Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 Cfap221-202ENSMUST00000174370 2871 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Ctdnep1Q3TP92 Gm15348-201ENSMUST00000151188 3655 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Ctdnep1Q3TP92 Olfr325-202ENSMUST00000203418 1649 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Ctdnep1Q3TP92 7420700N18Rik-201ENSMUST00000209524 1644 ntTSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Ctdnep1Q3TP92 Sox6-210ENSMUST00000206034 8668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Ctdnep1Q3TP92 A730017L22Rik-201ENSMUST00000128176 3055 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Ctdnep1Q3TP92 Gm18701-201ENSMUST00000188281 1536 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Ctdnep1Q3TP92 Mum1l1-202ENSMUST00000113042 4182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Ctdnep1Q3TP92 Vmn2r84-201ENSMUST00000094502 3034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Ctdnep1Q3TP92 Obox3-201ENSMUST00000086122 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Ctdnep1Q3TP92 Pum1-202ENSMUST00000097862 3991 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Ctdnep1Q3TP92 4930568G15Rik-201ENSMUST00000193317 3218 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Ctdnep1Q3TP92 Mgam-202ENSMUST00000201148 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Ctdnep1Q3TP92 Mgam-201ENSMUST00000071535 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Ctdnep1Q3TP92 Olfr645-201ENSMUST00000057104 3677 ntAPPRIS P1 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Ctdnep1Q3TP92 Rab3b-202ENSMUST00000106650 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Ctdnep1Q3TP92 Gm8177-201ENSMUST00000181591 1336 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Ctdnep1Q3TP92 Gm45657-201ENSMUST00000211318 1349 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Ctdnep1Q3TP92 Gm136-201ENSMUST00000095129 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Ctdnep1Q3TP92 Gsdmc4-201ENSMUST00000063530 1988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Ctdnep1Q3TP92 Gm10568-201ENSMUST00000193244 1634 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Ctdnep1Q3TP92 Crb1-204ENSMUST00000198445 6135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Ctdnep1Q3TP92 Gmfg-203ENSMUST00000108292 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Ctdnep1Q3TP92 Sirpb1c-205ENSMUST00000108354 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Ctdnep1Q3TP92 Tex35-203ENSMUST00000119526 679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Ctdnep1Q3TP92 Mgst1-204ENSMUST00000120302 559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Ctdnep1Q3TP92 Gm12160-201ENSMUST00000146372 342 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Ctdnep1Q3TP92 Gm14764-201ENSMUST00000147130 313 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Ctdnep1Q3TP92 Gm25281-201ENSMUST00000157270 104 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Ctdnep1Q3TP92 Mir6908-201ENSMUST00000184056 63 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Ctdnep1Q3TP92 Gm27295-201ENSMUST00000184264 153 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Ctdnep1Q3TP92 Cfhr2-202ENSMUST00000194186 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Ctdnep1Q3TP92 Gm20128-201ENSMUST00000196189 417 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Ctdnep1Q3TP92 Olfr451-ps1-201ENSMUST00000205127 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Ctdnep1Q3TP92 Gm6681-201ENSMUST00000205215 607 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Ctdnep1Q3TP92 Gm2225-201ENSMUST00000209570 377 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Ctdnep1Q3TP92 Tmem45b-204ENSMUST00000217007 783 ntTSL 2 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Ctdnep1Q3TP92 AC154806.1-203ENSMUST00000227370 1032 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Ctdnep1Q3TP92 AC115735.5-201ENSMUST00000228386 397 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Ctdnep1Q3TP92 Ly6g-201ENSMUST00000023246 336 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Ctdnep1Q3TP92 Olfr1076-201ENSMUST00000076263 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Ctdnep1Q3TP92 Gm28392-201ENSMUST00000077630 393 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Ctdnep1Q3TP92 Gm43707-201ENSMUST00000196451 3187 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Ctdnep1Q3TP92 Gm12258-202ENSMUST00000139337 4100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Ctdnep1Q3TP92 Triml1-201ENSMUST00000059692 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Ctdnep1Q3TP92 2610021A01Rik-201ENSMUST00000163475 4004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Ctdnep1Q3TP92 CT009480.2-201ENSMUST00000225152 3369 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Ctdnep1Q3TP92 Gabrb3-202ENSMUST00000085240 5712 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Ctdnep1Q3TP92 Plch1-202ENSMUST00000059973 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Ctdnep1Q3TP92 4933427D14Rik-201ENSMUST00000108505 1495 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Ctdnep1Q3TP92 Elovl2-201ENSMUST00000021793 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Ctdnep1Q3TP92 Gm37945-201ENSMUST00000192536 4367 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Ctdnep1Q3TP92 Noc3l-201ENSMUST00000025963 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Ctdnep1Q3TP92 Olfr530-202ENSMUST00000216727 1958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Ctdnep1Q3TP92 Rbms3-205ENSMUST00000111772 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Ctdnep1Q3TP92 Tmem167b-202ENSMUST00000106622 2752 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Ctdnep1Q3TP92 Aph1c-202ENSMUST00000169282 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Ctdnep1Q3TP92 Gm15475-201ENSMUST00000137673 3757 ntTSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Ctdnep1Q3TP92 Gm20655-202ENSMUST00000181428 2946 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Ctdnep1Q3TP92 Frmpd4-202ENSMUST00000112146 8153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Ctdnep1Q3TP92 Pcdh19-203ENSMUST00000167944 8407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Ctdnep1Q3TP92 Kpna2-201ENSMUST00000018506 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Ctdnep1Q3TP92 Nrg1-203ENSMUST00000207470 5415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Ctdnep1Q3TP92 Copa-201ENSMUST00000027833 4351 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Ctdnep1Q3TP92 Cacna1e-203ENSMUST00000187541 14921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Ctdnep1Q3TP92 Gm25093-201ENSMUST00000103993 132 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Ctdnep1Q3TP92 Gm16044-201ENSMUST00000118475 450 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Ctdnep1Q3TP92 Gm13455-201ENSMUST00000118767 517 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Ctdnep1Q3TP92 Gm16330-201ENSMUST00000128324 297 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Ctdnep1Q3TP92 Gm12827-201ENSMUST00000132690 660 ntTSL 3 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Ctdnep1Q3TP92 Gm11545-201ENSMUST00000146507 375 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Ctdnep1Q3TP92 Gm25057-201ENSMUST00000157366 88 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Ctdnep1Q3TP92 Gm23756-201ENSMUST00000157582 114 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Ctdnep1Q3TP92 Gm23071-201ENSMUST00000158242 115 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Ctdnep1Q3TP92 Gm23259-201ENSMUST00000158318 303 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Ctdnep1Q3TP92 Fabp12-204ENSMUST00000172126 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Ctdnep1Q3TP92 1700022N22Rik-201ENSMUST00000180932 709 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Ctdnep1Q3TP92 Mir7005-201ENSMUST00000185089 69 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Ctdnep1Q3TP92 Gm9504-201ENSMUST00000196322 468 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Ctdnep1Q3TP92 Gm43400-201ENSMUST00000197294 1254 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Ctdnep1Q3TP92 Gm7463-201ENSMUST00000201541 547 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Ctdnep1Q3TP92 Fxyd4-204ENSMUST00000203433 670 ntTSL 3 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Ctdnep1Q3TP92 Gm9367-201ENSMUST00000205703 546 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Ctdnep1Q3TP92 AC102582.2-201ENSMUST00000214658 1137 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Ctdnep1Q3TP92 Akr1c13-201ENSMUST00000021634 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Ctdnep1Q3TP92 AC123917.1-201ENSMUST00000228063 1048 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Ctdnep1Q3TP92 Fxyd4-201ENSMUST00000005114 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Ctdnep1Q3TP92 Olfr49-201ENSMUST00000059996 1030 ntAPPRIS P1 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Ctdnep1Q3TP92 Gm10037-201ENSMUST00000060609 315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Ctdnep1Q3TP92 Pifo-202ENSMUST00000066319 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Ctdnep1Q3TP92 Olfr66-201ENSMUST00000079117 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Ctdnep1Q3TP92 Gm10160-201ENSMUST00000085094 201 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Ctdnep1Q3TP92 Mdm4-202ENSMUST00000067429 3490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Ctdnep1Q3TP92 Cnga1-201ENSMUST00000087213 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Ctdnep1Q3TP92 Sirpb1c-202ENSMUST00000108349 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Ctdnep1Q3TP92 Pde1a-202ENSMUST00000102651 1673 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Ctdnep1Q3TP92 Pde1a-201ENSMUST00000090756 1661 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Ctdnep1Q3TP92 Arl5b-201ENSMUST00000017562 6933 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Ctdnep1Q3TP92 Tek-202ENSMUST00000073939 4549 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Ctdnep1Q3TP92 Slc35a5-201ENSMUST00000023344 4233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.1 ms