Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

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Length 1,454 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Olfr1394-202ENSMUST00000216273 3024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
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PtprtQ99M80 Gm23894-201ENSMUST00000158107 313 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
PtprtQ99M80 Gm23071-201ENSMUST00000158242 115 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
PtprtQ99M80 Gm17198-201ENSMUST00000171792 1154 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
PtprtQ99M80 Gm8895-201ENSMUST00000172300 1223 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
PtprtQ99M80 Gm18800-202ENSMUST00000188688 1105 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
PtprtQ99M80 Gm38250-201ENSMUST00000192691 766 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
PtprtQ99M80 Gm9517-201ENSMUST00000195021 874 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
PtprtQ99M80 Vmn1r37-201ENSMUST00000077482 909 ntAPPRIS P2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
PtprtQ99M80 Rnf213-203ENSMUST00000172235 2422 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
PtprtQ99M80 Naa25-201ENSMUST00000042163 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
PtprtQ99M80 Pdlim5-203ENSMUST00000090134 1722 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
PtprtQ99M80 Glmp-209ENSMUST00000177005 4219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
PtprtQ99M80 Atg7-202ENSMUST00000169310 3895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
PtprtQ99M80 Gm36933-201ENSMUST00000194945 3071 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
PtprtQ99M80 Slc5a6-206ENSMUST00000202556 3078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
PtprtQ99M80 Gm26981-201ENSMUST00000182453 3169 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
PtprtQ99M80 Tceal8-204ENSMUST00000163584 2358 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
PtprtQ99M80 Thnsl1-203ENSMUST00000102952 1679 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
PtprtQ99M80 Ftx-205ENSMUST00000156211 4215 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
PtprtQ99M80 Pcdh10-202ENSMUST00000170695 8234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
PtprtQ99M80 Crebbp-205ENSMUST00000205765 7749 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
PtprtQ99M80 Cts8-201ENSMUST00000021891 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
PtprtQ99M80 Frmd4a-219ENSMUST00000177457 6538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
PtprtQ99M80 Gm43719-201ENSMUST00000200088 2199 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
PtprtQ99M80 AC125409.2-201ENSMUST00000221888 2158 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
PtprtQ99M80 Crem-204ENSMUST00000122958 2254 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
PtprtQ99M80 Ambra1-202ENSMUST00000045705 5203 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
PtprtQ99M80 Gm44121-201ENSMUST00000205169 2006 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
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PtprtQ99M80 Crem-216ENSMUST00000136961 807 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
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PtprtQ99M80 Gm17140-201ENSMUST00000169163 627 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
PtprtQ99M80 Gm26057-201ENSMUST00000178099 165 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
PtprtQ99M80 Klk1b7-ps-202ENSMUST00000183762 619 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
PtprtQ99M80 Eloc-206ENSMUST00000186948 641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
PtprtQ99M80 Gm8869-201ENSMUST00000195222 947 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
PtprtQ99M80 Gm31887-201ENSMUST00000197661 501 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
PtprtQ99M80 AC151968.1-201ENSMUST00000214437 568 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
PtprtQ99M80 Ccdc54-201ENSMUST00000062439 1296 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
PtprtQ99M80 Defb15-201ENSMUST00000062586 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
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PtprtQ99M80 1700071M16Rik-203ENSMUST00000169733 2504 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
PtprtQ99M80 Olfr558-201ENSMUST00000094124 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
PtprtQ99M80 Mmp10-201ENSMUST00000034488 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
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PtprtQ99M80 Bnip3l-201ENSMUST00000022634 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
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PtprtQ99M80 Perm1-201ENSMUST00000105572 3901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
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PtprtQ99M80 Stra6l-201ENSMUST00000030011 3606 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
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PtprtQ99M80 AV320801-201ENSMUST00000068340 3698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
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PtprtQ99M80 Fam53a-203ENSMUST00000065162 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
PtprtQ99M80 Vmn2r121-201ENSMUST00000094491 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
PtprtQ99M80 Ripor2-204ENSMUST00000110383 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
PtprtQ99M80 Ypel2-201ENSMUST00000018571 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
PtprtQ99M80 Col6a5-203ENSMUST00000190193 9289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
PtprtQ99M80 Xlr3a-202ENSMUST00000114524 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
PtprtQ99M80 Dennd2c-204ENSMUST00000173206 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
PtprtQ99M80 Zfp931-201ENSMUST00000108923 1372 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
PtprtQ99M80 Gm38142-201ENSMUST00000194093 3555 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
PtprtQ99M80 Gm30075-201ENSMUST00000205509 3005 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
PtprtQ99M80 Xpnpep2-201ENSMUST00000077775 3498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
PtprtQ99M80 C330018D20Rik-202ENSMUST00000139243 726 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
PtprtQ99M80 Gm24731-201ENSMUST00000158227 131 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
PtprtQ99M80 Gm8323-201ENSMUST00000168436 1201 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
PtprtQ99M80 Mir5103-201ENSMUST00000175111 79 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
PtprtQ99M80 Gm2877-201ENSMUST00000178248 1204 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
PtprtQ99M80 Gm8324-201ENSMUST00000178911 1204 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
PtprtQ99M80 Gm2871-201ENSMUST00000179984 1204 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
PtprtQ99M80 Gm43456-201ENSMUST00000202519 457 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
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