Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Gm25427-201ENSMUST00000157605 103 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Gm20615-201ENSMUST00000177503 705 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Olr1-203ENSMUST00000182784 570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Gm38133-201ENSMUST00000195109 815 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Gm43212-201ENSMUST00000198208 394 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 5830408C22Rik-203ENSMUST00000210596 326 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 1700040E09Rik-201ENSMUST00000222440 606 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Tas2r143-201ENSMUST00000057398 882 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Trim30d-201ENSMUST00000033211 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Gm20559-202ENSMUST00000201831 2993 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Arhgef3-202ENSMUST00000224981 3618 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Gm29670-201ENSMUST00000190228 2491 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Pp2d1-201ENSMUST00000056198 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Ect2l-204ENSMUST00000208948 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Gm26544-201ENSMUST00000181404 2763 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Dach2-203ENSMUST00000113379 2512 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Krt222-202ENSMUST00000103132 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Lyrm9-203ENSMUST00000147875 8035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Sspn-203ENSMUST00000111702 4415 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Disp2-201ENSMUST00000037547 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Kmo-202ENSMUST00000097458 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Ccdc83-203ENSMUST00000107221 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Gm31410-201ENSMUST00000217302 4048 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Gm28856-201ENSMUST00000189150 2828 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Vgll1-202ENSMUST00000114745 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Rps12-ps26-201ENSMUST00000117751 333 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Gm13579-201ENSMUST00000118519 517 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Gm13619-201ENSMUST00000155722 2138 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Ulbp1-201ENSMUST00000169796 1093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Gm18700-201ENSMUST00000185791 553 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Gm28958-201ENSMUST00000185864 703 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Shisa5-207ENSMUST00000197483 534 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 1700110I07Rik-201ENSMUST00000205487 726 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Gm45082-201ENSMUST00000206082 601 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Cryab-203ENSMUST00000214962 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Gm9202-201ENSMUST00000223036 437 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Gkn3-201ENSMUST00000032127 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 AW822073-201ENSMUST00000075305 555 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Gm26582-201ENSMUST00000181481 3135 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Gm12388-201ENSMUST00000119112 1887 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Gdpd4-202ENSMUST00000170049 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 AC159193.3-201ENSMUST00000221902 2622 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Coro2a-201ENSMUST00000030021 4112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 4930444G20Rik-201ENSMUST00000092672 1773 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 C730027H18Rik-202ENSMUST00000219822 3268 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Gm37906-201ENSMUST00000192050 3035 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Tmem182-201ENSMUST00000114765 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Gm36933-201ENSMUST00000194945 3071 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Pum1-205ENSMUST00000105992 5058 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Galnt5-201ENSMUST00000112616 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Glyat-201ENSMUST00000044976 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Gm12242-201ENSMUST00000118824 738 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Olfr1134-202ENSMUST00000135875 1291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Gm15735-201ENSMUST00000136187 514 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 4930412L05Rik-202ENSMUST00000146501 1241 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Gm15838-201ENSMUST00000161575 180 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Gm17217-201ENSMUST00000166613 469 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
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NipblQ6KCD5 Gm40330-201ENSMUST00000196498 669 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 AC147782.1-201ENSMUST00000219169 475 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
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NipblQ6KCD5 Olfr193-203ENSMUST00000208455 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
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NipblQ6KCD5 Gm39214-201ENSMUST00000210912 1542 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Sorbs2-220ENSMUST00000139869 4275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
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NipblQ6KCD5 4930565N06Rik-201ENSMUST00000153572 2416 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Cldn12-202ENSMUST00000115445 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Tdrd7-202ENSMUST00000107777 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 4922502D21Rik-201ENSMUST00000051283 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Gm8279-202ENSMUST00000165713 1760 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Gm5795-203ENSMUST00000171150 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Olfr716-204ENSMUST00000213367 3585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Gm29113-201ENSMUST00000185991 3432 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Selenof-202ENSMUST00000106211 1178 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Gm5406-201ENSMUST00000120054 766 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Rhox3b-ps-201ENSMUST00000121045 868 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Gm27018-201ENSMUST00000181136 225 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 1700007K09Rik-202ENSMUST00000188899 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Tti1-201ENSMUST00000029179 3830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Mbnl1-211ENSMUST00000192807 2906 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Gm31049-201ENSMUST00000201516 1302 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Aadac-201ENSMUST00000029325 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 A330032B11Rik-201ENSMUST00000180609 1919 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Rbms3-207ENSMUST00000164018 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Epg5-201ENSMUST00000044622 9672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Dclre1b-204ENSMUST00000106834 3705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
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