Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 Gm3460-202ENSMUST00000178927 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Trafd1Q3UDK1 Gm21103-203ENSMUST00000179042 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Trafd1Q3UDK1 Gm8159-203ENSMUST00000179231 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Trafd1Q3UDK1 Gm3029-202ENSMUST00000179327 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Trafd1Q3UDK1 Gm27178-201ENSMUST00000184962 340 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Trafd1Q3UDK1 Gm29099-201ENSMUST00000187370 760 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Trafd1Q3UDK1 1700020G17Rik-203ENSMUST00000191286 723 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Trafd1Q3UDK1 Gm4525-201ENSMUST00000198831 254 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Trafd1Q3UDK1 Gm43849-201ENSMUST00000201086 215 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Trafd1Q3UDK1 Zfp799-203ENSMUST00000201876 632 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Trafd1Q3UDK1 Lalba-201ENSMUST00000023726 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Trafd1Q3UDK1 Olfr410-201ENSMUST00000052254 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Trafd1Q3UDK1 Cd48-202ENSMUST00000068584 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Trafd1Q3UDK1 Krcc1-202ENSMUST00000168700 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Trafd1Q3UDK1 Gm45457-201ENSMUST00000209931 3089 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Trafd1Q3UDK1 4930518I15Rik-201ENSMUST00000099141 1331 ntAPPRIS P1 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Trafd1Q3UDK1 Lilra6-204ENSMUST00000206077 2281 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Trafd1Q3UDK1 Slamf7-202ENSMUST00000192024 1361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Trafd1Q3UDK1 RMST_1.1-210ENSMUST00000219606 2891 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Trafd1Q3UDK1 Crtam-203ENSMUST00000180872 4443 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Trafd1Q3UDK1 Sorbs2os-201ENSMUST00000135116 2474 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Trafd1Q3UDK1 Clec2g-201ENSMUST00000000254 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Trafd1Q3UDK1 Gm30075-201ENSMUST00000205509 3005 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Trafd1Q3UDK1 Tpx2-207ENSMUST00000178997 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Trafd1Q3UDK1 Xpnpep3-203ENSMUST00000163754 5383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Trafd1Q3UDK1 Slc17a3-204ENSMUST00000166467 4336 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Trafd1Q3UDK1 D830026I12Rik-203ENSMUST00000151170 1607 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Trafd1Q3UDK1 Gm28431-201ENSMUST00000185592 2166 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Trafd1Q3UDK1 Gm28681-201ENSMUST00000187387 2166 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Trafd1Q3UDK1 Ralgapa2-205ENSMUST00000131824 5624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Trafd1Q3UDK1 Grik2-202ENSMUST00000105484 3992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Trafd1Q3UDK1 Klf8-202ENSMUST00000112574 4752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Trafd1Q3UDK1 Vmn1r90-209ENSMUST00000227855 7362 ntAPPRIS P2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Trafd1Q3UDK1 Ugt2b38-201ENSMUST00000072818 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Trafd1Q3UDK1 Ighv1-19-201ENSMUST00000103505 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Trafd1Q3UDK1 Gm25760-201ENSMUST00000103989 132 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Trafd1Q3UDK1 Gm12375-201ENSMUST00000119331 921 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Trafd1Q3UDK1 Gm13900-201ENSMUST00000119402 498 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Trafd1Q3UDK1 Gm13462-201ENSMUST00000121472 961 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Trafd1Q3UDK1 Gm6451-201ENSMUST00000121488 717 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Trafd1Q3UDK1 Speer3-201ENSMUST00000124677 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Trafd1Q3UDK1 Gm16984-201ENSMUST00000130003 982 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Trafd1Q3UDK1 2610204G07Rik-201ENSMUST00000131215 992 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Trafd1Q3UDK1 4933411O13Rik-203ENSMUST00000146849 607 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Trafd1Q3UDK1 Gm24781-201ENSMUST00000157636 117 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Trafd1Q3UDK1 Gm22533-201ENSMUST00000158821 274 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Trafd1Q3UDK1 Gm2619-202ENSMUST00000166777 651 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Trafd1Q3UDK1 Platr5-202ENSMUST00000181016 479 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Trafd1Q3UDK1 Gm28502-201ENSMUST00000189781 476 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Trafd1Q3UDK1 Gm29508-202ENSMUST00000191414 710 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Trafd1Q3UDK1 