Protein–RNA interactions for Protein: Q3US17

Znf48, Zinc finger protein 48, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf48Q3US17 Slc17a6-201ENSMUST00000032710 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Znf48Q3US17 Tyrp1-202ENSMUST00000102831 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Znf48Q3US17 Il1rl1-203ENSMUST00000173514 2661 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Znf48Q3US17 Gm42679-201ENSMUST00000197086 2906 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Znf48Q3US17 Lrrc66-201ENSMUST00000087177 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Znf48Q3US17 Myt1-202ENSMUST00000108756 5509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Znf48Q3US17 Trpc4-201ENSMUST00000029311 3473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Znf48Q3US17 Gm37924-201ENSMUST00000195470 3647 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Znf48Q3US17 Gm26888-201ENSMUST00000181119 3683 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Znf48Q3US17 Myo3b-203ENSMUST00000112243 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Znf48Q3US17 Gm6096-201ENSMUST00000105172 456 ntAPPRIS P1 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Znf48Q3US17 Slamf7-201ENSMUST00000111276 1082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Znf48Q3US17 Rhox3e-202ENSMUST00000115198 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Znf48Q3US17 Rhox3a-201ENSMUST00000115203 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Znf48Q3US17 Gm7910-201ENSMUST00000117896 835 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Znf48Q3US17 Gm15753-201ENSMUST00000119241 1062 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Znf48Q3US17 Gm5760-201ENSMUST00000119692 1002 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Znf48Q3US17 Gm11533-201ENSMUST00000120287 477 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Znf48Q3US17 Gm11522-201ENSMUST00000120533 176 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Znf48Q3US17 Gm16057-201ENSMUST00000120811 759 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Znf48Q3US17 4930503B20Rik-203ENSMUST00000149825 970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Znf48Q3US17 Gm23352-201ENSMUST00000158428 64 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Znf48Q3US17 Gm22014-201ENSMUST00000158785 290 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Znf48Q3US17 4930519F09Rik-202ENSMUST00000163084 1111 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Znf48Q3US17 Paip1-206ENSMUST00000173627 1233 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Znf48Q3US17 Vmn1r-ps149-201ENSMUST00000176997 183 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Znf48Q3US17 Gm10591-201ENSMUST00000178168 402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Znf48Q3US17 Gm21815-201ENSMUST00000178213 664 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Znf48Q3US17 Ccl21b-202ENSMUST00000178864 402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Znf48Q3US17 Rps16-ps3-201ENSMUST00000179126 441 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Znf48Q3US17 Tmem147os-201ENSMUST00000180820 1276 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Znf48Q3US17 Gm9169-201ENSMUST00000182930 536 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Znf48Q3US17 Gm26980-201ENSMUST00000183321 395 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Znf48Q3US17 Mir8114-201ENSMUST00000183582 111 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Znf48Q3US17 Gm10637-201ENSMUST00000183718 828 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Znf48Q3US17 Mir6415-201ENSMUST00000184064 100 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Znf48Q3US17 Gm21721-202ENSMUST00000189253 1225 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Znf48Q3US17 Gm28239-201ENSMUST00000190225 447 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Znf48Q3US17 Gm2287-201ENSMUST00000197417 1084 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Znf48Q3US17 Scn8a-207ENSMUST00000200959 587 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Znf48Q3US17 Gm43934-201ENSMUST00000205095 388 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Znf48Q3US17 Gm45228-201ENSMUST00000206585 352 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Znf48Q3US17 Rtp4-203ENSMUST00000210901 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Znf48Q3US17 AC161520.1-201ENSMUST00000210954 939 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Znf48Q3US17 AC134607.2-201ENSMUST00000213983 231 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Znf48Q3US17 Gm3565-201ENSMUST00000222670 609 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Znf48Q3US17 Gm36262-201ENSMUST00000223274 499 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Znf48Q3US17 AC158511.1-201ENSMUST00000223622 764 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Znf48Q3US17 CT025598.1-201ENSMUST00000225140 427 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Znf48Q3US17 AC123917.1-201ENSMUST00000228063 