Protein–RNA interactions for Protein: Q5BKP2

Usp13, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 13, mousemouse

Predictions only

Length 858 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp13Q5BKP2 Gm22284-201ENSMUST00000104132 132 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Usp13Q5BKP2 Gmfg-203ENSMUST00000108292 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Usp13Q5BKP2 Gm15712-201ENSMUST00000120369 1156 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Usp13Q5BKP2 Gm12369-201ENSMUST00000121343 942 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Usp13Q5BKP2 Gm13237-201ENSMUST00000122151 635 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Usp13Q5BKP2 Gm2200-201ENSMUST00000124814 764 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Usp13Q5BKP2 Gm2117-201ENSMUST00000130478 764 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Usp13Q5BKP2 Gm2101-202ENSMUST00000131997 764 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Usp13Q5BKP2 Gm2165-203ENSMUST00000137981 764 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Usp13Q5BKP2 Gm11672-201ENSMUST00000140380 645 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Usp13Q5BKP2 Gm3669-204ENSMUST00000140946 764 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Usp13Q5BKP2 Gm13629-202ENSMUST00000152740 645 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Usp13Q5BKP2 Gm16006-201ENSMUST00000160938 566 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Usp13Q5BKP2 Tnfsf10-202ENSMUST00000174840 989 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Usp13Q5BKP2 Gm20614-201ENSMUST00000177106 632 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Usp13Q5BKP2 Gm9285-201ENSMUST00000177691 697 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Usp13Q5BKP2 Crnde-205ENSMUST00000179400 651 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Usp13Q5BKP2 Gm8245-201ENSMUST00000182434 987 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Usp13Q5BKP2 Gm8883-204ENSMUST00000189680 699 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Usp13Q5BKP2 4930566N20Rik-201ENSMUST00000195173 1199 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Usp13Q5BKP2 Gm18430-201ENSMUST00000197534 682 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Usp13Q5BKP2 Gm4751-201ENSMUST00000200620 1105 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Usp13Q5BKP2 Gm44705-201ENSMUST00000206719 339 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Usp13Q5BKP2 Gm9357-201ENSMUST00000207138 805 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Usp13Q5BKP2 Gm7706-201ENSMUST00000209946 388 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Usp13Q5BKP2 Gm20751-201ENSMUST00000210260 1270 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Usp13Q5BKP2 4930434F21Rik-201ENSMUST00000214381 742 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Usp13Q5BKP2 Gm9869-202ENSMUST00000214999 679 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Usp13Q5BKP2 Gm36278-201ENSMUST00000217030 918 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Usp13Q5BKP2 Olfr923-204ENSMUST00000219798 1068 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Usp13Q5BKP2 AC153152.2-201ENSMUST00000223165 959 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Usp13Q5BKP2 Olfr923-201ENSMUST00000051238 1068 ntAPPRIS P1 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Usp13Q5BKP2 Faddos-201ENSMUST00000097928 1053 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Usp13Q5BKP2 Zscan4d-201ENSMUST00000067210 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Usp13Q5BKP2 Ccdc82-206ENSMUST00000217444 4736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Usp13Q5BKP2 Gm13749-201ENSMUST00000133244 1432 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Usp13Q5BKP2 Fam47c-201ENSMUST00000105110 1639 ntAPPRIS P1 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Usp13Q5BKP2 Xrn1-201ENSMUST00000034981 5499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Usp13Q5BKP2 Gm10309-201ENSMUST00000095186 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Usp13Q5BKP2 Gm9048-201ENSMUST00000177744 2409 ntAPPRIS P1 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Usp13Q5BKP2 Gm9040-201ENSMUST00000177762 2409 ntAPPRIS P1 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Usp13Q5BKP2 Gm9044-201ENSMUST00000179851 2409 ntAPPRIS P1 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Usp13Q5BKP2 Gm26816-201ENSMUST00000180679 2448 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Usp13Q5BKP2 Gm9046-201ENSMUST00000218329 2409 ntAPPRIS P1 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Usp13Q5BKP2 Gm14849-201ENSMUST00000122293 2846 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Usp13Q5BKP2 Itih5l-ps-201ENSMUST00000145639 3964 ntBASIC7.59□□□□□ -1.2
Usp13Q5BKP2 Lhfpl3-201ENSMUST00000196406 2589 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
Usp13Q5BKP2 E330018M18Rik-201ENSMUST00000209455 1383 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
Usp13Q5BKP2 Fam107a-203ENSMUST00000121887 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Usp13Q5BKP2 AC154597.1-201ENSMUST00000224095 2713 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Usp13Q5BKP2 Gm38366-201ENSMUST00000193127 1934 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Usp13Q5BKP2 Angptl1-202ENSMUST00000111720 1332 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Usp13Q5BKP2 Slmap-204ENSMUST00000112330 3962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Usp13Q5BKP2 Gm11397-201ENSMUST00000050276 1862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Usp13Q5BKP2 Dpcr1-201ENSMUST00000095467 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Usp13Q5BKP2 March1-208ENSMUST00000110259 3181 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Usp13Q5BKP2 Gm10840-201ENSMUST00000100326 309 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Usp13Q5BKP2 Fabp12-203ENSMUST00000119761 548 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Usp13Q5BKP2 Gm13754-201ENSMUST00000120486 998 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Usp13Q5BKP2 Gm12451-201ENSMUST00000121636 633 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Usp13Q5BKP2 Gm12629-201ENSMUST00000145751 711 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Usp13Q5BKP2 Gm25969-201ENSMUST00000157166 132 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Usp13Q5BKP2 Gm3373-201ENSMUST00000169087 516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Usp13Q5BKP2 Gm21761-201ENSMUST00000179502 516 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Usp13Q5BKP2 Mir7082-201ENSMUST00000183526 92 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Usp13Q5BKP2 Dap-202ENSMUST00000185618 388 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Usp13Q5BKP2 Gm8883-201ENSMUST00000187594 454 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Usp13Q5BKP2 Gm28258-201ENSMUST00000189033 587 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Usp13Q5BKP2 Gm37189-201ENSMUST00000192131 298 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Usp13Q5BKP2 Gm36448-201ENSMUST00000199916 438 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Usp13Q5BKP2 Gm44162-201ENSMUST00000203543 544 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Usp13Q5BKP2 Gm17822-201ENSMUST00000204307 351 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Usp13Q5BKP2 Gm36696-201ENSMUST00000205418 438 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Usp13Q5BKP2 Gm45335-201ENSMUST00000210618 401 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Usp13Q5BKP2 Gm2774-201ENSMUST00000213650 1165 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Usp13Q5BKP2 9230112D13Rik-201ENSMUST00000022325 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Usp13Q5BKP2 AC163667.1-201ENSMUST00000225201 1289 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Usp13Q5BKP2 Olfr424-201ENSMUST00000053941 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Usp13Q5BKP2 Olfr1440-201ENSMUST00000054567 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Usp13Q5BKP2 Olfr275-201ENSMUST00000095085 960 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Usp13Q5BKP2 Itch-202ENSMUST00000109685 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Usp13Q5BKP2 Gnb1-208ENSMUST00000176637 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Usp13Q5BKP2 3732407C23Rik-201ENSMUST00000222770 3540 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Usp13Q5BKP2 Gm45786-201ENSMUST00000213021 2278 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Usp13Q5BKP2 Olfr60-205ENSMUST00000216027 3300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Usp13Q5BKP2 Iqch-201ENSMUST00000042322 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Usp13Q5BKP2 Gm42930-201ENSMUST00000200872 3260 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Usp13Q5BKP2 Olfr1348-210ENSMUST00000214383 2582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Usp13Q5BKP2 Tlr4-202ENSMUST00000107365 1866 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Usp13Q5BKP2 Gm26873-201ENSMUST00000181390 2368 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp13Q5BKP2 Gm43029-201ENSMUST00000201829 1535 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp13Q5BKP2 Asap1-206ENSMUST00000175799 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp13Q5BKP2 Gm29194-201ENSMUST00000189250 2167 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp13Q5BKP2 Mdm4-202ENSMUST00000067429 3490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp13Q5BKP2 2900064K03Rik-201ENSMUST00000196567 3113 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp13Q5BKP2 Gm40649-201ENSMUST00000219795 1457 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp13Q5BKP2 AC130831.1-201ENSMUST00000224546 1474 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp13Q5BKP2 Cdc42bpa-204ENSMUST00000111117 9161 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp13Q5BKP2 Gm14548-201ENSMUST00000070639 2128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp13Q5BKP2 A230028O05Rik-201ENSMUST00000181655 2793 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.9 ms