1700034J04Rik-201ENSMUST00000192736 750 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Trafd1Q3UDK1 Gm43595-201ENSMUST00000196464 1071 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Trafd1Q3UDK1 Gm2860-201ENSMUST00000199226 707 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Trafd1Q3UDK1 Gm8479-201ENSMUST00000203825 718 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Trafd1Q3UDK1 Pde6h-203ENSMUST00000204382 211 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Trafd1Q3UDK1 Rps12-ps4-201ENSMUST00000208689 397 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Trafd1Q3UDK1 Gm45345-201ENSMUST00000211427 555 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Trafd1Q3UDK1 CT030238.3-201ENSMUST00000227352 875 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Trafd1Q3UDK1 AC132833.4-201ENSMUST00000228313 203 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Trafd1Q3UDK1 Olfr862-201ENSMUST00000073765 1035 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Trafd1Q3UDK1 Pde7a-201ENSMUST00000091314 4454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Trafd1Q3UDK1 Zfp935-204ENSMUST00000223247 1949 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Trafd1Q3UDK1 Ptbp3-212ENSMUST00000174586 6640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
Trafd1Q3UDK1 Csn2-206ENSMUST00000197422 1329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Trafd1Q3UDK1 Gm45657-201ENSMUST00000211318 1349 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
Trafd1Q3UDK1 Lrtm1-201ENSMUST00000055662 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Trafd1Q3UDK1 B130024G19Rik-203ENSMUST00000190320 5451 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
Trafd1Q3UDK1 1700015I17Rik-201ENSMUST00000209585 2099 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
Trafd1Q3UDK1 Prkag2os2-201ENSMUST00000123610 1432 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Trafd1Q3UDK1 Gm21663-201ENSMUST00000196214 2864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
Trafd1Q3UDK1 Gm20655-202ENSMUST00000181428 2946 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Trafd1Q3UDK1 Gm17529-201ENSMUST00000180738 3093 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Trafd1Q3UDK1 Olfr1451-202ENSMUST00000207997 1698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.35
Trafd1Q3UDK1 Ndst3-201ENSMUST00000029602 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Trafd1Q3UDK1 Gm37914-201ENSMUST00000195317 2679 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Trafd1Q3UDK1 Ankrd17-205ENSMUST00000197021 8067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Trafd1Q3UDK1 Sirpb1c-202ENSMUST00000108349 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Trafd1Q3UDK1 Adgrf5-206ENSMUST00000226087 4954 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Trafd1Q3UDK1 AC120347.2-201ENSMUST00000222224 2015 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Trafd1Q3UDK1 Gm45516-201ENSMUST00000211588 4182 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Trafd1Q3UDK1 Olfr720-202ENSMUST00000206298 4437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Trafd1Q3UDK1 Nat8f2-201ENSMUST00000045008 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Trafd1Q3UDK1 Rbms3-205ENSMUST00000111772 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Trafd1Q3UDK1 Zfp719-201ENSMUST00000058104 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Trafd1Q3UDK1 Alkbh8-202ENSMUST00000165105 2256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Trafd1Q3UDK1 AC152946.1-201ENSMUST00000218446 3474 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Trafd1Q3UDK1 Gm12299-201ENSMUST00000138819 2327 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Trafd1Q3UDK1 Trav8d-1-201ENSMUST00000103580 400 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Trafd1Q3UDK1 Gm25379-201ENSMUST00000104338 114 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Trafd1Q3UDK1 Gm7821-201ENSMUST00000117111 788 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Trafd1Q3UDK1 Clec4n-203ENSMUST00000117130 1136 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Trafd1Q3UDK1 Gm13400-201ENSMUST00000117436 380 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Trafd1Q3UDK1 Gm24680-201ENSMUST00000158759 126 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Trafd1Q3UDK1 Gm21970-201ENSMUST00000160764 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Trafd1Q3UDK1 1810053B23Rik-202ENSMUST00000185364 590 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Trafd1Q3UDK1 Gm29605-201ENSMUST00000190800 292 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Trafd1Q3UDK1 Gm7412-201ENSMUST00000191692 605 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Trafd1Q3UDK1 Sox2ot-214ENSMUST00000198758 1286 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Trafd1Q3UDK1 Gm42963-201ENSMUST00000202943 1217 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Trafd1Q3UDK1 Gm17997-201ENSMUST00000211801 840 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.7 ms