1048 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Znf48Q3US17 Ocm-201ENSMUST00000031622 658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Znf48Q3US17 Prl2c1-201ENSMUST00000054932 681 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Znf48Q3US17 Fam136b-ps-201ENSMUST00000068987 412 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Znf48Q3US17 Olfr664-201ENSMUST00000072887 966 ntAPPRIS P5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Znf48Q3US17 Olfr342-201ENSMUST00000074192 1054 ntAPPRIS P1 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Znf48Q3US17 Olfr382-201ENSMUST00000092921 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Znf48Q3US17 Olfr1305-201ENSMUST00000099608 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Znf48Q3US17 Olfr1046-201ENSMUST00000099902 951 ntAPPRIS P1 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Znf48Q3US17 D930007P13Rik-201ENSMUST00000181306 1324 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Znf48Q3US17 Tex47-202ENSMUST00000159546 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Znf48Q3US17 Eci2-213ENSMUST00000178421 1414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Znf48Q3US17 Lrrc23-201ENSMUST00000032218 1470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Znf48Q3US17 E430024I08Rik-202ENSMUST00000220632 1513 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Znf48Q3US17 Cyp2c50-201ENSMUST00000068094 1643 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Znf48Q3US17 Teddm2-201ENSMUST00000059607 1654 ntAPPRIS P2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Znf48Q3US17 Lipc-204ENSMUST00000216798 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Znf48Q3US17 Gm8366-201ENSMUST00000118751 1769 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Znf48Q3US17 Alcam-207ENSMUST00000170035 1917 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Znf48Q3US17 Havcr1-203ENSMUST00000109223 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Znf48Q3US17 BC080695-202ENSMUST00000105774 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Znf48Q3US17 Gm19136-201ENSMUST00000190706 2067 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Znf48Q3US17 Golgb1-202ENSMUST00000039855 10847 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Znf48Q3US17 Gm28839-201ENSMUST00000189579 2171 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Znf48Q3US17 Rims1-207ENSMUST00000164877 2294 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Znf48Q3US17 Kbtbd4-201ENSMUST00000090682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Znf48Q3US17 Pcdhb15-201ENSMUST00000050034 2801 ntAPPRIS P1 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Znf48Q3US17 Tm4sf1-202ENSMUST00000171384 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Znf48Q3US17 C5ar2-201ENSMUST00000098792 3429 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Znf48Q3US17 Slc5a7-201ENSMUST00000095712 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Znf48Q3US17 Taf1-202ENSMUST00000118878 7210 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Znf48Q3US17 Pfkfb3-214ENSMUST00000179584 4756 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Znf48Q3US17 Abcb1b-201ENSMUST00000009058 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Znf48Q3US17 Prr5l-209ENSMUST00000163762 4159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Znf48Q3US17 Nat10-201ENSMUST00000028608 3879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Znf48Q3US17 Zfp14-202ENSMUST00000207072 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Znf48Q3US17 Dpcr1-201ENSMUST00000095467 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Znf48Q3US17 C130093G08Rik-201ENSMUST00000202489 2226 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Znf48Q3US17 Gm26802-201ENSMUST00000181066 2144 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Znf48Q3US17 Gm3867-202ENSMUST00000181639 2007 ntTSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Znf48Q3US17 Olfr398-202ENSMUST00000117510 5135 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Znf48Q3US17 Gm5743-202ENSMUST00000212004 1647 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Znf48Q3US17 Nr5a2-201ENSMUST00000027649 4733 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Znf48Q3US17 Vma21-203ENSMUST00000114577 4652 ntTSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Znf48Q3US17 Psg19-203ENSMUST00000182853 1518 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Znf48Q3US17 Cts7-203ENSMUST00000224986 1349 ntAPPRIS P1 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Znf48Q3US17 Rnf125-201ENSMUST00000050004 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Znf48Q3US17 Lypd8-202ENSMUST00000108826 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Znf48Q3US17 Gm14401-203ENSMUST00000108970 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Znf48Q3US17 Gm15010-201ENSMUST00000117153 407 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Znf48Q3US17 Gm15576-201ENSMUST00000117806 583 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms