201ENSMUST00000055745 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Ccdc47Q9D024 Phf6-202ENSMUST00000101587 3639 ntTSL 2 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Ccdc47Q9D024 Olfr720-202ENSMUST00000206298 4437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Ccdc47Q9D024 Gm45201-201ENSMUST00000207187 2679 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Ccdc47Q9D024 Rgs22-203ENSMUST00000172831 4006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Ccdc47Q9D024 Ankfy1-206ENSMUST00000155998 8030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Ccdc47Q9D024 Ifi207-202ENSMUST00000127730 3145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Ccdc47Q9D024 Vmn1r81-202ENSMUST00000227080 13256 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Ccdc47Q9D024 Pde10a-207ENSMUST00000115722 3673 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Ccdc47Q9D024 Ppp1r3b-201ENSMUST00000070481 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Ccdc47Q9D024 Olfr465-ps1-201ENSMUST00000206324 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Ccdc47Q9D024 Eif3e-201ENSMUST00000022960 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Ccdc47Q9D024 Trrap-201ENSMUST00000038980 12344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Ccdc47Q9D024 Gm37518-201ENSMUST00000194930 2603 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Ccdc47Q9D024 BC053393-201ENSMUST00000050937 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Ccdc47Q9D024 AC158115.1-201ENSMUST00000222830 3182 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Ccdc47Q9D024 AC131687.1-201ENSMUST00000225931 5446 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Ccdc47Q9D024 Lats1-203ENSMUST00000217931 4186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Ccdc47Q9D024 Lats1-201ENSMUST00000040043 4155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Ccdc47Q9D024 Gm3555-201ENSMUST00000160287 1395 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Ccdc47Q9D024 E330011O21Rik-204ENSMUST00000210839 1361 ntTSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Ccdc47Q9D024 Dthd1-201ENSMUST00000170704 2427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Ccdc47Q9D024 Gm45949-201ENSMUST00000221550 1895 ntTSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Ccdc47Q9D024 Vmn1r218-202ENSMUST00000226692 10430 ntAPPRIS P2 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Ccdc47Q9D024 Kmt2c-201ENSMUST00000045291 14967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Ccdc47Q9D024 Cfap221-202ENSMUST00000174370 2871 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Ccdc47Q9D024 G6pd2-201ENSMUST00000053876 2348 ntAPPRIS P1 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Ccdc47Q9D024 Gm8281-201ENSMUST00000100893 612 ntTSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Ccdc47Q9D024 Gm14550-201ENSMUST00000117918 407 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Ccdc47Q9D024 Gm16044-201ENSMUST00000118475 450 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Ccdc47Q9D024 Olfr1063-ps1-201ENSMUST00000118807 942 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Ccdc47Q9D024 Gm6142-201ENSMUST00000120290 325 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Ccdc47Q9D024 Gm24545-201ENSMUST00000158651 85 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Ccdc47Q9D024 Csnk2b-209ENSMUST00000174779 632 ntTSL 2 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Ccdc47Q9D024 Gm8237-202ENSMUST00000178594 447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Ccdc47Q9D024 Gm43089-201ENSMUST00000199162 275 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Ccdc47Q9D024 Gm30708-201ENSMUST00000202183 312 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Ccdc47Q9D024 Olfr726-202ENSMUST00000206834 1256 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Ccdc47Q9D024 Gm36843-201ENSMUST00000209303 627 ntTSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Ccdc47Q9D024 Gm45307-201ENSMUST00000211122 751 ntTSL 3 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Ccdc47Q9D024 Gm39463-201ENSMUST00000214575 735 ntTSL 3 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Ccdc47Q9D024 AC102582.2-201ENSMUST00000214658 1137 ntTSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Ccdc47Q9D024 Mobp-206ENSMUST00000214943 435 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Ccdc47Q9D024 Olfr1500-206ENSMUST00000217079 1025 ntAPPRIS P1 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Ccdc47Q9D024 Gm19007-201ENSMUST00000217746 874 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Ccdc47Q9D024 Gm46311-201ENSMUST00000217971 203 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Ccdc47Q9D024 Olfr923-204ENSMUST00000219798 1068 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Ccdc47Q9D024 AC122327.2-201ENSMUST00000220883 120 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Ccdc47Q9D024 AC122327.3-201ENSMUST00000221852 120 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Ccdc47Q9D024 AC154816.1-201ENSMUST00000222688 634 ntTSL 3 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Ccdc47Q9D024 AC166341.1-201ENSMUST00000223360 105 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Ccdc47Q9D024 AC125019.1-201ENSMUST00000224809 908 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Ccdc47Q9D024 Olfr923-201ENSMUST00000051238 1068 ntAPPRIS P1 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Ccdc47Q9D024 Ccr1l1-201ENSMUST00000071404 1166 ntAPPRIS P1 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.8 ms